ছোট আরএনএ হল ছোট নন-কোডিং আরএনএ-এর ধরন যার গড় দৈর্ঘ্য 18-30 nt, যার মধ্যে miRNA, siRNA এবং piRNA। এই ছোট আরএনএগুলি ব্যাপকভাবে বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়া যেমন mRNA অবক্ষয়, অনুবাদ প্রতিরোধ, হেটেরোক্রোমাটিন গঠন ইত্যাদির সাথে জড়িত বলে জানা গেছে। ছোট আরএনএ সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণ প্রাণী/উদ্ভিদ বিকাশ, রোগ, ভাইরাস ইত্যাদির উপর গবেষণায় ব্যাপকভাবে প্রয়োগ করা হয়েছে। সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ এবং উন্নত ডেটা মাইনিং নিয়ে গঠিত। RNA-seq ডেটার ভিত্তিতে, স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ miRNA সনাক্তকরণ এবং ভবিষ্যদ্বাণী, miRNA লক্ষ্য জিন পূর্বাভাস, টীকা এবং অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ অর্জন করতে পারে। উন্নত বিশ্লেষণ কাস্টমাইজড miRNA অনুসন্ধান এবং নিষ্কাশন, ভেন ডায়াগ্রাম জেনারেশন, miRNA এবং টার্গেট জিন নেটওয়ার্ক বিল্ডিং সক্ষম করে।