BMKCloud লগ ইন করুন

নমনীয় বিশ্লেষণ অ্যাপ্লিকেশন

wps_doc_5

ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ বিশ্লেষণ (রেফারেন্স ভিত্তিক এবং ডি নভো বিকল্প উপলব্ধ)

এই পাইপলাইনটি ইনপুট হিসাবে NGS RNA-Seq ডেটা ব্যবহার করে এবং একাধিক ডাউনস্ট্রিম বিশ্লেষণ থেকে ফলাফল তৈরি করে যার মধ্যে রয়েছে কিন্তু এতে সীমাবদ্ধ নয়: সিকোয়েন্সিং ডেটা গুণমান মূল্যায়ন,নতুনট্রান্সক্রিপশন সাইট টীকা, পরিবর্তনশীল স্প্লাইসিং বিশ্লেষণ, ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ, ফাংশন টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ।

দীর্ঘ নন-কোডিং আরএনএ বিশ্লেষণ

লং নন-কোডিং RNAs (lncRNA) হল নন-কোডিং ট্রান্সক্রিপ্ট যার দৈর্ঘ্য 200 nt-এর বেশি এবং ক্রোমাটিন সংগঠন এবং নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা পালন করতে পরিচিত। উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি এবং বায়োইনফরম্যাটিক গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক ফাংশনগুলির সাথে lncRNA সনাক্ত করতে আমাদের বোঝার lncRNA ক্রম এবং অবস্থানের তথ্যকে শক্তিশালী করেছে। এই পাইপলাইনটি ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ বিশ্লেষণ পাইপলাইনে উল্লিখিত বিশ্লেষণগুলি ছাড়াও lncRNA বিশ্লেষণ প্রদান করে।

 

wps_doc_6
wps_doc_7

16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং

অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং মাইক্রোবিয়াল ডাইভারসিটি অ্যানালাইসিস পাইপলাইন মাইক্রোবিয়াল ডাইভারসিটি প্রোজেক্ট অ্যানালাইসিসে বছরের অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে তৈরি করা হয়েছিল। পাইপলাইনে প্রমিত মৌলিক বিশ্লেষণ রয়েছে, যা বর্তমান মাইক্রোবিয়াল গবেষণা এবং ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণের মূলধারার বিশ্লেষণ বিষয়বস্তুকে কভার করে। বিশ্লেষণ প্রতিবেদনটি সমৃদ্ধ এবং ব্যাপক, বিভিন্ন ব্যক্তিগত বিশ্লেষণ করার বিকল্প সহ। অতিরিক্তভাবে, অতিরিক্ত কাস্টমাইজেশন এবং নিয়ন্ত্রণের জন্য নমুনা এবং গোষ্ঠীগুলি ফ্লাইতে পরিবর্তন করা যেতে পারে।

শটগান মেটাজেনমিক্স বিশ্লেষণ

শটগান মেটাজেনমিক অ্যানালাইসিস পাইপলাইন পরিবেশগত নমুনা থেকে বের করা মিশ্র জিনোমিক উপাদান থেকে এনজিএস ডেটা ব্যবহার করে। অন্তর্ভুক্ত বিশ্লেষণগুলি প্রজাতির বৈচিত্র্য এবং প্রাচুর্য, জনসংখ্যার গঠন, ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক, কার্যকরী জিন এবং পরিবেশগত কারণগুলির সাথে পারস্পরিক সম্পর্ক নেটওয়ার্কগুলির উপর বিস্তারিত তথ্য প্রদান করে।

wps_doc_8
wps_doc_9

NGS-WGS বৈকল্পিক বিশ্লেষণ

এনজিএস-ডব্লিউজিএস ভেরিয়েন্ট অ্যানালাইসিস হল একটি সমন্বিত বৈকল্পিক সনাক্তকরণ পাইপলাইন যা ডেটা গুণমান নিয়ন্ত্রণ, সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট, টীকা এবং জিন মিউটেশন বিশ্লেষণ করে। পাইপলাইনটি SNP এবং InDel সনাক্তকরণের জন্য GATK সর্বোত্তম অনুশীলন অনুসরণ করে এবং কাঠামোগত বৈকল্পিক কলিংয়ের জন্য মানতা ব্যবহার করে।

জিনোম ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (GWAS)

GWAS পাইপলাইন হল একটি ডাউনস্ট্রিম বিশ্লেষণ যা পূর্বে তৈরি করা VCF ফাইল এবং সংশ্লিষ্ট ফেনোটাইপ ডেটাকে ইনপুট হিসাবে বিভিন্ন ব্যক্তিদের জন্য নেয়। নির্দিষ্ট পরিসংখ্যান পদ্ধতি ব্যবহার করে, জিডব্লিউএএস-এর লক্ষ্য হল ফিনোটাইপিক পার্থক্যের সাথে সম্পর্কযুক্ত জিনোম-ওয়াইড নিউক্লিওটাইড বৈচিত্রগুলি উন্মোচন করা। এটি জটিল মানব রোগ এবং উদ্ভিদ ও প্রাণীর জটিল বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে যুক্ত কার্যকরী জিন অন্বেষণে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।

wps_doc_10
wps_doc_11

বাল্ক সেগ্রিগেশন অ্যানালাইসিস (BSA)

বিএসএ বিশ্লেষণে বিচ্ছিন্ন জনসংখ্যা থেকে চরম ফেনোটাইপিক বৈশিষ্ট্যযুক্ত ব্যক্তিদের পুল করা জড়িত। পুল করা নমুনাগুলির মধ্যে ডিফারেনশিয়াল লোকি তুলনা করে, এই পদ্ধতিটি লক্ষ্য জিনের সাথে সম্পর্কিত ঘনিষ্ঠভাবে সংযুক্ত আণবিক মার্কারগুলিকে দ্রুত সনাক্ত করে। উদ্ভিদ ও প্রাণীর জেনেটিক ম্যাপিংয়ে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়, এটি মার্কার-সহায়ক প্রজননের জন্য একটি মূল্যবান হাতিয়ার।

বিবর্তনীয় জেনেটিক্স বিশ্লেষণ

বিবর্তনীয় জেনেটিক্স বিশ্লেষণ কর্মপ্রবাহ জেনেটিক বিবর্তন প্রকল্পগুলিতে BMKGENE-এর ব্যাপক অভিজ্ঞতা লাভ করে এবং এর মধ্যে রয়েছে ফাইলোজেনেটিক ট্রি নির্মাণ, সংযোগের ভারসাম্য বিশ্লেষণ, জেনেটিক বৈচিত্র্যের মূল্যায়ন, নির্বাচনী ঝাড়ু সনাক্তকরণ, আত্মীয়তা বিশ্লেষণ, প্রধান উপাদান, জনসংখ্যার গঠন এবং চরিত্রায়ন।

wps_doc_12

একটি উদ্ধৃতি পেতে

এখানে আপনার বার্তা লিখুন এবং আমাদের পাঠান

আমাদের কাছে আপনার বার্তা পাঠান: