হাই-সি ভিত্তিক ক্রোমাটিন মিথস্ক্রিয়া
পরিষেবা বৈশিষ্ট্য
● PE150 এর সাথে ইলুমিনা নোভাসেক-এ সিকোয়েন্সিং।
● পরিষেবার জন্য টিস্যু নমুনা প্রয়োজন, নিষ্কাশিত নিউক্লিক অ্যাসিডের পরিবর্তে, ফর্মালডিহাইডের সাথে ক্রস-লিংক এবং ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া সংরক্ষণ করতে।
● হাই-সি পরীক্ষায় বায়োটিন দিয়ে স্টিকি প্রান্তের সীমাবদ্ধতা এবং শেষ মেরামত জড়িত, তারপরে মিথস্ক্রিয়াগুলি সংরক্ষণ করার সময় ফলস্বরূপ ভোঁতা প্রান্তগুলির বৃত্তাকার করা হয়। তারপর স্ট্রেপ্টাভিডিন পুঁতি দিয়ে ডিএনএ টেনে নামানো হয় এবং পরবর্তী লাইব্রেরি প্রস্তুতির জন্য শুদ্ধ করা হয়।
পরিষেবার সুবিধা
●সর্বোত্তম সীমাবদ্ধতা এনজাইম ডিজাইন: 93% পর্যন্ত বৈধ মিথস্ক্রিয়া জোড়া সহ বিভিন্ন প্রজাতির উচ্চ হাই-সি দক্ষতা নিশ্চিত করতে।
●বিস্তৃত দক্ষতা এবং প্রকাশনা রেকর্ড:BMKGene-এর 800টি বিভিন্ন প্রজাতি এবং বিভিন্ন পেটেন্ট থেকে >2000 হাই-সি সিকোয়েন্সিং প্রকল্পের বিশাল অভিজ্ঞতা রয়েছে। 100 টিরও বেশি প্রকাশিত কেস 900 টির বেশি একটি সঞ্চিত প্রভাব ফ্যাক্টর সহ।
●উচ্চ-দক্ষ বায়োইনফরমেটিক্স দল:হাই-সি পরীক্ষা এবং ডেটা বিশ্লেষণের জন্য ইন-হাউস পেটেন্ট এবং সফ্টওয়্যার কপিরাইট এবং একটি স্ব-উন্নত ভিজ্যুয়ালাইজেশন ডেটা সফ্টওয়্যার সহ।
●বিক্রয়োত্তর সমর্থন:আমাদের প্রতিশ্রুতি 3 মাসের বিক্রয়োত্তর পরিষেবার মেয়াদ সহ প্রকল্প সমাপ্তির বাইরে প্রসারিত। এই সময়ের মধ্যে, আমরা ফলাফলের সাথে সম্পর্কিত যেকোন প্রশ্নের সমাধান করতে প্রকল্প ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং প্রশ্নোত্তর সেশন অফার করি।
●ব্যাপক টীকা: আমরা চিহ্নিত বৈচিত্র সহ জিনগুলিকে কার্যকরীভাবে টীকা করার জন্য একাধিক ডেটাবেস ব্যবহার করি এবং একাধিক গবেষণা প্রকল্পের অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে সংশ্লিষ্ট সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ সম্পাদন করি।
পরিষেবা নির্দিষ্টকরণ
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | প্রস্তাবিত ডেটা আউটপুট | হাই-সি সিগন্যাল রেজোলিউশন |
| হাই-সি লাইব্রেরি | ইলুমিনা PE150 | ক্রোমাটিন লুপ: 150x TAD: 50x | ক্রোমাটিন লুপ: 10Kb TAD: 40Kb |
পরিষেবার প্রয়োজনীয়তা
| নমুনার ধরন | প্রয়োজনীয় পরিমাণ |
| প্রাণীর টিস্যু | ≥2 গ্রাম |
| পুরো রক্ত | ≥2mL |
| ছত্রাক | ≥1 গ্রাম |
| উদ্ভিদ- তরুণ টিস্যু | 1g/অ্যালিকোট, 2-4 অ্যালিকোট বাঞ্ছনীয় |
| সভ্য কোষ | ≥1x107 |
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● কাঁচা ডেটা QC;
● ম্যাপিং এবং হাই-সি লাইব্রেরি QC: বৈধ মিথস্ক্রিয়া জোড়া এবং ইন্টারঅ্যাকশন ক্ষয় সূচক (IDEs);
● জিনোম-ওয়াইড ইন্টারঅ্যাকশন প্রোফাইলিং: সিআইএস/ট্রান্স বিশ্লেষণ এবং হাই-সি মিথস্ক্রিয়া মানচিত্র;
● A/B কম্পার্টমেন্ট বিতরণের বিশ্লেষণ;
● TAD এবং ক্রোমাটিন লুপ সনাক্তকরণ;
● নমুনাগুলির মধ্যে 3D ক্রোমাটিন গঠন উপাদানগুলির উপর ডিফারেনশিয়াল বিশ্লেষণ এবং সংশ্লিষ্ট জিনের সংশ্লিষ্ট কার্যকরী টীকা।
Cis এবং ট্রান্স অনুপাত বন্টন
নমুনার মধ্যে ক্রোমোসোমাল মিথস্ক্রিয়াগুলির হিটম্যাপ
A/B কম্পার্টমেন্টের জিনোম-ওয়াইড ডিস্ট্রিবিউশন
ক্রোমাটিন লুপের জিনোম-ওয়াইড ডিস্ট্রিবিউশন
TADs এর ভিজ্যুয়ালাইজেশন
বিএমকেজিনের হাই-সি সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সুগম করা গবেষণার অগ্রগতিগুলি প্রকাশনাগুলির একটি কিউরেটেড সংগ্রহের মাধ্যমে অন্বেষণ করুন৷
মেং, টি. এট আল। (2021) 'একটি তুলনামূলক সমন্বিত মাল্টি-ওমিক্স বিশ্লেষণ CA2 কে কর্ডোমার জন্য একটি অভিনব লক্ষ্য হিসাবে চিহ্নিত করে',নিউরো-অনকোলজি, 23(10), পৃ. 1709-1722। doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156।
জু, এল. এট আল। (2021) 'জিনোমের 3D অব্যবস্থাপনা এবং পুনর্বিন্যাস ইন্টিগ্রেটেড হাই-সি, ন্যানোপোর এবং আরএনএ সিকোয়েন্সিং দ্বারা NAFLD-এর প্যাথোজেনেসিসের অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে',অ্যাক্টা ফার্মাসিউটিকা সিনিকা বি, 11(10), পৃ. 3150-3164। doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022।
