জিনোম বিবর্তন, প্যাঞ্জেনোম
প্যান-জেনোম কী?
জমে থাকা প্রমাণগুলি দেখায় যে একটি প্রজাতির বিভিন্ন স্ট্রেনের মধ্যে বৈচিত্র্য বিশাল হতে পারে। একটি একক জিনোম একটি একক প্রজাতির জেনেটিক তথ্যের পুরো চিত্র অর্জন করতে যথেষ্ট দূরে। প্যান-জিনোম অধ্যয়নের উদ্দেশ্য হ'ল একটি প্রজাতির আরও বিস্তৃত জিনোমিক গ্রাফ প্রাপ্ত করা এবং অসংখ্য স্ট্রেনের জিনোম ডি নভো অ্যাসেম্বলি পরিচালনা করে বৈশিষ্ট্য এবং জিনগত কোডগুলির মধ্যে সম্পর্কগুলি ডিকোড করা, যা বিভিন্নতাগুলির গভীর এবং বিস্তৃত খনির অনুমতি দেয়।
প্যান-জেনোম অধ্যয়নের প্রবণতা

চিত্র 1 প্যান-জেনোমের প্রকাশিত গবেষণা পত্রগুলির প্রবণতা।
দ্রষ্টব্য: চিত্রটি প্রকৃতি, সেল এবং বিজ্ঞান সিরিজ জার্নালগুলিতে প্রকাশিত নিবন্ধগুলির শিরোনামগুলি অনুসন্ধানের মূল শব্দ হিসাবে "প্যান-জেনোম" গ্রহণের ফলাফল দেখায়
ক। একাধিক নমুনা থেকে পড়াগুলি একটি রেফারেন্সের সাথে সংযুক্ত করা হয় এবং স্বীকৃতগুলি উপন্যাসের সংমিশ্রণে একত্রিত হয়। মূল রেফারেন্স সিকোয়েন্সে এই উপন্যাসের সংমিশ্রণগুলি যুক্ত করে, একটি প্যাঞ্জেনোম রেফারেন্স তৈরি করা যেতে পারে। ডিসপেনসেবল অঞ্চলগুলি প্যাঙ্গেনোমে সমস্ত পঠন ম্যাপিংয়ের ভিত্তিতে নির্ধারিত হয়।
খ। একাধিক অ্যাক্সেসের জিনোমগুলির ডি নভো অ্যাসেম্বলি পুরো জিনোম প্রান্তিককরণ পদ্ধতির বিতরণযোগ্য জিনোমিক অঞ্চলগুলি সনাক্ত করতে দেয়।
গ। একটি প্যান-জেনোম গ্রাফ পুরো জিনোম প্রান্তিককরণ থেকে বা ডি নভো গ্রাফ অ্যাসেম্বলি দ্বারা নির্মিত হতে পারে, যা দক্ষতার সাথে গ্রাফের মাধ্যমে অনন্য পথ হিসাবে বিতরণযোগ্য অঞ্চলের বৈকল্পিক তথ্য সংরক্ষণ করে।
প্যান-জেনোম কীভাবে তৈরি করবেন?

চিত্র 2 প্যান-জেনোম পদ্ধতির তুলনা1
ক। একাধিক নমুনা থেকে পড়াগুলি একটি রেফারেন্সের সাথে সংযুক্ত করা হয় এবং স্বীকৃতগুলি উপন্যাসের সংমিশ্রণে একত্রিত হয়। মূল রেফারেন্স সিকোয়েন্সে এই উপন্যাসের সংমিশ্রণগুলি যুক্ত করে, একটি প্যাঞ্জেনোম রেফারেন্স তৈরি করা যেতে পারে। ডিসপেনসেবল অঞ্চলগুলি প্যাঙ্গেনোমে সমস্ত পঠন ম্যাপিংয়ের ভিত্তিতে নির্ধারিত হয়।
খ। একাধিক অ্যাক্সেসের জিনোমগুলির ডি নভো অ্যাসেম্বলি পুরো জিনোম প্রান্তিককরণ পদ্ধতির বিতরণযোগ্য জিনোমিক অঞ্চলগুলি সনাক্ত করতে দেয়।
গ। একটি প্যান-জেনোম গ্রাফ পুরো জিনোম প্রান্তিককরণ থেকে বা ডি নভো গ্রাফ অ্যাসেম্বলি দ্বারা নির্মিত হতে পারে, যা দক্ষতার সাথে গ্রাফের মাধ্যমে অনন্য পথ হিসাবে বিতরণযোগ্য অঞ্চলের বৈকল্পিক তথ্য সংরক্ষণ করে।
সম্প্রতি প্রকাশিত প্যান-জেনোমস
● ধর্ষণ প্যান-জেনোমস2

● টমেটো প্যান-জেনোমস 3

● ভাত প্যান -জেনোম4

● সূর্যমুখী প্যান-জেনোম5

● সয়াবিন প্যান-জেনোম 6

● ভাত প্যান-জেনোম7

● বার্লি প্যান-জেনোম8

● গম প্যান-জেনোম9

● জারগাম প্যান-জেনোম10

● ফাইটোপ্ল্যাঙ্কটন প্যান-জেনোম11

রেফারেন্স
1। বায়ার পিই, গোলিকজ এএ, শেবেন এ, ব্যাটলি জে, এডওয়ার্ডস ডি প্ল্যান্ট প্যান-জেনোমগুলি নতুন রেফারেন্স। নাট গাছপালা। 2020; 6 (8): 914-920। doi: 10.1038/s41477-020-0733-0
2। গান জেএম, গুয়ান জেড, হু জে, ইত্যাদি। আটটি উচ্চমানের জিনোমগুলি প্যান-জেনোম আর্কিটেকচার এবং ব্রাসিকা নেপাসের ইকোটাইপ পার্থক্য প্রকাশ করে। নাট গাছপালা। 2020; 6 (1): 34-45। doi: 10.1038/s41477-019-0577-7
3। গাও এল, গন্ডা প্রথম, সান এইচ, ইত্যাদি। টমেটো প্যান-জেনোম নতুন জিন এবং ফলের স্বাদকে নিয়ন্ত্রণকারী একটি বিরল অ্যালিল উদঘাটন করে। নাট জেনেট। 2019; 51 (6): 1044-1051। doi: 10.1038/s41588-019-0410-2
4। ঝাও কিউ, ফেং কিউ, লু এইচ, ইত্যাদি। প্যান-জিনোম বিশ্লেষণ চাষ করা এবং বন্য ধানের জিনোমিক পরিবর্তনের পরিমাণকে হাইলাইট করে [প্রকাশিত সংশোধন NAT জেনেটে প্রদর্শিত হয়। 2018 আগস্ট; 50 (8): 1196]। নাট জেনেট। 2018; 50 (2): 278-284। doi: 10.1038/s41588-018-0041-z
5। হাবনার এস, বার্কোভিচ এন, টোডেসকো এম, ইত্যাদি। সূর্যমুখী প্যান-জেনোম বিশ্লেষণ দেখায় যে সংকরকরণ জিনের সামগ্রী এবং রোগ প্রতিরোধের পরিবর্তন করেছে। নাট গাছপালা। 2019; 5 (1): 54-62। doi: 10.1038/s41477-018-0329-0
6। লিউ ওয়াই, ডু এইচ, লি পি, ইত্যাদি। বন্য এবং চাষ করা সয়াবিনের প্যান-জেনোম। সেল। 2020; 182 (1): 162-176.e13। doi: 10.1016/j.cell.2020.05.023
7। কিন পি, লু এইচ, ডু এইচ, ইত্যাদি। 33 জিনগতভাবে বিভিন্ন ধানের অ্যাক্সেসের প্যান-জিনোম বিশ্লেষণ লুকানো জিনোমিক বৈচিত্রগুলি প্রকাশ করে [প্রিন্টের আগে অনলাইনে প্রকাশিত, 2021 মে 25]। সেল। 2021; S0092-8674 (21) 00581-x। doi: 10.1016/j.cell.2021.04.046
8। জয়াকোদি এম, পদ্মারসু এস, হ্যাবারার জি, ইত্যাদি। বার্লি প্যান-জেনোম মিউটেশন প্রজননের লুকানো উত্তরাধিকার প্রকাশ করে। প্রকৃতি। 2020; 588 (7837): 284-289। doi: 10.1038/s41586-020-2947-8
9। ওয়াকোয়িয়াক এস, গাও এল, মোনাত সি, ইত্যাদি। একাধিক গম জিনোমগুলি আধুনিক প্রজননে বৈশ্বিক প্রকরণ প্রকাশ করে। প্রকৃতি। 2020; 588 (7837): 277-283। doi: 10.1038/s41586-020-2961-x
10। টাও ওয়াই, লুও এইচ, জু জে, ইত্যাদি। চাষ করা এবং বন্য জকরের প্যান-জেনোমের মধ্যে বিস্তৃত প্রকরণ [প্রিন্টের আগে অনলাইনে প্রকাশিত, 2021 মে 20]। নাট গাছপালা। 2021; 10.1038 / S41477-021-00925-x। doi: 10.1038/s41477-021-00925-x
11। ফ্যান এক্স, কিউ এইচ, হান ডাব্লু, ইত্যাদি। ফাইটোপ্ল্যাঙ্কটন পাঙ্গেনোম বিভিন্ন ফাংশনগুলির বিস্তৃত প্রোকারিয়োটিক অনুভূমিক জিন স্থানান্তর প্রকাশ করে। বিজ্ঞান অ্যাড। 2020; 6 (18): EABA0111। প্রকাশিত 2020 এপ্রিল 29
পোস্ট সময়: জানুয়ারী -04-2022