-
তুলনামূলক জিনোমিক্স
তুলনামূলক জিনোমিক্স বিভিন্ন প্রজাতির মধ্যে সমগ্র জিনোম ক্রম এবং কাঠামোর পরীক্ষা এবং তুলনা জড়িত। এই ক্ষেত্রটি প্রজাতির বিবর্তন উন্মোচন করতে চায়, জিনের ফাংশনগুলি ডিকোড করে এবং বিভিন্ন জীব জুড়ে সংরক্ষিত বা ভিন্ন ক্রম কাঠামো এবং উপাদানগুলি সনাক্ত করে জেনেটিক নিয়ন্ত্রক প্রক্রিয়াগুলিকে ব্যাখ্যা করে৷ একটি বিস্তৃত তুলনামূলক জিনোমিক্স অধ্যয়ন জিন পরিবার, বিবর্তনীয় বিকাশ, সম্পূর্ণ-জিনোম ডুপ্লিকেশন ইভেন্ট এবং নির্বাচনী চাপের প্রভাবের মতো বিশ্লেষণগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করে।
-
বিবর্তনীয় জেনেটিক্স
জনসংখ্যা এবং বিবর্তনীয় জেনেটিক বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মটি বছরের পর বছর ধরে BMK R&D টিমের মধ্যে সঞ্চিত বিশাল অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে প্রতিষ্ঠিত হয়েছে। এটি একটি ব্যবহারকারী বান্ধব টুল বিশেষ করে গবেষকদের জন্য যারা বায়োইনফরমেটিক্সে প্রধান নন। এই প্ল্যাটফর্মটি মৌলিক বিবর্তনীয় জেনেটিক্স সম্পর্কিত মৌলিক বিশ্লেষণকে সক্ষম করে যার মধ্যে রয়েছে ফাইলোজেনেটিক ট্রি নির্মাণ, সংযোগের অসামঞ্জস্য বিশ্লেষণ, জেনেটিক বৈচিত্র্য মূল্যায়ন, নির্বাচনী সুইপ বিশ্লেষণ, আত্মীয়তা বিশ্লেষণ, PCA, জনসংখ্যা গঠন বিশ্লেষণ ইত্যাদি।
-
হাই-সি ভিত্তিক জিনোম সমাবেশ
হাই-সি হল একটি পদ্ধতি যা প্রোবিং প্রক্সিমিটি-ভিত্তিক মিথস্ক্রিয়া এবং উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংকে একত্রিত করে ক্রোমোজোম কনফিগারেশন ক্যাপচার করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। এই মিথস্ক্রিয়াগুলির তীব্রতা ক্রোমোজোমের শারীরিক দূরত্বের সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত বলে মনে করা হয়। তাই, হাই-সি ডেটা একটি খসড়া জিনোমে একত্রিত সিকোয়েন্সের ক্লাস্টারিং, অর্ডারিং এবং ওরিয়েন্টিং গাইড করতে এবং নির্দিষ্ট সংখ্যক ক্রোমোজোমের উপর নোঙ্গর করার জন্য ব্যবহার করা হয়। এই প্রযুক্তি জনসংখ্যা-ভিত্তিক জেনেটিক মানচিত্রের অনুপস্থিতিতে একটি ক্রোমোজোম-স্তরের জিনোম সমাবেশকে শক্তিশালী করে। প্রতিটি জিনোমের একটি হাই-সি প্রয়োজন।
-
উদ্ভিদ/প্রাণী ডি নভো জিনোম সিকোয়েন্সিং
ডি নভোসিকোয়েন্সিং বলতে একটি রেফারেন্স জিনোমের অনুপস্থিতিতে সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি ব্যবহার করে একটি প্রজাতির সম্পূর্ণ জিনোম নির্মাণকে বোঝায়। তৃতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিংয়ের প্রবর্তন এবং ব্যাপকভাবে গ্রহণ করা, যা দীর্ঘ পঠিত বৈশিষ্ট্যযুক্ত, পাঠের মধ্যে ওভারল্যাপ বাড়িয়ে জিনোম সমাবেশকে উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করেছে। চ্যালেঞ্জিং জিনোমগুলির সাথে মোকাবিলা করার সময় এই বর্ধনটি বিশেষভাবে প্রাসঙ্গিক, যেমন যেগুলি উচ্চ হেটেরোজাইগোসিটি প্রদর্শন করে, পুনরাবৃত্ত অঞ্চলগুলির একটি উচ্চ অনুপাত, পলিপ্লয়েড এবং পুনরাবৃত্তিমূলক উপাদানগুলির সাথে অঞ্চল, অস্বাভাবিক GC বিষয়বস্তু, বা উচ্চ জটিলতা যা সাধারণত সংক্ষিপ্ত-পঠিত অনুক্রম ব্যবহার করে খারাপভাবে একত্রিত হয়। একা
আমাদের ওয়ান-স্টপ সলিউশন ইন্টিগ্রেটেড সিকোয়েন্সিং পরিষেবা এবং বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ প্রদান করে যা একটি উচ্চ-মানের ডি নভো অ্যাসেম্বলড জিনোম প্রদান করে। ইলুমিনার সাথে একটি প্রাথমিক জিনোম জরিপ জিনোমের আকার এবং জটিলতার অনুমান সরবরাহ করে এবং এই তথ্যটি PacBio HiFi এর সাথে দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিংয়ের পরবর্তী ধাপে নির্দেশিত করতে ব্যবহৃত হয়, তারপরেনতুনcontigs সমাবেশ। হাইসি অ্যাসেম্বলির পরবর্তী ব্যবহার জিনোমে কনটিগগুলিকে নোঙ্গর করতে সক্ষম করে, একটি ক্রোমোজোম-স্তরের সমাবেশ প্রাপ্ত করে। অবশেষে, জিনোমটি জিনের ভবিষ্যদ্বাণী দ্বারা এবং প্রকাশিত জিনগুলির ক্রমানুসারে টীকা করা হয়, সংক্ষিপ্ত এবং দীর্ঘ পাঠ সহ ট্রান্সক্রিপ্টোমের অবলম্বন করে।
-
হিউম্যান হোল এক্সোম সিকোয়েন্সিং
হিউম্যান হোল এক্সোম সিকোয়েন্সিং (এইচডব্লিউইএস) রোগ-সৃষ্টিকারী মিউটেশনগুলি চিহ্নিত করার জন্য একটি ব্যয়-কার্যকর এবং শক্তিশালী সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি হিসাবে ব্যাপকভাবে স্বীকৃত। সমগ্র জিনোমের মাত্র 1.7% গঠন করা সত্ত্বেও, এক্সনগুলি মোট প্রোটিন ফাংশনের প্রোফাইল সরাসরি প্রতিফলিত করে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। উল্লেখযোগ্যভাবে, মানব জিনোমে, রোগের সাথে সম্পর্কিত 85% এরও বেশি মিউটেশন প্রোটিন কোডিং অঞ্চলের মধ্যে প্রকাশ পায়। BMKGENE বিভিন্ন গবেষণা লক্ষ্য পূরণের জন্য উপলব্ধ দুটি ভিন্ন এক্সন ক্যাপচারিং কৌশল সহ একটি ব্যাপক এবং নমনীয় মানব সমগ্র এক্সোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবা অফার করে।
-
স্পেসিফিক-লোকাস এমপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট সিকোয়েন্সিং (SLAF-Seq)
উচ্চ-থ্রুপুট জিনোটাইপিং, বিশেষ করে বড় আকারের জনসংখ্যার ক্ষেত্রে, জেনেটিক অ্যাসোসিয়েশন অধ্যয়নের একটি মৌলিক পদক্ষেপ এবং কার্যকরী জিন আবিষ্কার, বিবর্তনীয় বিশ্লেষণ ইত্যাদির জন্য একটি জেনেটিক ভিত্তি প্রদান করে। গভীর সমগ্র জিনোম পুনঃক্রমের পরিবর্তে,হ্রাসকৃত প্রতিনিধিত্ব জিনোম সিকোয়েন্সিং (RRGS)জেনেটিক মার্কার আবিষ্কারে যুক্তিসঙ্গত দক্ষতা বজায় রেখে নমুনা প্রতি সিকোয়েন্সিং খরচ কমাতে প্রায়ই এই গবেষণায় নিযুক্ত করা হয়। RRGS সীমাবদ্ধ এনজাইমগুলির সাথে ডিএনএ হজম করে এবং একটি নির্দিষ্ট টুকরো আকারের পরিসরে ফোকাস করে এটি অর্জন করে, যার ফলে জিনোমের শুধুমাত্র একটি ভগ্নাংশকে অনুক্রম করে। বিভিন্ন RRGS পদ্ধতির মধ্যে, স্পেসিফিক-লোকাস অ্যামপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট সিকোয়েন্সিং (SLAF) একটি কাস্টমাইজযোগ্য এবং উচ্চ-মানের পদ্ধতি। এই পদ্ধতি, BMKGene দ্বারা স্বাধীনভাবে বিকশিত, প্রতিটি প্রকল্পের জন্য সীমাবদ্ধ এনজাইম সেট অপ্টিমাইজ করে। এটি একটি উল্লেখযোগ্য সংখ্যক SLAF ট্যাগ (জিনোমের 400-500 bps অঞ্চলগুলি ক্রমানুসারে) তৈরি করা নিশ্চিত করে যা জিনোম জুড়ে সমানভাবে বিতরণ করা হয় এবং কার্যকরভাবে পুনরাবৃত্তিমূলক অঞ্চলগুলি এড়িয়ে যায়, এইভাবে সেরা জেনেটিক মার্কার আবিষ্কারের নিশ্চয়তা দেয়।
-
ইলুমিনা প্রাক-তৈরি লাইব্রেরি
ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি, সিকোয়েন্সিং বাই সিন্থেসিস (এসবিএস) এর উপর ভিত্তি করে, একটি বিশ্বব্যাপী এনজিএস উদ্ভাবন, যা বিশ্বের 90% এর বেশি সিকোয়েন্সিং ডেটা তৈরি করার জন্য দায়ী। এসবিএস-এর নীতির মধ্যে রয়েছে ইমেজিং ফ্লুরোসেন্টলি লেবেলযুক্ত রিভার্সিবল টার্মিনেটর প্রতিটি dNTP যোগ করার সাথে সাথে এবং পরবর্তী বেসকে অন্তর্ভুক্ত করার অনুমতি দেওয়ার জন্য ক্লিভ করা হয়। প্রতিটি সিকোয়েন্সিং চক্রে চারটি বিপরীতমুখী টার্মিনেটর-বাউন্ড ডিএনটিপি উপস্থিত থাকায়, প্রাকৃতিক প্রতিযোগিতা অন্তর্ভুক্তির পক্ষপাত কমিয়ে দেয়। এই বহুমুখী প্রযুক্তি জিনোমিক অ্যাপ্লিকেশনগুলির একটি পরিসরে ক্যাটারিং করে একক-পঠিত এবং জোড়া-শেষ লাইব্রেরি উভয়কেই সমর্থন করে। ইলুমিনা সিকোয়েন্সিংয়ের উচ্চ-থ্রুপুট ক্ষমতা এবং নির্ভুলতা এটিকে জিনোমিক্স গবেষণায় একটি ভিত্তিপ্রস্তর হিসাবে অবস্থান করে, যা বিজ্ঞানীদের অতুলনীয় বিশদ এবং দক্ষতার সাথে জিনোমের জটিলতাগুলি উন্মোচন করতে সক্ষম করে।
আমাদের প্রি-মেড লাইব্রেরি সিকোয়েন্সিং সার্ভিস গ্রাহকদের বিভিন্ন উৎস থেকে সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরি প্রস্তুত করতে সক্ষম করে (mRNA, পুরো জিনোম, অ্যামপ্লিকন, 10x লাইব্রেরি, অন্যদের মধ্যে)। পরবর্তীকালে, ইলুমিনা প্ল্যাটফর্মগুলিতে গুণমান নিয়ন্ত্রণ এবং সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য এই লাইব্রেরিগুলি আমাদের সিকোয়েন্সিং সেন্টারে পাঠানো যেতে পারে।
