নন-রেফারেন্স ভিত্তিক এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং-এনজিএস
বৈশিষ্ট্য
Ligration লাইব্রেরি প্রস্তুতির আগে পলি এমআরএনএ ক্যাপচার
Any যে কোনও রেফারেন্স জিনোমের থেকে স্বতন্ত্র: ট্রান্সক্রিপ্টগুলির ডি নভো অ্যাসেমব্লির উপর ভিত্তি করে, একাধিক ডাটাবেস (এনআর, সুইস-প্রট, সিওজি, কোগ, ডিম্বানগ, ডিমনোগ, পিএফএএম, জিও, কেজিজি) দিয়ে টীকাযুক্ত ইউনিজিনগুলির একটি তালিকা তৈরি করে
Ne জিনের এক্সপ্রেশন এবং ট্রান্সক্রিপ্ট কাঠামোর বিস্তৃত বায়োইনফর্ম্যাটিক বিশ্লেষণ
পরিষেবা সুবিধা
●বিস্তৃত দক্ষতা: বিএমকেজিনে, 000০০,০০০ এরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াকরণের ট্র্যাক রেকর্ডের সাথে, সেল সংস্কৃতি, টিস্যু এবং দেহের তরলগুলির মতো বিভিন্ন নমুনা প্রকারের বিস্তৃত, আমাদের দল প্রতিটি প্রকল্পের জন্য প্রচুর অভিজ্ঞতা নিয়ে আসে। আমরা বিভিন্ন গবেষণা ডোমেনগুলিতে সাফল্যের সাথে 100,000 এমআরএনএ-সেক প্রকল্পগুলি বন্ধ করে দিয়েছি।
●কঠোর মানের নিয়ন্ত্রণ: আমরা নমুনা এবং গ্রন্থাগার প্রস্তুতি থেকে সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরম্যাটিকস পর্যন্ত সমস্ত পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ পয়েন্টগুলি প্রয়োগ করি। এই সূক্ষ্ম পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ-মানের ফলাফলের বিতরণ নিশ্চিত করে।
● বিস্তৃত টীকা: আমরা স্বতন্ত্রভাবে প্রকাশিত জিনগুলি (ডিইজি) কার্যত টিকা দেওয়ার জন্য একাধিক ডাটাবেস ব্যবহার করি এবং ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত সেলুলার এবং আণবিক প্রক্রিয়াগুলিতে অন্তর্দৃষ্টি সরবরাহ করে সংশ্লিষ্ট সমৃদ্ধ বিশ্লেষণ সম্পাদন করি।
●বিক্রয় পোস্ট সমর্থন: আমাদের প্রতিশ্রুতি 3 মাস পরে বিক্রয় পরিষেবা সময়কালের সাথে প্রকল্পের সমাপ্তির বাইরেও প্রসারিত। এই সময়ের মধ্যে, আমরা ফলাফলের সাথে সম্পর্কিত যে কোনও প্রশ্নকে সম্বোধন করার জন্য প্রকল্পের ফলোআপ, ট্রাবলশুটিং সহায়তা এবং প্রশ্নোত্তর সেশনগুলি সরবরাহ করি।
নমুনা প্রয়োজনীয়তা এবং বিতরণ
| গ্রন্থাগার | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত | মান নিয়ন্ত্রণ |
| পলি একটি সমৃদ্ধ | ইলুমিনা পিই 150 Dnbseq-T7 | 6-10 জিবি | Q30≥85% |
নমুনার প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইডস:
| সংক্ষিপ্ত (এনজি/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | অখণ্ডতা |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 জেলটিতে দেখানো সীমাবদ্ধ বা কোনও প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ নেই। | উদ্ভিদের জন্য: rin≥4.0; প্রাণীদের জন্য: rin≥4.5; 5.0্যা 28 এস/18 এস 201.0; সীমাবদ্ধ বা কোনও বেসলাইন উচ্চতা নেই |
● উদ্ভিদ:
রুট, স্টেম বা পাপড়ি: 450 মিলিগ্রাম
পাতা বা বীজ: 300 মিলিগ্রাম
ফল: 1.2 গ্রাম
● প্রাণী:
হার্ট বা অন্ত্র: 300 মিলিগ্রাম
ভিসেরা বা মস্তিষ্ক: 240 মিলিগ্রাম
পেশী: 450 মিলিগ্রাম
হাড়, চুল বা ত্বক: 1 জি
● আর্থ্রোপডস:
পোকামাকড়: 6 জি
ক্রাস্টেসিয়া: 300 মিলিগ্রাম
● পুরো রক্ত: 1 টিউব
● কোষ: 106 কোষ
প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ
ধারক: 2 মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিন ফয়েল প্রস্তাবিত নয়)
নমুনা লেবেলিং: গোষ্ঠী+প্রতিলিপি যেমন এ 1, এ 2, এ 3; বি 1, বি 2, বি 3।
চালান:
1। শুকনো-আইস: নমুনাগুলি ব্যাগে প্যাক করা এবং শুকনো আইসিতে সমাহিত করা দরকার।
2। আরএনএস্টেবল টিউবস: আরএনএ নমুনাগুলি আরএনএ স্থিতিশীল নল (যেমন rnastable®) এ শুকানো যেতে পারে এবং ঘরের তাপমাত্রায় প্রেরণ করা যেতে পারে।
পরিষেবা কাজের প্রবাহ
পরীক্ষামূলক নকশা
নমুনা বিতরণ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয় পরে পরিষেবা
বায়োইনফরম্যাটিকস
ট্রান্সক্রিপ্টোম অ্যাসেম্বলি এবং ইউনিজিন নির্বাচন
ইউনিজিন টীকা
জৈবিক প্রতিলিপিগুলির নমুনা পারস্পরিক সম্পর্ক এবং মূল্যায়ন
পৃথকভাবে প্রকাশিত জিন (ডিইজি)
Degs এর কার্যকরী টীকা
Degs এর কার্যকরী সমৃদ্ধি
বিএমকেজেনের ইউক্যারিওটিক এনজিএস এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলি প্রকাশনাগুলির একটি সংশোধিত সংগ্রহের মাধ্যমে পরিষেবাগুলির দ্বারা সহজতর অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন।
শেন, এফ। এট আল। (2020) 'আমুর ক্যাটফিশ (সিলুরাস অ্যাসোটাস) এর গোনাদগুলিতে ডি নভো ট্রান্সক্রিপ্টম অ্যাসেম্বলি এবং যৌন-পক্ষপাতদুষ্ট জিনের প্রকাশ', জিনোমিক্স, 112 (3), পৃষ্ঠা 2603–2614। doi: 10.1016/j.geno.2020.01.026।
জাং, সি। এট আল। (২০১)) 'পেঁয়াজের বাল্ব ফোলা এবং বিকাশের সময় সুক্রোজ বিপাকের ট্রান্সক্রিপ্টম বিশ্লেষণ (অ্যালিয়াম সিইপিএ এল।)', উদ্ভিদ বিজ্ঞানের সীমান্ত, 7 (সেপ্টেম্বর), পি। 212763। doi: 10.3389/fpls.2016.01425/Bibtex।
ঝু, সি। এট আল। (2017) 'ডি নভো অ্যাসেম্বলি, সারকোচিলিচথিস সিনেনসিসের ট্রান্সক্রিপ্টোমের জন্য চরিত্রায়ন এবং টীকা', পিএলওএস ওয়ান, 12 (2)। doi: 10.1371/জার্নাল.পোন .0171966।
জু, এল। এট আল। (2021) 'ডি নভো ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণ লবণাক্ততার চাপের অধীনে পডোকার্পাস ম্যাক্রোফিলাসের লবণের সহনশীলতার অন্তর্দৃষ্টি সরবরাহ করে', বিএমসি উদ্ভিদ জীববিজ্ঞান, 21 (1), পৃষ্ঠা 1–17। doi: 10.1186/s12870-021-03274-1/চিত্র/9।
