-
মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং-এনজিএস
একটি মেটাজেনোম হল পরিবেশগত এবং মানব মেটাজেনোমের মতো জীবের মিশ্র সম্প্রদায়ের মোট জেনেটিক উপাদানের একটি সংগ্রহ। এটিতে চাষযোগ্য এবং চাষযোগ্য উভয় অণুজীবের জিনোম রয়েছে। এনজিএস-এর সাথে শটগান মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং পরিবেশগত নমুনায় এমবেড করা এই জটিল জিনোমিক ল্যান্ডস্কেপগুলির অধ্যয়নকে ট্যাক্সোনমিক প্রোফাইলিংয়ের চেয়েও বেশি প্রদান করে, প্রজাতির বৈচিত্র্য, প্রাচুর্য গতিশীলতা এবং জটিল জনসংখ্যার কাঠামোর মধ্যে দানাদার অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। ট্যাক্সোনমিক অধ্যয়নের বাইরে, শটগান মেটাজেনোমিক্স একটি কার্যকরী জিনোমিক্স দৃষ্টিকোণও অফার করে, যা এনকোডেড জিনগুলির অন্বেষণ এবং পরিবেশগত প্রক্রিয়াগুলিতে তাদের ভূমিকা ভূমিকাকে সক্ষম করে। অবশেষে, জিনগত উপাদান এবং পরিবেশগত কারণগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্ক নেটওয়ার্ক স্থাপন মাইক্রোবিয়াল সম্প্রদায় এবং তাদের পরিবেশগত পটভূমির মধ্যে জটিল আন্তঃপ্রক্রিয়ার সামগ্রিক বোঝার জন্য অবদান রাখে। উপসংহারে, মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং এই জটিল বাস্তুতন্ত্রের মধ্যে জেনেটিক্স এবং বাস্তুবিদ্যার মধ্যে বহুমুখী সম্পর্ককে আলোকিত করে, বিভিন্ন মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের জিনোমিক জটিলতাগুলিকে উন্মোচন করার জন্য একটি প্রধান উপকরণ হিসাবে দাঁড়িয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম: Illumina NovaSeq এবং DNBSEQ-T7
-
মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং-টিজিএস
একটি মেটাজেনোম হল জীবের মিশ্র সম্প্রদায়ের জেনেটিক উপাদানের একটি সংগ্রহ, যেমন পরিবেশগত এবং মানব মেটাজেনোম। এটিতে চাষযোগ্য এবং চাষযোগ্য উভয় অণুজীবের জিনোম রয়েছে। মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং এই জটিল জিনোমিক ল্যান্ডস্কেপগুলির অধ্যয়ন করতে সক্ষম করে যা পরিবেশগত নমুনায় এমবেড করা ট্যাক্সোনমিক প্রোফাইলিংয়ের চেয়ে বেশি প্রদান করে। এটি এনকোডেড জিন এবং পরিবেশগত প্রক্রিয়াগুলিতে তাদের ভূমিকার অন্বেষণ করে একটি কার্যকরী জিনোমিক্স দৃষ্টিকোণও সরবরাহ করে। যদিও ইলুমিনা সিকোয়েন্সিংয়ের সাথে ঐতিহ্যগত শটগান পদ্ধতিগুলি মেটাজেনমিক স্টাডিতে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে, ন্যানোপোর এবং প্যাকবিও দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিংয়ের আবির্ভাব ক্ষেত্রটিকে পরিবর্তন করেছে। Nanopore এবং PacBio প্রযুক্তি ডাউনস্ট্রিম বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণগুলিকে উন্নত করে, বিশেষ করে মেটাজেনোম সমাবেশ, আরও একটানা সমাবেশ নিশ্চিত করে। প্রতিবেদনগুলি ইঙ্গিত দেয় যে ন্যানোপোর-ভিত্তিক এবং প্যাকবিও-ভিত্তিক মেটাজেনোমিক্স সফলভাবে জটিল মাইক্রোবায়োমগুলি থেকে সম্পূর্ণ এবং বন্ধ ব্যাকটেরিয়া জিনোম তৈরি করেছে (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020)। ইলুমিনা রিডের সাথে ন্যানোপোর রিডকে একীভূত করা ত্রুটি সংশোধনের জন্য একটি কৌশলগত পদ্ধতি প্রদান করে, ন্যানোপোরের অন্তর্নিহিত কম নির্ভুলতা হ্রাস করে। এই সিনারজিস্টিক সংমিশ্রণটি প্রতিটি সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মের শক্তিগুলিকে কাজে লাগায়, সম্ভাব্য সীমাবদ্ধতাগুলি কাটিয়ে উঠতে এবং মেটাজেনমিক বিশ্লেষণের নির্ভুলতা এবং নির্ভরযোগ্যতাকে অগ্রসর করার জন্য একটি শক্তিশালী সমাধান সরবরাহ করে।
প্ল্যাটফর্ম: Nanopore PromethION 48, Illumia এবং PacBio Revio
-
16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-প্যাকবিও
16S এবং 18S rRNA জিনগুলি, অভ্যন্তরীণ ট্রান্সক্রাইবড স্পেসারের (ITS) অঞ্চলের সাথে, অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং হাইপার-ভেরিয়েবল অঞ্চলগুলির সংমিশ্রণের কারণে প্রধান আণবিক আঙ্গুলের ছাপ চিহ্নিতকারী হিসাবে কাজ করে, যা তাদের প্রোক্যারিওটিক এবং ইউক্যারিওটিক জীবের বৈশিষ্ট্যের জন্য অমূল্য হাতিয়ার করে তোলে। এই অঞ্চলগুলির পরিবর্ধন এবং সিকোয়েন্সিং বিভিন্ন ইকোসিস্টেম জুড়ে মাইক্রোবিয়াল রচনা এবং বৈচিত্র্য তদন্তের জন্য একটি বিচ্ছিন্নতা-মুক্ত পদ্ধতির প্রস্তাব করে। যদিও ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং সাধারণত 16S এবং ITS1-এর V3-V4-এর মতো ছোট হাইপারভেরিয়েবল অঞ্চলগুলিকে লক্ষ্য করে, এটি প্রমাণিত হয়েছে যে 16S, 18S এবং ITS-এর সম্পূর্ণ দৈর্ঘ্যের সিকোয়েন্সিংয়ের মাধ্যমে উচ্চতর শ্রেণীবিন্যাস টীকা অর্জন করা যায়। এই ব্যাপক পদ্ধতির ফলে সঠিকভাবে শ্রেণীবদ্ধ ক্রমগুলির উচ্চ শতাংশে পরিণত হয়, রেজোলিউশনের একটি স্তর অর্জন করে যা প্রজাতি সনাক্তকরণ পর্যন্ত প্রসারিত হয়। PacBio-এর সিঙ্গেল-মলিকিউল রিয়েল-টাইম (SMRT) সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মটি অত্যন্ত নির্ভুল লং রিড (HiFi) প্রদান করে যা ইলুমিনা সিকোয়েন্সিংয়ের নির্ভুলতাকে প্রতিদ্বন্দ্বিতা করে পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের অ্যামপ্লিকনগুলিকে কভার করে। এই ক্ষমতা গবেষকদের একটি অতুলনীয় সুবিধা অর্জন করতে দেয় - জেনেটিক ল্যান্ডস্কেপের একটি প্যানোরামিক ভিউ। বর্ধিত কভারেজ প্রজাতির টীকাতে রেজোলিউশনকে উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করে, বিশেষ করে ব্যাকটেরিয়া বা ছত্রাকজনিত সম্প্রদায়ের মধ্যে, মাইক্রোবিয়াল জনসংখ্যার জটিলতাগুলির গভীরতর বোঝার সক্ষম করে।
-
16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-এনজিএস
ইলুমিনা প্রযুক্তির সাথে অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং, বিশেষ করে 16S, 18S, এবং ITS জেনেটিক মার্কারগুলিকে লক্ষ্য করে, মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের মধ্যে ফাইলোজেনি, শ্রেণীবিন্যাস এবং প্রজাতির প্রাচুর্য উদ্ঘাটনের জন্য একটি শক্তিশালী পদ্ধতি। এই পদ্ধতিতে হাউসকিপিং জেনেটিক মার্কারগুলির হাইপারভেরিয়েবল অঞ্চলগুলিকে সিকোয়েন্স করা জড়িত। মূলত দ্বারা একটি আণবিক আঙ্গুলের ছাপ হিসাবে প্রবর্তিতদুশ্চিন্তা ইত্যাদি1977 সালে, এই কৌশলটি বিচ্ছিন্নতা-মুক্ত বিশ্লেষণ সক্ষম করে মাইক্রোবায়োম প্রোফাইলিংকে বিপ্লব করেছে। 16S (ব্যাকটেরিয়া), 18S (ছত্রাক), এবং অভ্যন্তরীণ ট্রান্সক্রাইবড স্পেসারের (ITS, ছত্রাক) এর সিকোয়েন্সিংয়ের মাধ্যমে গবেষকরা শুধুমাত্র প্রচুর প্রজাতিই নয়, বিরল এবং অজ্ঞাত প্রজাতিকেও শনাক্ত করতে পারেন। একটি প্রধান হাতিয়ার হিসাবে ব্যাপকভাবে গৃহীত, অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং মানুষের মুখ, অন্ত্র, মল এবং তার বাইরে সহ বিভিন্ন পরিবেশে ডিফারেনশিয়াল মাইক্রোবিয়াল রচনাগুলিকে বোঝার জন্য সহায়ক হয়ে উঠেছে।
-
ব্যাকটেরিয়া এবং ছত্রাকের পুরো জিনোম রি-সিকোয়েন্সিং
ব্যাকটেরিয়া এবং ছত্রাকের সম্পূর্ণ-জিনোম পুনরায় সিকোয়েন্সিং প্রকল্পগুলি মাইক্রোবিয়াল জিনোমগুলির সমাপ্তি এবং তুলনা সক্ষম করে মাইক্রোবিয়াল জিনোমিক্সকে এগিয়ে নেওয়ার জন্য গুরুত্বপূর্ণ। এটি গাঁজন প্রকৌশল, শিল্প প্রক্রিয়ার অপ্টিমাইজেশন, এবং গৌণ বিপাক পথের অন্বেষণকে সহজ করে। তদ্ব্যতীত, ছত্রাক এবং ব্যাকটেরিয়া পুনরায় অনুক্রম পরিবেশগত অভিযোজন বোঝার জন্য, স্ট্রেনের অপ্টিমাইজ করা এবং জেনেটিক বিবর্তন গতিবিদ্যাকে প্রকাশ করার জন্য, ওষুধ, কৃষি এবং পরিবেশ বিজ্ঞানের বিস্তৃত প্রভাব সহ গুরুত্বপূর্ণ।
-
প্রোক্যারিওটিক আরএনএ সিকোয়েন্সিং
আরএনএ সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে কোষের মধ্যে সমস্ত আরএনএ ট্রান্সক্রিপ্টের ব্যাপক প্রোফাইলিংয়ের ক্ষমতা দেয়। এই অত্যাধুনিক প্রযুক্তি একটি শক্তিশালী হাতিয়ার হিসেবে কাজ করে, জটিল জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল, জিন গঠন এবং বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়ার সাথে যুক্ত আণবিক প্রক্রিয়া উন্মোচন করে। মৌলিক গবেষণা, ক্লিনিকাল ডায়াগনস্টিকস এবং ড্রাগ ডেভেলপমেন্টে ব্যাপকভাবে গৃহীত, আরএনএ সিকোয়েন্সিং সেলুলার গতিবিদ্যা এবং জেনেটিক নিয়ন্ত্রণের জটিলতার অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। আমাদের প্রোক্যারিওটিক আরএনএ নমুনা প্রসেসিং প্রোক্যারিওটিক ট্রান্সক্রিপ্টোমের জন্য তৈরি করা হয়েছে, যাতে rRNA হ্রাস এবং নির্দেশমূলক লাইব্রেরি প্রস্তুতি জড়িত।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক
-
মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং
ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি ব্যবহার করে, BMKGENE-এর মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবা মাটি, জল, সমুদ্র, মল এবং অন্ত্রের মতো প্রাকৃতিক পরিবেশের মধ্যে ইউক্যারিওট থেকে প্রোক্যারিওট এবং ভাইরাস পর্যন্ত বিস্তৃত জীবাণুর একটি বৈচিত্র্যময় বিন্যাসের গতিশীল জিনের অভিব্যক্তি উন্মোচন করে। আমাদের বিস্তৃত পরিষেবা গবেষকদেরকে জটিল মাইক্রোবিয়াল সম্প্রদায়ের সম্পূর্ণ জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলি অনুসন্ধান করার ক্ষমতা দেয়। শ্রেণীবিন্যাস বিশ্লেষণের বাইরে, আমাদের মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবা কার্যকরী সমৃদ্ধকরণে অনুসন্ধানের সুবিধা দেয়, ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিন এবং তাদের ভূমিকার উপর আলোকপাত করে। এই বৈচিত্র্যময় পরিবেশগত কুলুঙ্গির মধ্যে আপনি জিনের অভিব্যক্তি, শ্রেণীবিন্যাস বৈচিত্র্য এবং কার্যকরী গতিবিদ্যার জটিল ল্যান্ডস্কেপ নেভিগেট করার সাথে সাথে প্রচুর জৈবিক অন্তর্দৃষ্টি উন্মোচন করুন।
-
ডি নভো ফাঙ্গাল জিনোম সমাবেশ
BMKGENE ছত্রাকের জিনোমের জন্য বহুমুখী সমাধান প্রদান করে, বিভিন্ন গবেষণার চাহিদা এবং কাঙ্ক্ষিত জিনোমের সম্পূর্ণতা পূরণ করে। সংক্ষিপ্ত-পঠিত ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং একা ব্যবহার করা একটি খসড়া জিনোম তৈরির অনুমতি দেয়। ন্যানোপোর বা প্যাকবিও ব্যবহার করে সংক্ষিপ্ত-পঠিত এবং দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিংকে একত্রিত করা হয় দীর্ঘ কন্টিগ সহ আরও পরিমার্জিত ছত্রাকের জিনোমের জন্য। অধিকন্তু, হাই-সি সিকোয়েন্সিংকে একীভূত করা আরও ক্ষমতা বাড়ায়, একটি সম্পূর্ণ ক্রোমোজোম-স্তরের জিনোম অর্জনকে সক্ষম করে।
-
ডি নভো ব্যাকটেরিয়াল জিনোম সমাবেশ
আমরা একটি সম্পূর্ণ ব্যাকটেরিয়াল জিনোম সমাবেশ পরিষেবা প্রদান করি, 0 গ্যাপ গ্যারান্টি দিয়ে। দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি, যেমন সমাবেশের জন্য Nanopore এবং PacBio এবং সমাবেশের বৈধতা এবং ONT পাঠের ত্রুটি সংশোধনের জন্য ইলুমিনার সাথে সংক্ষিপ্ত-পঠিত সিকোয়েন্সিংকে একীভূত করে এটি সম্ভব। আমাদের পরিষেবা নির্দিষ্ট গবেষণা লক্ষ্য পূরণ করে সমাবেশ, কার্যকরী টীকা, এবং উন্নত বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ থেকে সম্পূর্ণ বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো প্রদান করে। এই পরিষেবাটি বিভিন্ন জেনেটিক এবং জিনোমিক গবেষণার জন্য সুনির্দিষ্ট রেফারেন্স জিনোমগুলির বিকাশকে সক্ষম করে। উপরন্তু, এটি স্ট্রেন অপ্টিমাইজেশান, জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং এবং মাইক্রোবায়াল প্রযুক্তি উন্নয়নের মতো অ্যাপ্লিকেশনগুলির জন্য ভিত্তি তৈরি করে, বৈজ্ঞানিক অন্তর্দৃষ্টি এবং জৈবপ্রযুক্তি উদ্ভাবনের অগ্রগতির জন্য নির্ভরযোগ্য এবং ফাঁক-মুক্ত জিনোমিক ডেটা নিশ্চিত করে।
