রেফারেন্স জিনোম সহ mRNA-seq (NGS)
আরএনএ-সেক হল জীবন ও শস্য বিজ্ঞানের একটি আদর্শ হাতিয়ার, যা জিনোম এবং প্রোটিওমের মধ্যে ব্যবধান পূরণ করে। এটির শক্তি নতুন প্রতিলিপি আবিষ্কার এবং একটি পরীক্ষায় তাদের অভিব্যক্তি পরিমাপ করা। এটি তুলনামূলক ট্রান্সক্রিপ্টমিক অধ্যয়নের জন্য ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়, বিভিন্ন বৈশিষ্ট্য বা ফিনোটাইপের সাথে সম্পর্কিত জিনের উপর আলোকপাত করা, যেমন মিউট্যান্টদের বন্য-প্রকারের সাথে তুলনা করা বা নির্দিষ্ট পরিস্থিতিতে জিনের অভিব্যক্তি প্রকাশ করা। BMKCloud mRNA(রেফারেন্স) APP এক্সপ্রেশন কোয়ান্টিফিকেশন, ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন অ্যানালাইসিস (DEG), এবং সিকোয়েন্স স্ট্রাকচার অ্যানালাইসিসকে mRNA-seq(NGS) বায়োইনফরমেটিক্স পাইপলাইনে একীভূত করে এবং একই ধরনের সফ্টওয়্যারের শক্তি একত্রিত করে, সুবিধা এবং ব্যবহারকারী-বন্ধুত্ব নিশ্চিত করে। ব্যবহারকারীরা তাদের RNA-seq ডেটা ক্লাউডে আপলোড করতে পারে, যেখানে অ্যাপটি একটি ব্যাপক, এক-স্টপ বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ সমাধান সরবরাহ করে। উপরন্তু, এটি গ্রাহকের অভিজ্ঞতাকে অগ্রাধিকার দেয়, ব্যবহারকারীদের নির্দিষ্ট চাহিদা অনুযায়ী ব্যক্তিগতকৃত ক্রিয়াকলাপ অফার করে। ব্যবহারকারীরা পরামিতি সেট করতে এবং নিজেরাই পাইপলাইন মিশন জমা দিতে পারেন, ইন্টারেক্টিভ রিপোর্ট পরীক্ষা করতে পারেন, ডেটা/ডায়াগ্রাম দেখতে পারেন এবং ডেটা মাইনিং সম্পূর্ণ করতে পারেন, যেমন: টার্গেট জিন নির্বাচন, কার্যকরী ক্লাস্টারিং, ডায়াগ্রামিং ইত্যাদি।
প্ল্যাটফর্ম:ইলুমিনা, এমজিআই
কৌশল:RNA-Seq
লেআউট: প্যারেড, ক্লিন-ডেটা।
লাইব্রেরি প্রকার:fr-unstranded, fr-firststrand বা fr-সেকেন্ডস্ট্র্যান্ড
পড়ার দৈর্ঘ্য:150 bp
ফাইলের ধরন:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz বা *.fq.gz। সিস্টেম হবেস্বয়ংক্রিয়ভাবে .fastq ফাইলগুলিকে তাদের ফাইলের নাম অনুসারে যুক্ত করুন,যেমন *_1.fastq *._2.fastq এর সাথে যুক্ত।
নমুনার সংখ্যা:সংখ্যার উপর কোন সীমাবদ্ধতা নেইনমুনা, কিন্তু বিশ্লেষণ সময় সংখ্যা হিসাবে বৃদ্ধি হবেনমুনা বৃদ্ধি পায়।
প্রস্তাবিত ডেটা পরিমাণ:প্রতি নমুনা 6G