-
টুলকিটস
BMKCloud হল একটি নেতৃস্থানীয় বায়োইনফরম্যাটিক প্ল্যাটফর্ম যা জিনোমিক প্রোগ্রামগুলির জন্য এক-স্টপ সমাধান প্রদান করে, যা চিকিৎসা, কৃষি, পরিবেশগত, ইত্যাদি সহ বিভিন্ন ক্ষেত্রের গবেষকদের দ্বারা ব্যাপকভাবে বিশ্বস্ত৷ , কম্পিউটিং রিসোর্স, পাবলিক ডাটাবেস, বায়োইনফর্মটিক অনলাইন কোর্স ইত্যাদি। BMKCloud এর বিভিন্ন জিন টীকা, বিবর্তনীয় জেনেটিক টুলস, এনসিআরএনএ, ডেটা মান নিয়ন্ত্রণ, সমাবেশ, প্রান্তিককরণ, ডেটা নিষ্কাশন, মিউটেশন, পরিসংখ্যান, ফিগার জেনারেটর, সিকোয়েন্স বিশ্লেষণ ইত্যাদি সহ প্রায়শই ব্যবহৃত জৈব তথ্যমূলক সরঞ্জাম।
-
ডি নভো ব্যাকটেরিয়াল জিনোম সমাবেশ
আমরা একটি সম্পূর্ণ ব্যাকটেরিয়াল জিনোম সমাবেশ পরিষেবা প্রদান করি, 0 গ্যাপ গ্যারান্টি দিয়ে। দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি, যেমন সমাবেশের জন্য Nanopore এবং PacBio এবং সমাবেশের বৈধতা এবং ONT পাঠের ত্রুটি সংশোধনের জন্য ইলুমিনার সাথে সংক্ষিপ্ত-পঠিত সিকোয়েন্সিংকে একীভূত করে এটি সম্ভব। আমাদের পরিষেবা নির্দিষ্ট গবেষণা লক্ষ্য পূরণ করে সমাবেশ, কার্যকরী টীকা, এবং উন্নত বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ থেকে সম্পূর্ণ বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো প্রদান করে। এই পরিষেবাটি বিভিন্ন জেনেটিক এবং জিনোমিক গবেষণার জন্য সুনির্দিষ্ট রেফারেন্স জিনোমগুলির বিকাশকে সক্ষম করে। উপরন্তু, এটি স্ট্রেন অপ্টিমাইজেশান, জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং এবং মাইক্রোবায়াল প্রযুক্তি উন্নয়নের মতো অ্যাপ্লিকেশনগুলির জন্য ভিত্তি তৈরি করে, বৈজ্ঞানিক অন্তর্দৃষ্টি এবং জৈবপ্রযুক্তি উদ্ভাবনের অগ্রগতির জন্য নির্ভরযোগ্য এবং ফাঁক-মুক্ত জিনোমিক ডেটা নিশ্চিত করে।
-
ছোট আরএনএ
ছোট আরএনএ হল ছোট নন-কোডিং আরএনএর প্রকার যার গড় দৈর্ঘ্য 18-30 এনটি, যার মধ্যে miRNA, siRNA এবং piRNA। এই ছোট আরএনএগুলি ব্যাপকভাবে বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়া যেমন mRNA অবক্ষয়, অনুবাদ প্রতিরোধ, হেটেরোক্রোমাটিন গঠন ইত্যাদির সাথে জড়িত বলে জানা গেছে। ছোট আরএনএ সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণ প্রাণী/উদ্ভিদ বিকাশ, রোগ, ভাইরাস ইত্যাদির উপর গবেষণায় ব্যাপকভাবে প্রয়োগ করা হয়েছে। সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ এবং উন্নত ডেটা মাইনিং নিয়ে গঠিত। RNA-seq ডেটার ভিত্তিতে, স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ miRNA সনাক্তকরণ এবং ভবিষ্যদ্বাণী, miRNA লক্ষ্য জিন পূর্বাভাস, টীকা এবং অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ অর্জন করতে পারে। উন্নত বিশ্লেষণ কাস্টমাইজড miRNA অনুসন্ধান এবং নিষ্কাশন, ভেন ডায়াগ্রাম জেনারেশন, miRNA এবং টার্গেট জিন নেটওয়ার্ক বিল্ডিং সক্ষম করে।
-
NGS-WGS (ইলুমিনা/বিজিআই)
NGS-WGS হল একটি সম্পূর্ণ জিনোম রি-সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম, যা বায়োমার্কার টেকনোলজিতে সমৃদ্ধ অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে তৈরি করা হয়েছে। এই সহজে-ব্যবহারের প্ল্যাটফর্মটি কেবলমাত্র কয়েকটি মৌলিক প্যারামিটার সেট করে একটি সমন্বিত বিশ্লেষণ কর্মপ্রবাহ দ্রুত জমা দেওয়ার অনুমতি দেয়, যা ইলুমিনা প্ল্যাটফর্ম এবং বিজিআই সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম উভয় থেকে তৈরি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটার জন্য উপযুক্ত। এই প্ল্যাটফর্মটি উচ্চ কার্যকারিতা কম্পিউটিং সার্ভারে স্থাপন করা হয়েছে, যা অত্যন্ত সীমিত সময়ের মধ্যে অত্যন্ত দক্ষ ডেটা বিশ্লেষণকে শক্তিশালী করে। পরিবর্তিত জিন কোয়েরি, পিসিআর প্রাইমার ডিজাইন ইত্যাদি সহ স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণের ভিত্তিতে ব্যক্তিগতকৃত ডেটা মাইনিং উপলব্ধ।
-
mRNA(রেফারেন্স)
ট্রান্সক্রিপ্টোম হল জিনোমিক জেনেটিক তথ্য এবং জৈবিক ফাংশনের প্রোটিওমের মধ্যে সংযোগ। ট্রান্সক্রিপশনাল লেভেল রেগুলেশন হল জীবের সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ এবং সবচেয়ে ব্যাপকভাবে অধ্যয়ন করা রেগুলেশন মোড। ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং ট্রান্সক্রিপ্টোমকে যেকোনো সময়ে বা যেকোনো অবস্থার অধীনে সিকোয়েন্স করতে পারে, একটি একক নিউক্লিওটাইডের সঠিক রেজোলিউশন সহ। এটি গতিশীলভাবে জিন ট্রান্সক্রিপশনের স্তরকে প্রতিফলিত করতে পারে, একই সাথে বিরল এবং স্বাভাবিক ট্রান্সক্রিপ্টগুলি সনাক্ত করতে এবং পরিমাপ করতে পারে এবং এর কাঠামোগত তথ্য প্রদান করতে পারে। নমুনা নির্দিষ্ট প্রতিলিপি।
বর্তমানে, ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি কৃষিবিদ্যা, ওষুধ এবং অন্যান্য গবেষণার ক্ষেত্রে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে প্রাণী ও উদ্ভিদ উন্নয়ন নিয়ন্ত্রণ, পরিবেশগত অভিযোজন, রোগ প্রতিরোধক মিথস্ক্রিয়া, জিন স্থানীয়করণ, প্রজাতির জেনেটিক বিবর্তন এবং টিউমার এবং জেনেটিক রোগ সনাক্তকরণ।
-
মেটাজেনমিক্স (এনজিএস)
এই বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মটি বছরের অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে শটগান মেটাজেনমিক ডেটা বিশ্লেষণের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। এতে ডেটা প্রসেসিং, প্রজাতি-স্তরের অধ্যয়ন, জিন ফাংশন-লেভেল স্টাডিজ, মেটাজেনোম বিনিং, ইত্যাদি সহ সাধারণভাবে প্রয়োজনীয় বিভিন্ন মেটাজেনোমিক্স বিশ্লেষণ সহ সমন্বিত ওয়ার্কফ্লো রয়েছে। উপরন্তু, জিন এবং প্রজাতির ক্যোয়ারী সহ স্ট্যান্ডার্ড অ্যানালাইসিস ওয়ার্কফ্লোতে কাস্টমাইজড ডেটা মাইনিং টুল উপলব্ধ। , প্যারামিটার সেটিং, ব্যক্তিগতকৃত চিত্র তৈরি করা ইত্যাদি।
-
LncRNA
লং নন-কোডিং RNAs (lncRNA) হল এক ধরনের ট্রান্সক্রিপ্ট যার দৈর্ঘ্য 200 nt এর বেশি, যা প্রোটিন কোড করতে অক্ষম। সঞ্চিত প্রমাণগুলি পরামর্শ দেয় যে বেশিরভাগ lncRNA কার্যকরী হওয়ার সম্ভাবনা খুব বেশি। উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি এবং বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ সরঞ্জামগুলি আমাদেরকে আরও দক্ষতার সাথে lncRNA সিকোয়েন্স এবং পজিশনিং তথ্য প্রকাশ করার ক্ষমতা দেয় এবং গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক ফাংশনগুলির সাথে lncRNA আবিষ্কার করতে পরিচালিত করে। BMKCloud দ্রুত, নির্ভরযোগ্য এবং নমনীয় lncRNA বিশ্লেষণ অর্জনের জন্য আমাদের গ্রাহকদের lncRNA সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্ম প্রদান করতে পেরে গর্বিত।
-
জিডব্লিউএএস
জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (জিডব্লিউএএস) নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্য (ফেনোটাইপ) এর সাথে সম্পর্কিত জেনেটিক বৈকল্পিক (জিনোটাইপ) সনাক্ত করা লক্ষ্য করে। জিডব্লিউএ অধ্যয়নগুলি জেনেটিক মার্কারগুলি বিপুল সংখ্যক ব্যক্তির সম্পূর্ণ জিনোম অতিক্রম করে এবং জনসংখ্যার স্তরে পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণের মাধ্যমে জিনোটাইপ-ফেনোটাইপ অ্যাসোসিয়েশনগুলির পূর্বাভাস দেয়। সম্পূর্ণ-জিনোম রিকোয়েন্সিং সম্ভাব্যভাবে সমস্ত জেনেটিক বৈকল্পিক আবিষ্কার করতে পারে। ফিনোটাইপিক ডেটার সাথে মিলিত হয়ে, GWAS কে ফিনোটাইপ সম্পর্কিত SNPs, QTL এবং প্রার্থী জিন সনাক্ত করতে প্রক্রিয়া করা যেতে পারে, যা আধুনিক প্রাণী/উদ্ভিদের প্রজননকে শক্তিশালীভাবে ব্যাক আপ করে। SLAF হল একটি স্ব-উন্নত সরলীকৃত জিনোম সিকোয়েন্সিং কৌশল, যা জিনোম-ওয়াইড ডিস্ট্রিবিউটেড মার্কার, SNP আবিষ্কার করে। এই এসএনপিগুলি, আণবিক জেনেটিক মার্কার হিসাবে, লক্ষ্যযুক্ত বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে অ্যাসোসিয়েশন স্টাডির জন্য প্রক্রিয়া করা যেতে পারে। এটি জটিল বৈশিষ্ট সম্পর্কিত জেনেটিক বৈচিত্র সনাক্তকরণে একটি সাশ্রয়ী কৌশল।
-
ন্যানোপুর পূর্ণ দৈর্ঘ্যের প্রতিলিপি
জীবের জটিল এবং পরিবর্তনশীল বিকল্প আইসোফর্মগুলি জিনের প্রকাশ এবং প্রোটিন বৈচিত্র্য নিয়ন্ত্রণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ জেনেটিক প্রক্রিয়া। ট্রান্সক্রিপ্ট স্ট্রাকচারের সঠিক শনাক্তকরণ হল জিন এক্সপ্রেশন রেগুলেশন প্যাটার্নের গভীরভাবে অধ্যয়নের ভিত্তি। ন্যানোপুর সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম সফলভাবে ট্রান্সক্রিপ্টমিক অধ্যয়নকে আইসোফর্ম-স্তরে নিয়ে এসেছে। এই বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মটি রেফারেন্স জিনোমের ভিত্তিতে ন্যানোপুর প্ল্যাটফর্মে উত্পন্ন RNA-Seq ডেটা বিশ্লেষণ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে, যা জিন স্তর এবং ট্রান্সক্রিপ্ট উভয় স্তরেই গুণগত এবং পরিমাণগত বিশ্লেষণ অর্জন করে।
-
সার্ক-আরএনএ
সার্কুলার RNA(circRNA) হল এক ধরনের নন-কোডিং আরএনএ, যা সম্প্রতি উন্নয়নশীল, পরিবেশগত প্রতিরোধ, ইত্যাদির সাথে জড়িত নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলিতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে দেখা গেছে। circRNA এর প্রান্তগুলি একত্রে যুক্ত হয়ে একটি বৃত্তাকার কাঠামো তৈরি করে, যা তাদের হজম থেকে রক্ষা করে exonuclease এবং বেশিরভাগ রৈখিক RNA এর চেয়ে বেশি স্থিতিশীল। সার্কআরএনএ জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণে বিভিন্ন ফাংশন রয়েছে বলে পাওয়া গেছে। CircRNA ceRNA হিসাবে কাজ করতে পারে, যা miRNA কে প্রতিযোগিতামূলকভাবে আবদ্ধ করে, যা miRNA স্পঞ্জ নামে পরিচিত। সার্কআরএনএ সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম সার্কআরএনএ গঠন এবং অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ, লক্ষ্য ভবিষ্যদ্বাণী এবং অন্যান্য ধরণের আরএনএ অণুর সাথে যৌথ বিশ্লেষণকে শক্তিশালী করে।
-
বিএসএ
বাল্কড সেগ্রিগ্যান্ট অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্মে এক-ধাপে স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ এবং কাস্টমাইজড প্যারামিটার সেটিং সহ উন্নত বিশ্লেষণ রয়েছে। BSA হল একটি কৌশল যা দ্রুত ফিনোটাইপ সম্পর্কিত জেনেটিক মার্কার সনাক্ত করার জন্য নিযুক্ত করা হয়। BSA এর প্রধান কর্মপ্রবাহে রয়েছে: 1. অত্যন্ত বিরোধী ফেনোটাইপ সহ ব্যক্তিদের দুটি গ্রুপ নির্বাচন করা; 2. সকল ব্যক্তির DNA, RNA বা SLAF-seq (Biomarker দ্বারা বিকাশিত) একত্রিত করে দুই বাল্ক DNA তৈরি করা; 3. রেফারেন্স জিনোমের বিপরীতে বা এর মধ্যে ডিফারেনশিয়াল সিকোয়েন্স সনাক্ত করা, 4. ED এবং SNP-সূচক অ্যালগরিদম দ্বারা প্রার্থী লিঙ্কযুক্ত অঞ্চলগুলির ভবিষ্যদ্বাণী করা; 5. প্রার্থী অঞ্চলে জিনের কার্যগত বিশ্লেষণ এবং সমৃদ্ধকরণ, ইত্যাদি। জেনেটিক মার্কার স্ক্রীনিং এবং প্রাইমার ডিজাইন সহ ডেটাতে আরও উন্নত খনিরও উপলব্ধ।
-
অ্যামপ্লিকন (16S/18S/ITS)
অ্যামপ্লিকন (16S/18S/ITS) প্ল্যাটফর্মটি মাইক্রোবায়াল বৈচিত্র্যের প্রকল্প বিশ্লেষণে বছরের অভিজ্ঞতার সাথে তৈরি করা হয়েছে, যাতে রয়েছে প্রমিত মৌলিক বিশ্লেষণ এবং ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণ: মৌলিক বিশ্লেষণ বর্তমান মাইক্রোবিয়াল গবেষণার মূলধারার বিশ্লেষণ সামগ্রীকে কভার করে, বিশ্লেষণের বিষয়বস্তু সমৃদ্ধ এবং ব্যাপক, এবং বিশ্লেষণ ফলাফল প্রকল্প রিপোর্ট আকারে উপস্থাপন করা হয়; ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণের বিষয়বস্তু বৈচিত্র্যময়। নমুনা নির্বাচন করা যেতে পারে এবং মৌলিক বিশ্লেষণ রিপোর্ট এবং গবেষণা উদ্দেশ্য অনুযায়ী প্যারামিটার নমনীয়ভাবে সেট করা যেতে পারে, ব্যক্তিগতকৃত প্রয়োজনীয়তা উপলব্ধি করতে। উইন্ডোজ অপারেটিং সিস্টেম, সহজ এবং দ্রুত।
-
বিবর্তনীয় জেনেটিক্স
বিবর্তনীয় জেনেটিক্স হল একটি ব্যাপক সিকোয়েন্সিং পরিষেবা যা SNPs, InDels, SVs এবং CNVs সহ জেনেটিক বৈচিত্রের উপর ভিত্তি করে ব্যক্তিদের একটি বৃহৎ গোষ্ঠীর মধ্যে বিবর্তনের অন্তর্দৃষ্টিপূর্ণ ব্যাখ্যা দেওয়ার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। এই পরিষেবাটি জনসংখ্যার গঠন, জেনেটিক বৈচিত্র্য এবং ফাইলোজেনেটিক সম্পর্কগুলির মূল্যায়ন সহ জনসংখ্যার বিবর্তনীয় পরিবর্তন এবং জিনগত বৈশিষ্ট্যগুলি ব্যাখ্যা করার জন্য প্রয়োজনীয় সমস্ত প্রয়োজনীয় বিশ্লেষণগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করে৷ অধিকন্তু, এটি জিন প্রবাহের উপর অধ্যয়ন করে, কার্যকর জনসংখ্যার আকার এবং বিচ্যুতি সময়ের অনুমান সক্ষম করে। বিবর্তনীয় জেনেটিক্স অধ্যয়ন প্রজাতির উৎপত্তি এবং অভিযোজন সম্পর্কে মূল্যবান অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।
BMKGENE-তে, আমরা বৃহৎ জনসংখ্যার উপর বিবর্তনীয় জেনেটিক্স অধ্যয়ন পরিচালনা করার জন্য দুটি উপায় অফার করি: সম্পূর্ণ-জিনোম সিকোয়েন্সিং (WGS) নিয়োগ করা বা একটি কম উপস্থাপনা জিনোম সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি, ইন-হাউস-ডেভেলপড স্পেসিফিক-লোকাস অ্যামপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট (SLAF)। যদিও WGS ছোট জিনোমের জন্য উপযুক্ত, SLAF দীর্ঘ জিনোম সহ বৃহত্তর জনসংখ্যার অধ্যয়নের জন্য একটি সাশ্রয়ী বিকল্প হিসাবে আবির্ভূত হয়েছে, কার্যকরভাবে সিকোয়েন্সিং খরচ কমিয়েছে।
