পুরো জিনোম বিসালফাইট সিকোয়েন্সিং (WGBS)
পুরো জিনোম বিসালফাইট সিকোয়েন্সিং (ডব্লিউজিবিএস) ডিএনএ মিথিলেশনের গভীরভাবে অনুসন্ধানের জন্য স্বর্ণ-মান পদ্ধতি হিসাবে দাঁড়িয়েছে, বিশেষত সাইটোসিনের পঞ্চম অবস্থান (5-mC), জিনের অভিব্যক্তি এবং সেলুলার কার্যকলাপের একটি প্রধান নিয়ামক। WGBS-এর অন্তর্নিহিত নীতির মধ্যে বিসালফাইট চিকিত্সা জড়িত, যা মিথাইলেড সাইটোসাইনগুলিকে অপরিবর্তিত রেখে ইউরাসিলে (C থেকে U) রূপান্তরিত করে। এই কৌশলটি একক-বেস রেজোলিউশন অফার করে, যা গবেষকদের ব্যাপকভাবে মিথাইলোম তদন্ত করতে এবং বিভিন্ন অবস্থার সাথে সম্পর্কিত অস্বাভাবিক মেথিলেশন প্যাটার্ন উন্মোচন করতে দেয়, বিশেষ করে ক্যান্সার। ডাব্লুজিবিএস নিয়োগের মাধ্যমে, বিজ্ঞানীরা জিনোম-বিস্তৃত মেথিলেশন ল্যান্ডস্কেপগুলির মধ্যে অতুলনীয় অন্তর্দৃষ্টি অর্জন করতে পারেন, যা বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়া এবং রোগের অন্তর্গত এপিজেনেটিক প্রক্রিয়াগুলির একটি সংক্ষিপ্ত ধারণা প্রদান করে।
পরিষেবা বৈশিষ্ট্য
● একটি রেফারেন্স জিনোম প্রয়োজন।
● ল্যাম্বডা ডিএনএ বিসালফাইট রূপান্তর দক্ষতা নিরীক্ষণের জন্য যোগ করা হয়।
● ইলুমিনা নোভাসেক-এ সিকোয়েন্সিং।
পরিষেবার সুবিধা
●ডিএনএ মেথিলেশন গবেষণার জন্য গোল্ড স্ট্যান্ডার্ড: এই পরিপক্ক মেথিলেশন রূপান্তর প্রক্রিয়াকরণ প্রযুক্তির উচ্চ নির্ভুলতা এবং ভাল প্রজননযোগ্যতা রয়েছে।
●ওয়াইড কভারেজ এবং একক-বেস রেজোলিউশন:জিনোম-বিস্তৃত স্তরে মেথিলেশন সাইটগুলির সনাক্তকরণ।
●সম্পূর্ণ প্ল্যাটফর্ম:নমুনা প্রক্রিয়াকরণ, লাইব্রেরি নির্মাণ, বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণের সিকোয়েন্সিং থেকে এক-স্টপ চমৎকার পরিষেবা প্রদান করুন।
●ব্যাপক দক্ষতা: WGBS সিকোয়েন্সিং প্রকল্পের সাথে বিভিন্ন প্রজাতির বিভিন্ন পরিসরে সফলভাবে সম্পন্ন হয়েছে, BMKGENE এক দশকেরও বেশি অভিজ্ঞতা, একটি অত্যন্ত দক্ষ বিশ্লেষণ দল, ব্যাপক বিষয়বস্তু, এবং বিক্রয়োত্তর চমৎকার সমর্থন নিয়ে এসেছে।
●ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স বিশ্লেষণের সাথে যোগদানের সম্ভাবনা: অন্যান্য ওমিক্স ডেটা যেমন RNA-seq-এর সাথে WGBS-এর সমন্বিত বিশ্লেষণের অনুমতি দেয়।
নমুনা স্পেসিফিকেশন
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | প্রস্তাবিত ডেটা আউটপুট | মান নিয়ন্ত্রণ |
| বিসালফাইট চিকিত্সা করা হয় | ইলুমিনা PE150 | 30x গভীরতা | Q30 ≥ 85% বিসালফাইট রূপান্তর > 99% |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (ng/µL) | মোট পরিমাণ (µg) | অতিরিক্ত প্রয়োজনীয়তা | |
| জিনোমিক ডিএনএ | ≥ 5 | ≥ 400 এনজি | সীমিত অবনতি বা দূষণ |
সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো
নমুনা বিতরণ
ডিএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
ডেটা ডেলিভারি
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● কাঁচা সিকোয়েন্সিং মান নিয়ন্ত্রণ;
● রেফারেন্স জিনোম ম্যাপিং;
● 5mC মিথাইলেড ঘাঁটি সনাক্তকরণ;
● মিথাইলেশন বন্টন এবং টীকা বিশ্লেষণ;
● ডিফারেনশিয়ালি মেথিলেটেড অঞ্চলের বিশ্লেষণ (DMRs);
● DMR এর সাথে যুক্ত জিনের কার্যকরী টীকা।
5mC মিথাইলেশন সনাক্তকরণ: মিথাইলেড সাইটের প্রকার
মিথিলেশন মানচিত্র। 5mC মিথাইলেশন জিনোম-ওয়াইড ডিস্ট্রিবিউশন
উচ্চ মিথাইলেড অঞ্চলের টীকা
ভিন্নভাবে মিথাইলেড অঞ্চল: সংশ্লিষ্ট জিন
ডিফারেনশিয়ালি মেথিলেটেড অঞ্চল: সংশ্লিষ্ট জিনের টীকা (জিন অন্টোলজি)
BMKGene-এর সম্পূর্ণ জিনোম বিসালফাইট সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সুগম করা গবেষণার অগ্রগতিগুলি প্রকাশনাগুলির একটি কিউরেটেড সংগ্রহের মাধ্যমে অন্বেষণ করুন৷
ফ্যান, ওয়াই এবং অন্যান্য। (2020) 'পুরো-জিনোম বিসালফাইট সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে ভেড়ার কঙ্কালের পেশী বিকাশের সময় ডিএনএ মিথিলেশন প্রোফাইলের বিশ্লেষণ',বিএমসি জিনোমিক্স, 21(1), পৃ. 1-15। doi: 10.1186/S12864-020-6751-5।
ঝাও, এক্স এবং অন্যান্য। (2022) 'ভিনাইল ক্লোরাইডের সংস্পর্শে আসা কর্মীদের মধ্যে নভেল ডিঅক্সিরাইবোনিউক্লিক অ্যাসিড মিথাইলেশন বিপর্যয়',টক্সিকোলজি এবং শিল্প স্বাস্থ্য, 38(7), পৃ. 377-388। doi: 10.1177/07482337221098600
জুও, জে. এট আল। (2020) 'জিনোম মেথিলেশন, নন-কোডিং RNA, mRNA এবং টমেটো ফল পাকাতে বিপাকীয় স্তরের মধ্যে সম্পর্ক',প্ল্যান্ট জার্নাল, 103(3), পৃ. 980-994। doi: 10.1111/TPJ.14778।
