অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং(16S/18S/ITS)

ইলুমিনার সাথে অ্যামপ্লিকন (16S/18S/ITS) সিকোয়েন্সিং হল মাইক্রোবিয়াল প্রোফাইলগুলিকে তাদের ক্রম অনুসারে চিহ্নিত করে এবং তারপর প্রতিটি নমুনার মধ্যে এবং নমুনার মধ্যে সম্প্রদায়ের সমৃদ্ধি এবং বৈচিত্র্য বোঝার চেষ্টা করে মাইক্রোবায়াল বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করার একটি পদ্ধতি। BMKCloud Amplicon (NGS) পাইপলাইন 16S, 18S, ITS এবং একাধিক কার্যকরী জিন বিশ্লেষণ করতে দেয়। এটি রিড ট্রিমিং, পেয়ারড-এন্ড রিড অ্যাসেম্বলি এবং কোয়ালিটি অ্যাসেসমেন্ট দিয়ে শুরু হয়, তারপরে ছয়টি ভিন্ন অ্যানালাইসিস বিভাগে ব্যবহৃত অপারেশনাল ট্যাক্সোনমিক ইউনিট (OTUs) তৈরি করতে অনুরূপ রিডের ক্লাস্টারিং দ্বারা অনুসরণ করা হয়। শ্রেণীবিন্যাস টীকা প্রতিটি নমুনার আপেক্ষিক প্রাচুর্য এবং রচনার উপর তথ্য প্রদান করে, যখন আলফা এবং বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করে যথাক্রমে নমুনার মধ্যে এবং মধ্যে মাইক্রোবায়াল বৈচিত্র্যের উপর ফোকাস। গ্রুপের মধ্যে ডিফারেনশিয়াল অ্যানালাইসিস ওটিইউ খুঁজে পায় যা প্যারামেট্রিক এবং নন-প্যারামেট্রিক উভয় পরীক্ষা ব্যবহার করে ভিন্ন, যখন পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ এই পার্থক্যগুলিকে পরিবেশগত কারণগুলির সাথে সম্পর্কিত করে। পরিশেষে, মার্কার জিনের প্রাচুর্যের উপর ভিত্তি করে কার্যকরী জিনের প্রাচুর্যের পূর্বাভাস দেওয়া হয়, প্রতিটি নমুনায় কার্যকারিতা এবং বাস্তুবিদ্যার অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।