টি 2 টি জিনোম অ্যাসেম্বলি, গ্যাপ ফ্রি জিনোম
1stদুটি চাল জিনোম1
শিরোনাম: জিয়ান/ইন্ডিকা ভাতের জন্য দুটি গ্যাপ-মুক্ত রেফারেন্স জিনোমের সমাবেশ এবং বৈধতা উদ্ভিদ কেন্দ্রিক আর্কিটেকচারে অন্তর্দৃষ্টি প্রকাশ করে
Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
পোস্ট সময়: জানুয়ারী 01, 2021।
ইনস্টিটিউট: হুয়াজং কৃষি বিশ্ববিদ্যালয়, চীন
উপকরণ
ও। স্যাভা জিয়ান/ইন্ডিকাভাত জাতগুলি 'ঝেনশান 97 (জেডএস 97)' এবং 'মিংহুই 63 (এমএইচ 63)
সিকোয়েন্সিং কৌশল
এনজিএস রিডস + হাইফাই রিডস + সিএলআর রিডস + বায়োনানো + হাই-সি
ডেটা:
জেডএস 97: 8.34 জিবি （~ 23x） এইচআইএফআই পড়েছে + 48.39 জিবি (~ 131x) সিএলআর পড়েছে + 25 জিবি (~ 69x) এনজিএস + 2 বায়োনানো আইরিস সেলগুলি
এমএইচ 63: 37.88 জিবি (~ 103x) এইচআইএফআই পড়েছে + 48.97 জিবি (~ 132x) সিএলআর পড়েছে + 28 জিবি (~ 76x) এনজিএস + 2 বায়োনানো আইরিস সেলগুলি
চিত্র 1 চালের দুটি ফাঁকমুক্ত জিনোম (এমএইচ 63 এবং জেডএস 97)
2ndকলা জিনোম2
শিরোনাম: ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে কলাটির টেলোমির-টু-টেলোমির গ্যাপলেস ক্রোমোজোমগুলি
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
পোস্ট সময়: এপ্রিল 17, 2021।
ইনস্টিটিউট: ইউনিভার্সিটি প্যারিস-স্যাকলে, ফ্রান্স
উপকরণ
ডাবল হ্যাপলয়েডমুসা অ্যাকুমিনাটাএসপিপিমালাকেনসিস(ডিএইচ-পাশাং)
সিকোয়েন্সিং কৌশল এবং ডেটা:
HISEQ2500 PE250 মোড+ মিনিয়ন/ প্রমিথিয়ন (93 জিবি, ~ 200x)+ অপটিক্যাল মানচিত্র (ডেল -1+ বিএসপিকিউ 1)
সারণী 1 মুসা অ্যাকুমিনাটা (ডিএইচ-পাশাং) জিনোম অ্যাসেমব্লির তুলনা
চিত্র 2 মুসা জিনোম আর্কিটেকচার তুলনা
3rdফাইওড্যাকটাইলাম ট্রাইকর্নুটাম জিনোম3
শিরোনাম: টেলোমির-টু-টেলোমির জিনোম অ্যাসেম্বলিP
হাইওড্যাকটাইলাম ট্রাইকর্নুটাম
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.04.442596
পোস্ট সময়: মে 04, 2021
ইনস্টিটিউট: ওয়েস্টার্ন ইউনিভার্সিটি, কানাডা
উপকরণ
ফাইওড্যাকটাইলাম ট্রাইকর্নুটাম(শৈবাল এবং প্রোটোজোয়া সিসিএপি 1055/1 এর সংস্কৃতি সংগ্রহ)
সিকোয়েন্সিং কৌশল এবং ডেটা:
1 অক্সফোর্ড ন্যানোপুর মিনিয়ন ফ্লো সেল + এ 2 × 75 জোড়-শেষ মিড-আউটপুট নেক্সটসেক 550 রান
চিত্র 3 টেলোমির থেকে টেলোমির জিনোম অ্যাসেমব্লির জন্য কর্মপ্রবাহ
4thহিউম্যান সিএইচএম 13 জিনোম4
শিরোনাম: একটি মানব জিনোমের সম্পূর্ণ ক্রম
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
পোস্ট সময়: 27 মে, 2021
ইনস্টিটিউট: জাতীয় স্বাস্থ্য ইনস্টিটিউট (এনআইএইচ), মার্কিন যুক্তরাষ্ট্র
উপকরণ: সেল লাইন CHM13
সিকোয়েন্সিং কৌশল এবং ডেটা:
30 × প্যাকবিও বিজ্ঞপ্তি sens ক্যমত্য সিকোয়েন্সিং (এইচআইএফআই), 120 × অক্সফোর্ড ন্যানোপোর আল্ট্রা-লং রিড সিকোয়েন্সিং, 100 × ইলুমিনা পিসিআর-ফ্রি সিকোয়েন্সিং (আইএলএমএন), 70 × ইলুমিনা / আরিমা জিনোমিক্স হাই-সি (এইচআই-সি), বিওনানো অপটিক্যাল মানচিত্র, বিওনানো অপটিক্যাল মানচিত্র, এবং স্ট্র্যান্ড-সেক
সারণী 2 জিআরসিএইচ 38 এবং টি 2 টি-সিএইচএম 13 এর তুলনা হিউম্যান জিনোম অ্যাসেমব্লির
রেফারেন্স
1. সার্জি নুরক এট আল। একটি মানব জিনোমের সম্পূর্ণ ক্রম। BIORXIV 2021.05.26.445798; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2. ক্যারোলিন বেলসার এট আল। ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে কলাটির টেলোমির থেকে টেলোমির গ্যাপলেস ক্রোমোজোমগুলি। BIORXIV 2021.04.16.440017; doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3. ড্যানিয়েল জে। গিগুয়ের এট আল। টেলোমির থেকে টেলোমির জিনোম অ্যাসেম্বলি ফাইওড্যাকটাইলাম ট্রাইকর্নুটামের সমাবেশ। BIORXIV 2021.05.04.442596; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.04.442596
4. জিয়া-মিং গান এবং অন্যান্য। জিয়ান/ইন্ডিকা ভাতের জন্য দুটি গ্যাপ-মুক্ত রেফারেন্স জিনোমের সমাবেশ এবং বৈধতা উদ্ভিদ সেন্ট্রোমিয়ার আর্কিটেকচারে অন্তর্দৃষ্টি প্রকাশ করে। BIORXIV 2020.12.24.424073; doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
পোস্ট সময়: জানুয়ারী -06-2022