ডিএনএ/আরএনএ সিকোয়েন্সিং -প্যাকবিও সিকোয়েন্সার
বৈশিষ্ট্য
প্যাকবিও সিকোয়েন্সারে দুটি সিকোয়েন্সিং মোড: অবিচ্ছিন্ন দীর্ঘ পঠন (সিএলআর) এবং বিজ্ঞপ্তি sens ক্যমত্য রিড (সিসিএস)
| সিকোয়েন্সিং মোড | গ্রন্থাগারের আকার | তাত্ত্বিক তথ্যফলন (প্রতি সেল) | একক-বেসনির্ভুলতা | অ্যাপ্লিকেশন |
| সিএলআর | 20 কেবি, 30 কেবি, ইত্যাদি | 80 জিবি থেকে 130 জিবি | প্রায় 85% | ডি নভো, এসভি কলিং, ইত্যাদি |
| সিসিএস | 15-20 কেবি | 14 থেকে 40 জিবি/সেল (সিক্যুয়াল II) 70 থেকে 110 জিবি/সেল (রেভিও) নমুনাগুলির উপর নির্ভর করে | প্রায় 99% | ডি নভো, এসএনপি/ইন্ডেল/এসভি কলিং, আইএসও-সিক, |
রেভিও এবং সিক্যুয়াল II এর পারফরম্যান্স এবং বৈশিষ্ট্যগুলির তুলনা
| শর্তাদি | সিক্যুয়াল II সিস্টেম | রেভিও সিস্টেম | বৃদ্ধি |
| উচ্চ ঘনত্ব | 8 মিলিয়ন জেডএমডাব্লু | 25 মিলিয়ন জেডএমডাব্লু | 3x |
| স্বতন্ত্র পর্যায় | 1 | 4 | 4x |
| সংক্ষিপ্ত রান সময় | 30 ঘন্টা | 24 ঘন্টা | 1.25x |
| 30x হাইফাই হিউম্যান জিনোম / বছর | 88 | 1,300 | 1সামগ্রিকভাবে 5x |
পরিষেবা সুবিধা
Pac প্যাকবিও সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মে বিভিন্ন প্রজাতির সাথে হাজার হাজার বন্ধ প্রকল্পের সাথে 8 বছরেরও বেশি অভিজ্ঞতা।
PA
● দ্রুত টার্ন-চারপাশের সময়, উচ্চতর ডেটা ফলন এবং আরও সঠিক ডেটা।
Pack শত শত উচ্চ-প্রভাব প্যাকবিও-ভিত্তিক প্রকাশনাগুলিতে অবদান।
নমুনা প্রয়োজনীয়তা
| নমুনা প্রকার | পরিমাণ | ঘনত্ব （qubit®） | ভলিউম | বিশুদ্ধতা | অন্যরা |
| জিনোমিক ডিএনএ | ডেটা প্রয়োজনীয়তার উপর নির্ভর করে | ≥50 এনজি/μL | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230 = 1.8-2.5 ； 260 এনএম এ পরিষ্কার শিখর ，কোনও দূষণ নেই | ঘনত্ব কুইট এবং কুইট/ন্যানোপোর = 0.8-2.5 দ্বারা পরিমাপ করা দরকার |
| মোট আরএনএ | .21.2μg | ≥120 এনজি/μL | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ；কোনও দূষণ নেই | রিন মান ≥7.5 5্যা 28 এস/18 এস 201 |
পরিষেবা কর্মপ্রবাহ
নমুনা প্রস্তুতি
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
প্রকল্প বিতরণ
1. ইন-হাউস ডেটা ফলন
63 সিসিএস কোষ থেকে উত্পন্ন ডেটা (26 প্রজাতি থেকে)
| ডেটা-প্যাকবিও-সিসিএস -15 কেবি | গড় | সর্বোচ্চ | মিনিট | মধ্যম |
| ফলন - subreads (জিবি) | 421.12 | 544.27 | 221.38 | 426.58 |
| ইয়েলড - সিসিএস (জিবি) | 25.93 | 38.59 | 10.86 | 25.43 |
| পলিমারেজ এন 50 | 145,651 | 175,430 | 118,118 | 144,689 |
| Subreads n50 | 17,509 | 23,924 | 12,485 | 17,584 |
| সিসিএস এন 50 | 14,490 | 19,034 | 9,876 | 14,747 |
| গড় দৈর্ঘ্য-পলিমারেজ | 67,995 | 89,379 | 49,664 | 66,433 |
| গড় দৈর্ঘ্য-সাব্রেডস | 15,866 | 21,036 | 11,657 | 16,012 |
| গড় দৈর্ঘ্য-সিসি | 14,489 | 19,074 | 8,575 | 14,655 |
16 সিএলআর কোষ থেকে উত্পন্ন ডেটা (76 প্রজাতি থেকে)
| ডেটা-প্যাকবিও-সিএলআর -30 কেবি | গড় | সর্বোচ্চ | মিনিট | মধ্যম |
| ফলন - subreads (জিবি) | 142.20 | 291.40 | 50.55 | 142.49 |
| পলিমারেজ এন 50 | 39,456 | 121,191 | 15,389 | 35,231 |
| Subreads n50 | 28,490 | 41,012 | 14,430 | 29,063 |
| গড় দৈর্ঘ্য-পলিমারেজ | 22,063 | 48,886 | 8,747 | 21,555 |
| গড় দৈর্ঘ্য-সাব্রেডস | 17,720 | 27,225 | 8,293 | 17,779 |
2.ডাটা কিউসি - ডেমোডেটা ফলনের পরিসংখ্যান
| নমুনা | সিসিএস নামটি পড়েছে | মোট সিসিএস ঘাঁটি (বিপি) | সিসিএস এন 50 (বিপি) রিডস | সিসিএস মানে দৈর্ঘ্য (বিপি) | সিসিএস দীর্ঘতম পঠন (বিপি) | সাব্রেডস বেসগুলি (বিপি) | সিসিএস হার (%) |
| Pb_bmkxxx | 3,444,159 | 54,164,122,586 | 15,728 | 15,726 | 36,110 | 863,326,330,465 | 6.27 |
