ডি নভো ব্যাকটিরিয়া জিনোম সমাবেশ
আমরা 0 ফাঁক গ্যারান্টি দিয়ে একটি সম্পূর্ণ ব্যাকটিরিয়া জিনোম অ্যাসেম্বলি পরিষেবা সরবরাহ করি। সমাবেশের জন্য ন্যানোপুর এবং প্যাকবিওর মতো দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তিগুলিকে সংহত করে এবং ওএনটি রিডগুলির ত্রুটি সংশোধন করার জন্য ইলুমিনার সাথে সংক্ষিপ্ত-পঠন সিকোয়েন্সিংয়ের মতো দীর্ঘ-পঠন সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তিগুলিকে সংহত করে এটি সম্ভব। আমাদের পরিষেবাটি নির্দিষ্ট গবেষণার লক্ষ্য পূরণ করে সমাবেশ, কার্যকরী টীকা এবং উন্নত বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ থেকে সম্পূর্ণ বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো সরবরাহ করে। এই পরিষেবাটি বিভিন্ন জিনগত এবং জিনোমিক অধ্যয়নের জন্য সুনির্দিষ্ট রেফারেন্স জিনোমগুলির বিকাশকে সক্ষম করে। অতিরিক্তভাবে, এটি স্ট্রেন অপ্টিমাইজেশন, জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং এবং মাইক্রোবায়াল প্রযুক্তি বিকাশের মতো অ্যাপ্লিকেশনগুলির ভিত্তি তৈরি করে, বৈজ্ঞানিক অন্তর্দৃষ্টি এবং জৈবপ্রযুক্তি উদ্ভাবনের অগ্রগতির জন্য নির্ভরযোগ্য এবং ফাঁক-মুক্ত জিনোমিক ডেটা নিশ্চিত করে।
পরিষেবা বৈশিষ্ট্য
Ne জিনোম সম্পূর্ণতার কাঙ্ক্ষিত ডিগ্রির উপর নির্ভর করে বেছে নেওয়ার জন্য দুটি সম্ভাব্য বিকল্প সহ।
● খসড়া জিনোম বিকল্প: ইলুমিনা নোভাসেক পিই 150 এর সাথে শর্ট-রিড সিকোয়েন্সিং।
0 0 গ্যাপ জিনোম সম্পূর্ণ করুন।
জিনোম অ্যাসেমব্লির জন্য ন্যানোপুর প্রমিথিয়ান 48 বা প্যাকবিও রেভিওতে দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিং।
জিনোম বৈধতা এবং ত্রুটি সংশোধন (ন্যানোপুর) এর জন্য বা একটি খসড়া জিনোম তৈরি করতে ইলুমিনা নোভাসেকের উপর সংক্ষিপ্ত-পঠন সিকোয়েন্সিং।
পরিষেবা সুবিধা
●জিরো-গ্যাপ জিনোমের গ্যারান্টিযুক্ত: এটি দীর্ঘ পঠন সিকোয়েন্সিং (ন্যানোপোর বা প্যাকবিও) এর সাথে ইলুমিনা সিকোয়েন্সিংয়ের সংহতকরণের কারণে।
●সম্পূর্ণ বায়োইনফরম্যাটিকস ওয়ার্কফ্লো:এর মধ্যে জিনোম সমাবেশ এবং একাধিক জিনোমিক উপাদানগুলির পূর্বাভাস, কার্যকরী জিন টীকা এবং সার্কোস প্লটের মতো জিনোম ভিজ্যুয়ালাইজেশন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।
●বিস্তৃত দক্ষতা: 20,000 এরও বেশি মাইক্রোবায়াল জিনোমগুলি একত্রিত হওয়ার সাথে সাথে বিএমকেজেন এক দশকেরও বেশি অভিজ্ঞতা, একটি অত্যন্ত দক্ষ বিশ্লেষণ দল, বিস্তৃত সামগ্রী এবং বিক্রয়-পরবর্তী দুর্দান্ত সমর্থন নিয়ে আসে।
●বিক্রয়-পরবর্তী সমর্থন:আমাদের প্রতিশ্রুতি 3 মাস পরে বিক্রয় পরিষেবা সময়কালের সাথে প্রকল্প সমাপ্তির বাইরেও প্রসারিত। এই সময়ের মধ্যে, আমরা ফলাফলের সাথে সম্পর্কিত যে কোনও প্রশ্নকে সম্বোধন করার জন্য প্রকল্পের ফলোআপ, ট্রাবলশুটিং সহায়তা এবং প্রশ্নোত্তর সেশনগুলি সরবরাহ করি।
●একাধিক সিকোয়েন্সিং কৌশল উপলব্ধ:বিভিন্ন গবেষণা লক্ষ্য এবং জিনোম সম্পূর্ণতার প্রয়োজনীয়তার জন্য।
পরিষেবা স্পেসিফিকেশন
| পরিষেবা | সিকোয়েন্সিং কৌশল |
| খসড়া জিনোম | ইলুমিনা পিই 150 100 এক্স |
| 0 ফাঁক জিনোম | ন্যানোপুর 100x + ইলুমিনা পিই 150 100x Or প্যাকবিও এইচআইএফআই 30 এক্স + ইলুমিনা পিই 150 100 এক্স (al চ্ছিক) |
নমুনার প্রয়োজনীয়তা:
| ঘনত্ব (এনজি/µl) | মোট পরিমাণ (µg) | ভলিউম (µl) | OD260/280 | ওডি 260/230 | |
| প্যাকবিও | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| ন্যানোপুর | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| ইলুমিনা | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· ব্যাকটিরিয়া: ≥3.5x1010 কোষ
পরিষেবা কাজের প্রবাহ
নমুনা বিতরণ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয় পরে পরিষেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● সিকোয়েন্সিং ডেটা কোয়ালিটি কন্ট্রোল
● জিনোম অ্যাসেম্বলি
● জিনোম উপাদান বিশ্লেষণ: সিডি এবং একাধিক জিনোমিক উপাদানগুলির পূর্বাভাস
Multiple একাধিক সাধারণ ডাটাবেস (জিও, কেজি, ইত্যাদি) এবং উন্নত ডাটাবেস (কার্ড, ভিএফডিবি ইত্যাদি) সহ কার্যকরী টীকা
● জিনোম ভিজ্যুয়ালাইজেশন
আমরা জিনোমকে সহজেই অ্যাক্সেসযোগ্য FASTA ফর্ম্যাট এবং জিনোম টীকা ফাইল (জিএফএফ) এ সরবরাহ করি।
জিন টীকা - যান
জিন টীকা - কেজি কার্বোহাইড্রেট
জিনোম ভিজ্যুয়ালাইজেশন - সার্কোস প্লট
বিএমকেজেনের ব্যাকটিরিয়া জিনোম অ্যাসেম্বলি পরিষেবাগুলি প্রকাশনাগুলির একটি সংশোধিত সংগ্রহের মাধ্যমে সহজতর অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন।
ডাই, ডাব্লু। এট আল। (2023) 'স্বাস্থ্যকর মানব কোলন থেকে আলসারেটিভ কোলাইটিসের চিকিত্সার জন্য একটি নিরাপদ এবং উপন্যাস প্রোবায়োটিক ব্যাকটিরিয়াম হিসাবে ব্যাকটেরয়েডস ইউনিফর্ম এফ 18-22 এর আবিষ্কার',মলিকুলার সায়েন্সেসের আন্তর্জাতিক জার্নাল, 24 (19), পি। 14669। doi: 10.3390/ijms241914669/s1।
কং, কি। এট আল। (2021) 'মাল্টিড্রাগ-প্রতিরোধী প্রোটিয়াস মীরাবিলিস বিচ্ছিন্নভাবে ব্লোক্সা -১ এবং ব্ল্যান্ডম -১ বহনকারী চীনের বন্যজীবন থেকে বিচ্ছিন্ন: জনস্বাস্থ্যের ঝুঁকি বাড়ানো',ইন্টিগ্রেটিভ প্রাণিবিদ্যা, 16 (6), পৃষ্ঠা 798–809। doi: 10.1111/1749-4877.12510।
ওয়াং, টিটি এট আল। (2017) 'এন্ডোফাইট ব্যাসিলাস ফ্লেক্সাস কেএলবিএমপি 4941 এর সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্স তার উদ্ভিদ বৃদ্ধি প্রচার প্রক্রিয়া এবং লবণ সহনশীলতার জন্য জিনগত ভিত্তি প্রকাশ করে',বায়োটেকনোলজির জার্নাল, 260, পৃষ্ঠা 38–41। doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001।
ওয়াং, এক্স। ইত্যাদি। )মাইক্রোবায়োলজিতে সীমান্ত, 12, পি। 754931। doi: 10.3389/fmicb.2021.754931/Bibtex।
