পুরো ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং - ইলুমিনা
বৈশিষ্ট্য
● সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম ক্রমানুসারে দ্বৈত লাইব্রেরি: rRNA হ্রাস তারপর PE150 লাইব্রেরি প্রস্তুতি এবং আকার নির্বাচন এবং SE50 লাইব্রেরি প্রস্তুতি অনুসরণ করে
● পৃথক বায়োইনফরমেটিক্স রিপোর্টে mRNA, lncRNA, circRNA, এবং miRNA এর সম্পূর্ণ জৈব তথ্যবিজ্ঞান বিশ্লেষণ
● ceRNA নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ সহ একটি সম্মিলিত প্রতিবেদনে সমস্ত RNA অভিব্যক্তির যৌথ বিশ্লেষণ।
পরিষেবার সুবিধা
●নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কের গভীর বিশ্লেষণ: ceRNA নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ mRNA, lncRNA, circRNA, এবং miRNA এর যৌথ সিকোয়েন্সিং এবং একটি সম্পূর্ণ বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো দ্বারা সক্রিয় করা হয়েছে।
●ব্যাপক টীকা: আমরা ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড জিন (DEGs) কার্যকরীভাবে টীকা করতে একাধিক ডাটাবেস ব্যবহার করি এবং ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত সেলুলার এবং আণবিক প্রক্রিয়াগুলির অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে সংশ্লিষ্ট সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ সম্পাদন করি।
●ব্যাপক দক্ষতা: বিভিন্ন গবেষণা ডোমেনে 2100 টির বেশি সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রকল্প সফলভাবে বন্ধ করার ট্র্যাক রেকর্ড সহ, আমাদের দল প্রতিটি প্রকল্পে প্রচুর অভিজ্ঞতা নিয়ে আসে।
●কঠোর মান নিয়ন্ত্রণ: আমরা নমুনা এবং লাইব্রেরি প্রস্তুতি থেকে সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স পর্যন্ত সমস্ত পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ পয়েন্টগুলি বাস্তবায়ন করি। এই সূক্ষ্ম পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ-মানের ফলাফল প্রদান নিশ্চিত করে।
●বিক্রয়োত্তর সমর্থন: আমাদের প্রতিশ্রুতি 3 মাসের বিক্রয়োত্তর পরিষেবার মেয়াদ সহ প্রকল্প সমাপ্তির বাইরে প্রসারিত। এই সময়ের মধ্যে, আমরা ফলাফলের সাথে সম্পর্কিত যেকোন প্রশ্নের সমাধান করতে প্রকল্প ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং প্রশ্নোত্তর সেশন অফার করি।
নমুনা প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত | মান নিয়ন্ত্রণ |
| rRNA ক্ষয়প্রাপ্ত | ইলুমিনা PE150 | 16 জিবি | Q30≥85% |
| আকার নির্বাচন করা হয়েছে | ইলুমিনা SE50 | 10-20M পড়া হয়েছে |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইডস:
| Conc.(ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে দেখানো সীমিত বা কোন প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ নেই। | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; সীমিত বা কোন বেসলাইন উচ্চতা |
প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ
ধারক: 2 মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিনের ফয়েল বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনা লেবেলিং: গ্রুপ+প্রতিলিপি যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
1. শুকনো বরফ: নমুনাগুলি ব্যাগে প্যাক করা এবং শুকনো বরফের মধ্যে সমাহিত করা দরকার।
2. RNAstable টিউব: RNA নমুনাগুলি RNA স্ট্যাবিলাইজেশন টিউব (যেমন RNAstable®) এ শুকিয়ে ঘরের তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো
পরীক্ষামূলক নকশা
নমুনা বিতরণ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
বায়োইনফরমেটিক্স
আরএনএ এক্সপ্রেশন ওভারভিউ
ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিন
ceRNA বিশ্লেষণ
ভিন্নভাবে প্রকাশিত miRNAs এবং সম্পর্কিত RNAs
BMKGene'র সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সহজলভ্য করা গবেষণার অগ্রগতিগুলি প্রকাশনাগুলির একটি কিউরেটেড সংগ্রহের মাধ্যমে অন্বেষণ করুন৷
ডাই, ওয়াই এবং অন্যান্য। (2022) 'আরএনএ-সিকোয়েন্সিং দ্বারা চিহ্নিত কাশিন-বেক রোগে mRNAs, lncRNAs এবং miRNAs এর ব্যাপক এক্সপ্রেশন প্রোফাইল', মলিকুলার ওমিক্স, 18(2), পৃষ্ঠা 154-166। doi: 10.1039/D1MO00370D।
লিউ, এন নান এট আল। (2022) 'পূর্ণ দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্টোমস অ্যানালাইসিস অফ এপিস সিরানা ইন চাংবাই মাউন্টেনের ঠান্ডা-প্রতিরোধের সময় শীতকালে।', জিন, 830, পিপি। 146503–146503। doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
ওয়াং, এক্সজে এবং অন্যান্য। (2022) 'মাল্টি-ওমিক্স ইন্টিগ্রেশন-ভিত্তিক অগ্রাধিকার কম্পিটিং এন্ডোজেনাস আরএনএ রেগুলেশন নেটওয়ার্কস ইন স্মল সেল লাং ক্যান্সার: মলিকুলার ক্যারেক্টিস্টিকস অ্যান্ড ড্রাগ ক্যান্ডিডেটস', ফ্রন্টিয়ার্স ইন অনকোলজি, 12, পি. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলির সমন্বিত বিশ্লেষণ চিনাবাদামে রুট-নট নেমাটোডের প্রতিক্রিয়ায় সম্ভাব্য প্রক্রিয়াগুলির অভিনব অন্তর্দৃষ্টি প্রকাশ করে', BMC জিনোমিক্স, 23(1), পৃষ্ঠা 1-12৷ doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
ইয়ান, জেড এবং অন্যান্য। (2022) 'হোল-ট্রান্সক্রিপ্টোম আরএনএ সিকোয়েন্সিং লাল এলইডি বিকিরণ দ্বারা ব্রকোলিতে পোস্টহার্ভেস্টের গুণমান রক্ষণাবেক্ষণের সাথে যুক্ত আণবিক প্রক্রিয়াকে হাইলাইট করে', পোস্টহারভেস্ট বায়োলজি অ্যান্ড টেকনোলজি, 188, পি. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
