16S / 18S / Njegova amplikonska sekvenciranja-ngs
Servisne karakteristike
● Platforma za sekvenciranje: Illumina Novaseq.
● Pojačanje kratkih regija 16-ih, 18-ih i njegovih, među ostalim ciljevima pojačanja.
● Fleksibilni izbor Amplikona.
● Prethodno iskustvo projekta sa ciljevima više pojačanja.
Prednosti usluge
●Izolacija bez izolacije:Brza identifikacija mikrobnog sastava u uzorcima zaštite okoliša.
●Visoka rezolucija: U nisko obilnim komponentama u uzorcima zaštite okoliša.
●Široko primenljivo: Različite studije mikrobne zajednice.
●Sveobuhvatna bioinformatička analiza: Najnoviji qiime2 paket (kvantitativni uvid u mikroblogiju mikrologije) sa raznolikim analizama u pogledu baze podataka, napomene, Otu / ASV.
●Opsežna ekspertiza.
Servisne specifikacije
| Biblioteka | Strategija sekvenciranja | Preporučeni podaci |
| Amplikofon | Illumina PE250 | Oznake 50/100 / 300k (čitanje parova) |
Službeni zahtevi
| Koncentracija (NG / μl) | Ukupni iznos (NG) | Volumen (μl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Tlo / mulj: 1-2G
● Crijevni sadržaj-životinja: 0,5-2G
● Crijevni sadržaji - Insekt: 0,1-0,25g
● Postrojenje postrojenja (obogaćeni sediment): 0,1-0,5g
● Fermentacijski juha obogaćeni sediment): 0,1-0,5g
● feece (velike životinje): 0,5-2G
● fekali (miš): 3-5Držains
● Plućna alveolarna lavagena tekućina: Filter papir
● Vaginalni bris: 5-6 brisa
● Snitaj / genitalni bris / saliva / oralno meko tkivo / Pharyngeal Swab / rektalni bris: 2-3 brisa
● Površinski mikroorganizmi: Filter papir
● Vodeni / vazduh / Biofilm: Filter Paper
● Endofiti: 1-2G
● Stomatološka ploča: 0,5-1G
Servisni protok rada
Dostava uzoraka
Građevinarstvo biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
- Kontrola kvalitete neobrađene podatke
- Otu klasteriranje / buka (ASV)
- Otu Annotacija
- Analiza alfa raznolikosti: višestruki indeksi, uključujući Shannon, Simpson i Ace.
- Analiza beta raznolikosti
- Interkoup analiza
- Analiza korelacije: između faktora okoliša i sastava i raznolikosti
- 16S Funkcionalni predviđanje gena
Histogram taksonomske distribucije
Kartu za taxonomsku izobiljuje topline
Analiza alfa raznolikosti: krivulja rijetkosti
Analiza beta raznolikosti: NMDS
Analiza međugradnje: Otkriće LEFSE Biomarker
Istražite napredak koji su omogućili BMKGENE-ove Amplikonske sekvencijske usluge sa iluminom kroz kustornu kolekciju publikacija.
Dong, C. i dr. (2022) 'Montaža, jezgra mikrobiota i funkcija mikrobiota rizosfere i kora u Eucumia ulmoides', granice u mikrobiologiji, 13. doi: 10.3389 / fmicb.2022.855317 / puni.
Li, Y. i sur. (2023) 'Sintetička bakterijska konzorcijacija za tretman bakterijske vaginoze izazvane vaginalisom u miševima' Microbiome, 11 (1), str. 1-14. Doi: 10.1186 / s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. i Liu, H. (2022) 'Mikrobiome zračne prašine sakupljeni tokom zatvorenog bioregenerativnog životnog signala "Lunarna palača 365" ", ekološki mikrobiomi, 17 (1), str. 1-20. Doi: 10.1186 / s40793-022-00399-0 / brojke / 8.
Yin, S. et al. (2022) "Povreda u funkcionalnim genima" Feedstock-a povezana sa kontroliranim nitrogenim gubitkom dušika u kompostiranju ", bioresource tehnologije, 361, str. 127678. DOI: 10.1016 / J.Biortech.2022.127678.
