De novo bakterijsko montaža genoma
Pružamo kompletnu uslugu montažne montaže bakterijske genome, garantujući 0 praznine. To je moguće integrirajući tehnologije dugotrajnog sekvenciranja, poput Nanopore i Pacbio za montažu i kratkotrajnu sekvenciranje sa iluminom za validaciju i korekciju greške u vezi sa ovjesom. Naša usluga pruža kompletan bioinformatički tijek rada iz montaže, funkcionalne napomene i napredne bioinformatičke analize, ispunjavajući posebne ciljeve istraživanja. Ova usluga omogućava razvoj preciznih referentnih genoma za različite genetske i genomske studije. Uz to, čini osnovu za aplikacije kao što su optimizacija naprezanja, genetsko inženjerstvo i razvoj mikrobne tehnologije, osiguravajući pouzdane i genomičke podatke bez jaza za unapređenje naučnih uvida i biotehnoloških inovacija.
Servisne karakteristike
● sa dvije moguće opcije za odabir iz ovisno o željenom stupnju potpunosti genoma.
● Nacrt opcije genoma: Skraćeno sekvenciranje sa iluminom Novaseq PE150.
● Kompletan 0 GAP genom.
● Dugo čitav sekvenciranje na Nanopore Prometion 48 ili Pacbio Revionu za montažu gena.
● Skraćeno sekvenciranje na ilumini Novaseq za provjeru genoma i korekciju grešaka (Nanopore) ili za generiranje nacrta genoma.
Prednosti usluge
●Zagarantovano genome gnoja: To je zbog integracije illinske sekvenciranje sa dugotrajnim redoslijedom (Nanopore ili Pacbio).
●Kompletan tijek bioinformatike:To uključuje genomesku skupštinu i predviđanje višestrukih genskih elemenata, funkcionalne napomene gena i genoma vizualizacije poput cirkosa.
●Opsežna ekspertiza: Sa više od 20.000 sklopljenih mikrobnih genoma, BMKGENE donosi preko decenije iskustva, visoko kvalificiranog tima za analizu, sveobuhvatan sadržaj i odličnu podršku nakon prodaje.
●Podrška za post-prodaja:Naša posvećenost se pruža izvan završetka projekta sa tromjesečnim periodom usluge nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekata, rešavanje problema i rješavanje problema i pitanja za rješavanje bilo kakvih upita u vezi s rezultatima.
●Dostupne su višestruke strategije sekvenciranja:Za različite istraživačke ciljeve i zahtjeve potpunosti genoma.
Servisne specifikacije
| Servis | Strategija sekvenciranja |
| Nacrt genoma | Illumina PE150 100x |
| 0 GAP GENOME | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (neobavezno) |
Uzorni zahtjevi:
| Koncentracija (NG / μl) | Ukupni iznos (μg) | Volumen (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakterije: ≥3.5x1010 ćelije
Servisni protok rada
Dostava uzoraka
Građevinarstvo biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
● Sekviranje kontrole kvaliteta podataka
● Genome montaža
● Analiza komponente genoma: Predviđanje CD-ova i više genomičkih elemenata
● Funkcionalna napomena sa više općih baza podataka (GO, Kegg, itd.) I napredne baze podataka (kartica, VFDB, itd.)
● vizualizacija genoma
Genome pružamo u lako dostupnom Fasta formatu i datoteku za napomenu genu (GFF).
Obloživanje gena - Idi
Napomena gena - Cane ugljikohidrati
Vizualizacija genoma - Circos plac
Istražite napredak koji su omogućili BMKGEne-ove bakterijske montažne usluge montaže kroz kustornu kolekciju publikacija.
Dai, W. i dr. (2023) 'Otkrivanje bakterije uniformisa F18-22 kao sigurna i nova probiotska bakterija za liječenje ulceroznog kolitisa iz zdrave ljudske kostone',Međunarodni časopis molekularnih nauka, 24 (19), str. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / s1.
Kang, TUŽILAC WHITING - PITANJE: Et al. (2021) 'Protej-multidra-otporan na protej Mirabilis Isolati koji nose Blaoxa-1 i Blandm-1 iz divljih životinja u Kini: povećanje javnog zdravstvenog rizika',Integrativna zoologija, 16 (6), str. 798-809. Doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, TT i sur. (2017) 'Kompletan redoslijed genoma endofita Bacillus Flexus KLBMP 4941 otkriva svoj mehanizam za promociju rasta biljaka i genetsku osnovu za toleranciju soli',Časopis za biotehnologiju, 260, str. 38-41. Doi: 10.1016 / j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. i dr. (2021) 'Otpor višestrukim replikama Plasmidi Klebsiella posreduje opsežno širenje antimikrobnih gena',Granice u mikrobiologiji, 12, str. 754931. DOI: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / Bibtex.
