Ponovno sekvenciranje cijelog genoma bakterija i gljivica
Projekti ponovnog sekvenciranja cijelog genoma bakterija i gljivica ključni su za unapređenje mikrobne genomike omogućavajući dovršavanje i poređenje mikrobnih genoma. Ovo olakšava inženjering fermentacije, optimizaciju industrijskih procesa i istraživanje puteva sekundarnog metabolizma. Nadalje, ponovno sekvenciranje gljivica i bakterija je ključno za razumijevanje prilagođavanja okoliša, optimizaciju sojeva i otkrivanje dinamike genetske evolucije, sa širokim implikacijama u medicini, poljoprivredi i znanosti o okolišu.
Prednosti usluge
●Bioinformatička analiza uključuje varijantno pozivanje:Pružanje funkcionalnog uvida u ponovo sekvencirane genome.
● Opsežna stručnost: Sa hiljadama projekata ponovnog sekvenciranja mikroba koji se provode godišnje, donosimo više od decenije iskustva, visoko kvalifikovan tim za analizu, sveobuhvatan sadržaj i odličnu podršku nakon prodaje.
●Postprodajna podrška:Naša posvećenost se proteže i dalje od završetka projekta uz period od 3 mjeseca nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije pitanja i odgovora kako bismo odgovorili na sva pitanja u vezi s rezultatima.
Specifikacije usluge
| Platforma za sekvenciranje | Strategija sekvenciranja | Podaci se preporučuju | Kontrola kvaliteta |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Dubina 100x | Q30≥85% |
Zahtjevi za uzorke
| Koncentracija (ng/µL) | Ukupna količina (ng) | Volumen (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterije: ≥1x107 ćelije
Jednoćelijske gljive: ≥5x106-1x107 ćelije
Makro gljive: ≥4g
Tok rada usluge
Isporuka uzorka
Izgradnja biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
- Kontrola kvaliteta podataka sekvenciranja
- Poravnanje prema referentnom genomu
- Pozivanje varijante: SNP i InDel
- Variant Annotation
Pozivanje varijante: SNP tipovi
Pozivanje varijante: InDel raspodjela dužine
Istražite napredak koji omogućava BMKGene-ove usluge ponovnog sekvenciranja mikrobnog genoma kroz odabranu kolekciju publikacija.
Jia, Y. et al. (2023) 'Kombiniranje transkriptoma i ponovnog sekvenciranja cijelog genoma za skriniranje gena otpornosti na bolesti za pšeničnu patuljastu strnadu',Međunarodni časopis za molekularne nauke, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Metabolizam glukoze kontroliran ampicilinom manipulira prijelazom s tolerancije na otpornost bakterija',Science Advances, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., haloalkalifilna bakterija izolirana iz soda jezera u Autonomnoj regiji Unutrašnja Mongolija, Kina', Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, str. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. i Wang, G.-H. (2024) 'Sekvenca genoma Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, izolovanog iz Nasonia vitripennis',Najave mikrobioloških resursa. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
