mRNA-seq (NGS)- De novo
mRNA সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে কোষে সমস্ত mRNA ট্রান্সক্রিপ্টের প্রোফাইলিংয়ের অনুমতি দেয় এবং এটি বিভিন্ন গবেষণার ক্ষেত্রে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত প্রযুক্তি। BMKCloud De novo mRNA-seq পাইপলাইন পলি-A সমৃদ্ধ সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরি বিশ্লেষণ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে যখন কোনো রেফারেন্স জিনোম পাওয়া যায় না। পাইপলাইন মান নিয়ন্ত্রণের সাথে শুরু হয়, তারপরেনতুনট্রান্সক্রিপ্ট সমাবেশ এবং ইউনিজিন সেট নির্বাচন। ইউনিজিন স্ট্রাকচার অ্যানালাইসিস কোডিং সিকোয়েন্স (সিডিএস) এবং সিম্পল সিকোয়েন্স রিপিটস (এসএসআর) ভবিষ্যদ্বাণী করে। পরবর্তীকালে, ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণে পরীক্ষিত অবস্থার মধ্যে ডিফারেন্সিয়ালভাবে প্রকাশিত জিন (DEGs) খুঁজে পাওয়া যায়, তারপরে জৈবিক অন্তর্দৃষ্টি বের করার জন্য DEG-এর কার্যকরী টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ।
বায়োইনফরমেটিক্স
