পণ্য

সম্পূর্ণ বায়োইনফর্ম্যাটিক বিশ্লেষণ, 4 টি ধাপে পৃথক:

1) এনজিএস সহ কে-এমআর বিশ্লেষণের ভিত্তিতে জিনোম জরিপ:

জিনোম আকারের অনুমান

হিটারোজাইগোসিটির অনুমান

পুনরাবৃত্ত অঞ্চলগুলির অনুমান

2) প্যাকবিও হাইফাই সহ জিনোম সমাবেশ:

                   ডি নভোসমাবেশ

সমাবেশ মূল্যায়ন: জিনোম সম্পূর্ণতার জন্য বাসকো বিশ্লেষণ সহ এবং এনজিএস এবং প্যাকবিও এইচআইএফআই রিডের পিছনে ম্যাপিং সহ

3) হাই-সি সমাবেশ:

হাই-সি লাইব্রেরি কিউসি: বৈধ হাই-সি ইন্টারঅ্যাকশনগুলির অনুমান

হাই-সি সমাবেশ: গ্রুপগুলিতে কনটিগগুলির ক্লাস্টারিং, তারপরে প্রতিটি গ্রুপের মধ্যে কন্টিগ অর্ডার করে এবং কনটিগ ওরিয়েন্টেশন নির্ধারণ করে

হাই-সি মূল্যায়ন

4) জিনোম টীকা:

নন-কোডিং আরএনএ পূর্বাভাস

পুনরাবৃত্তিমূলক সিকোয়েন্সগুলি সনাক্তকরণ (ট্রান্সপসন এবং টেন্ডেম পুনরাবৃত্তি)

জিনের পূর্বাভাস

§ডি নভো: অ্যাব ইনিশিও অ্যালগরিদম

Homo হোমোলজির উপর ভিত্তি করে

Trancip ট্রান্সক্রিপ্টের উপর ভিত্তি করে, দীর্ঘ এবং সংক্ষিপ্ত পাঠের সাথে: পঠনগুলি হয়ডি নভোখসড়া জিনোমে একত্রিত বা ম্যাপ করা

Multiple একাধিক ডাটাবেস সহ পূর্বাভাসযুক্ত জিনগুলির টীকা

1) জিনোম সমীক্ষা- কে-ইয়ার বিশ্লেষণ

2) জিনোম সমাবেশ

2) জিনোম অ্যাসেম্বলি - প্যাকবিও হিফি সমাবেশের খসড়াতে ম্যাপিং পড়ে

2) হাই-সি সমাবেশ-হাই-সি বৈধ ইন্টারঅ্যাকশন জোড়ের অনুমান

3) হাই-সি পোস্ট-অ্যাসেম্বলি মূল্যায়ন

4) জিনোম টীকা - পূর্বাভাসযুক্ত জিনগুলির সংহতকরণ

4) জিনোম টীকা - পূর্বাভাস জিন টীকা

বিএমকেজেনের ডি নভো জিনোম অ্যাসেম্বলি পরিষেবাগুলি প্রকাশনাগুলির একটি সংশোধিত সংগ্রহের মাধ্যমে সহজতর অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন:

লি, সি এট আল। (2021) 'জিনোম সিকোয়েন্সগুলি বৈশ্বিক বিচ্ছুরণ রুটগুলি প্রকাশ করে এবং সমুদ্রের বিবর্তনে কনভারজেন্ট জেনেটিক অভিযোজনগুলির পরামর্শ দেয়', প্রকৃতি যোগাযোগ, 12 (1)। doi: 10.1038/s41467-021-21379-x।

লি, ওয়াই এট আল। (2023) 'বৃহত আকারের ক্রোমোসোমাল পরিবর্তনগুলি জিনোম-স্তরের প্রকাশের পরিবর্তন, পরিবেশগত অভিযোজন এবং গায়াল (বিওএস ফ্রন্টালিস) এর স্পেসিফিকেশন', আণবিক জীববিজ্ঞান এবং বিবর্তন, 40 (1) বাড়ে। doi: 10.1093/মোলবেভ/এমএসএডি 1006।

টিয়ান, টি। এট আল। (2023) 'জিনোম অ্যাসেম্বলি এবং একটি বিশিষ্ট খরা-প্রতিরোধী ভুট্টা জীবাণুগুলির জিনগত বিচ্ছিন্নতা', প্রকৃতি জেনেটিক্স 2023 55: 3, 55 (3), পৃষ্ঠা 496–506। doi: 10.1038/s41588-023-01297-y।

ঝাং, এফ। এট আল। (2023) 'সোলানাসেই পরিবারে দুটি জিনোম বিশ্লেষণ করে ট্রোপেন ক্ষারীয় বায়োসিন্থেসিসের বিবর্তন প্রকাশ করা', প্রকৃতি যোগাযোগ 2023 14: 1, 14 (1), পৃষ্ঠা 1-18। doi: 10.1038/s41467-023-37133-4।

চ্যালেঞ্জিং কেস-স্টাডিগুলি:

টেলোমির থেকে টেলোমির সমাবেশ:ফু, এ। এট আল। (2023) 'বিটার তরমুজের টেলোমির-টু-টেলোমির জিনোম অ্যাসেম্বলি (মোমর্ডিকা চ্যারান্টিয়া এল। ভার। সংক্ষিপ্তসার সের।) ফলের বিকাশ, রচনা এবং পাকা জিনগত বৈশিষ্ট্য প্রকাশ করে', উদ্যানতত্ত্ব গবেষণা, 10 (1)। doi: 10.1093/ঘন্টা/uhac228।

হ্যাপ্লোটাইপ সমাবেশ:হু, ডাব্লু। এট আল। (2021) 'অ্যালিল-সংজ্ঞায়িত জিনোম কাসাভা বিবর্তনের সময় বায়ালেলিক পার্থক্য প্রকাশ করে', আণবিক উদ্ভিদ, 14 (6), পৃষ্ঠা 851–854। doi: 10.1016/j.molp.2021.04.009।

দৈত্য জিনোম সমাবেশ:ইউয়ান, জে এট আল। (2022) 'গিগা-ক্রোমোসোমগুলির জিনোমিক ভিত্তি এবং গাছের গিগা-জেনোমের গাছ পেনি পাওনিয়া অস্টিই', প্রকৃতি যোগাযোগ 2022 13: 1, 13 (1), পৃষ্ঠা 1–16। doi: 10.1038/s41467-022-35063-1।

পলিপ্লয়েড জিনোম সমাবেশ:ঝাং, কি। এট আল। (2022) 'অটোপলাইপলয়েড আখের স্যাকারাম স্পন্টেনিয়ামের সাম্প্রতিক ক্রোমোজোম হ্রাস সম্পর্কে জিনোমিক অন্তর্দৃষ্টি', প্রকৃতি জেনেটিক্স 2022 54: 6, 54 (6), পৃষ্ঠা 885–896। doi: 10.1038/s41588-022-01084-1।