-
BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স বৈজ্ঞানিক উদ্ভাবনের সর্বাগ্রে অবস্থান করে, গবেষকদের তাদের স্থানিক প্রেক্ষাপট সংরক্ষণ করার সময় টিস্যুগুলির মধ্যে জটিল জিন প্রকাশের ধরণগুলি খুঁজে বের করার ক্ষমতা দেয়৷ বিভিন্ন প্ল্যাটফর্মের মধ্যে, BMKGene BMKManu S3000 Spatial Transcriptome চিপ তৈরি করেছে, যা 3.5µm এর বর্ধিত রেজোলিউশন নিয়ে, সাবসেলুলার রেঞ্জে পৌঁছেছে এবং বহু-স্তরের রেজোলিউশন সেটিংস সক্ষম করেছে। S3000 চিপ, প্রায় 4 মিলিয়ন দাগ সমন্বিত, স্থানিকভাবে বারকোডেড ক্যাপচার প্রোবের সাথে লোড করা পুঁতির স্তরযুক্ত মাইক্রোওয়েল নিয়োগ করে। একটি সিডিএনএ লাইব্রেরি, স্থানিক বারকোড দিয়ে সমৃদ্ধ, S3000 চিপ থেকে প্রস্তুত করা হয় এবং পরবর্তীতে ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্মে সিকোয়েন্স করা হয়। স্থানিকভাবে বারকোডযুক্ত নমুনা এবং UMI-এর সংমিশ্রণ উৎপন্ন ডেটার নির্ভুলতা এবং নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে। BMKManu S3000 চিপ অত্যন্ত বহুমুখী, বহু-স্তরীয় রেজোলিউশন সেটিংস অফার করে যা বিভিন্ন টিস্যু এবং কাঙ্খিত বিশদ স্তরের সাথে সূক্ষ্মভাবে টিউন করা যেতে পারে। এই অভিযোজনযোগ্যতা ন্যূনতম শব্দের সাথে সুনির্দিষ্ট স্থানিক ক্লাস্টারিং নিশ্চিত করে বিভিন্ন স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স অধ্যয়নের জন্য একটি অসামান্য পছন্দ হিসাবে চিপটিকে অবস্থান করে। BMKManu S3000-এর সাথে সেল সেগমেন্টেশন প্রযুক্তির ব্যবহার কোষের সীমানায় ট্রান্সক্রিপশনাল ডেটার সীমাবদ্ধতা সক্ষম করে, যার ফলে একটি বিশ্লেষণ হয় যার সরাসরি জৈবিক অর্থ রয়েছে। অধিকন্তু, S3000-এর উন্নত রেজোলিউশনের ফলে প্রতি কোষে উচ্চ সংখ্যক জিন এবং UMI সনাক্ত করা হয়, যা স্থানিক ট্রান্সক্রিপশন প্যাটার্ন এবং কোষগুলির ক্লাস্টারিংয়ের আরও সঠিক বিশ্লেষণ সক্ষম করে।
-
একক- নিউক্লিয়াস আরএনএ সিকোয়েন্সিং
একক-কোষ ক্যাপচার এবং কাস্টম লাইব্রেরি নির্মাণ কৌশলগুলির বিকাশ, উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংয়ের সাথে মিলিত, কোষের স্তরে জিন এক্সপ্রেশন স্টাডিতে বিপ্লব ঘটিয়েছে। এই অগ্রগতি জটিল কোষের জনসংখ্যার গভীর এবং আরও ব্যাপক বিশ্লেষণের অনুমতি দেয়, সমস্ত কোষের উপর জিনের অভিব্যক্তির গড় সঙ্গে যুক্ত সীমাবদ্ধতাগুলি অতিক্রম করে এবং এই জনসংখ্যার মধ্যে প্রকৃত ভিন্নতা রক্ষা করে। যদিও একক-কোষ আরএনএ সিকোয়েন্সিং (scRNA-seq) এর অনস্বীকার্য সুবিধা রয়েছে, এটি কিছু টিস্যুতে চ্যালেঞ্জের মুখোমুখি হয় যেখানে একটি একক-কোষ সাসপেনশন তৈরি করা কঠিন প্রমাণিত হয় এবং নতুন নমুনার প্রয়োজন হয়। BMKGene-এ, আমরা অত্যাধুনিক 10X জিনোমিক্স ক্রোমিয়াম প্রযুক্তি ব্যবহার করে একক-নিউক্লিয়াস RNA সিকোয়েন্সিং (snRNA-seq) অফার করে এই বাধার সমাধান করি। এই পদ্ধতিটি একক-কোষ স্তরে ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণের জন্য উপযুক্ত নমুনার বর্ণালীকে বিস্তৃত করে।
নিউক্লিয়াসের বিচ্ছিন্নতা উদ্ভাবনী 10X জিনোমিক্স ক্রোমিয়াম চিপের মাধ্যমে সম্পন্ন করা হয়, যেখানে ডাবল ক্রসিং সহ একটি আট-চ্যানেল মাইক্রোফ্লুইডিক্স সিস্টেম রয়েছে। এই সিস্টেমের মধ্যে, বারকোড, প্রাইমার, এনজাইম এবং একটি একক নিউক্লিয়াস যুক্ত জেল পুঁতিগুলি ন্যানোলিটার-আকারের তেলের ড্রপগুলিতে আবদ্ধ থাকে, যা জেল বিড-ইন-ইমালসন (GEM) গঠন করে। জিইএম গঠনের পর, প্রতিটি জিইএম-এর মধ্যে সেল লাইসিস এবং বারকোড রিলিজ হয়। পরবর্তীকালে, mRNA অণুগুলি 10X বারকোড এবং ইউনিক মলিকুলার আইডেন্টিফায়ার (UMIs) অন্তর্ভুক্ত করে, cDNA-তে বিপরীত প্রতিলিপির মধ্য দিয়ে যায়। এই সিডিএনএগুলি তখন স্ট্যান্ডার্ড সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরি নির্মাণের অধীন হয়, যা একক-কোষ স্তরে জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলির একটি শক্তিশালী এবং ব্যাপক অনুসন্ধানের সুবিধা দেয়।
প্ল্যাটফর্ম: 10× জিনোমিক্স ক্রোমিয়াম এবং ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল একটি অত্যাধুনিক প্রযুক্তি যা গবেষকদের তাদের স্থানিক প্রসঙ্গ সংরক্ষণ করার সময় টিস্যুগুলির মধ্যে জিনের প্রকাশের ধরণগুলি তদন্ত করতে দেয়। এই ডোমেনের একটি শক্তিশালী প্ল্যাটফর্ম হল 10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম এবং ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং। 10X ভিজিয়ামের নীতিটি একটি বিশেষ চিপের উপরে একটি মনোনীত ক্যাপচার এলাকা যেখানে টিস্যু বিভাগগুলি স্থাপন করা হয়। এই ক্যাপচার এলাকায় বারকোডযুক্ত দাগ রয়েছে, প্রতিটি টিস্যুর মধ্যে একটি অনন্য স্থানিক অবস্থানের সাথে সম্পর্কিত। টিস্যু থেকে বন্দী আরএনএ অণুগুলিকে তারপরে বিপরীত প্রতিলিপি প্রক্রিয়া চলাকালীন অনন্য আণবিক সনাক্তকারী (UMIs) দিয়ে লেবেল করা হয়। এই বারকোডযুক্ত দাগ এবং UMIগুলি একটি একক-কোষ রেজোলিউশনে সুনির্দিষ্ট স্থানিক ম্যাপিং এবং জিনের অভিব্যক্তির পরিমাণ নির্ধারণ করতে সক্ষম করে। স্থানিকভাবে বারকোডযুক্ত নমুনা এবং UMI-এর সংমিশ্রণ উৎপন্ন ডেটার নির্ভুলতা এবং নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে। এই স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স প্রযুক্তি ব্যবহার করে, গবেষকরা কোষের স্থানিক সংগঠন এবং টিস্যুগুলির মধ্যে ঘটে যাওয়া জটিল আণবিক মিথস্ক্রিয়া সম্পর্কে গভীর উপলব্ধি অর্জন করতে পারেন, অনকোলজি, নিউরোসায়েন্স, উন্নয়নমূলক জীববিদ্যা, ইমিউনোলজি সহ একাধিক ক্ষেত্রে জৈবিক প্রক্রিয়ার অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়াগুলির অমূল্য অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। , এবং বোটানিক্যাল স্টাডিজ।
প্ল্যাটফর্ম: 10X জিনোমিক্স ভিজিয়াম এবং ইলুমিনা নোভাসেক
