16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-প্যাকবিও
পরিষেবা বৈশিষ্ট্য
● সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম: PacBio Revio
● সিকোয়েন্সিং মোড: CCS (HiFi রিডস)
● HiFi SMRT বেল লাইব্রেরি প্রস্তুতির আগে অ্যামপ্লিকনগুলির টেন্ডেম লিঙ্কিং দ্বারা লক্ষ্য অঞ্চলের পরিবর্ধন
পরিষেবার সুবিধা
●উচ্চ শ্রেণীবিন্যাস রেজোলিউশন: টিহ্যান শর্ট-অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং,প্রজাতি স্তরে উচ্চতর OTU শ্রেণীবিভাগের হার সক্ষম করা।
●অত্যন্ত নির্ভুল বেস কলিং: PacBio CCS মোড সিকোয়েন্সিং (HiFi রিডস)।
●বিচ্ছিন্নতা-মুক্ত: পরিবেশগত নমুনাগুলিতে মাইক্রোবিয়াল রচনার দ্রুত সনাক্তকরণ।
●ব্যাপকভাবে প্রযোজ্য: বিভিন্ন জীবাণু সম্প্রদায় অধ্যয়ন.
●ব্যাপক বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ: সর্বশেষ QIIME2 প্যাকেজ (মাইক্রোবিয়াল ইকোলজির পরিমাণগত অন্তর্দৃষ্টি) ডাটাবেস, টীকা, OTU/ASV এর পরিপ্রেক্ষিতে বিভিন্ন বিশ্লেষণ সহ।
●ব্যাপক দক্ষতা: বার্ষিক পরিচালিত হাজার হাজার অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং প্রকল্পের সাথে, BMKGENE এক দশকেরও বেশি অভিজ্ঞতা, একটি অত্যন্ত দক্ষ বিশ্লেষণ দল, ব্যাপক বিষয়বস্তু, এবং বিক্রয়োত্তর চমৎকার সমর্থন নিয়ে আসে।
পরিষেবা নির্দিষ্টকরণ
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত |
| এমপ্লিকন | প্যাকবিও রিভিও | 10/30/50 K ট্যাগ (CCS) |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (ng/µL) | মোট পরিমাণ (µg) | আয়তন (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ
নমুনাগুলিকে তরল নাইট্রোজেনে 3-4 ঘন্টার জন্য হিমায়িত করুন এবং তরল নাইট্রোজেন বা -80 ডিগ্রিতে দীর্ঘমেয়াদী সংরক্ষণে সংরক্ষণ করুন। শুষ্ক-বরফ সহ নমুনা শিপিং প্রয়োজন।
সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো
নমুনা বিতরণ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
●কাঁচা তথ্য মান নিয়ন্ত্রণ
●OTU ক্লাস্টারিং/ডি-নোইজ(ASV)
●OTU টীকা
●আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: শ্যানন, সিম্পসন এবং ACE সহ একাধিক সূচক।
●বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ
●আন্তঃ-গ্রুপ বিশ্লেষণ
● পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ: পরিবেশগত কারণ এবং আউট রচনা এবং বৈচিত্র্যের মধ্যে
●16S কার্যকরী জিনের পূর্বাভাস
ট্যাক্সোনমিক ডিস্ট্রিবিউশনের হিস্টোগ্রাম
সম্প্রদায় বিতরণ ফাইলোজেনেটিক গাছ
আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: ACE
সূচক
বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: PCoA
আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ: আনোভা
প্রকাশনাগুলির একটি কিউরেটেড সংগ্রহের মাধ্যমে PacBio-এর সাথে BMKGene-এর অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সহজলভ্য অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন৷
গাও, এক্স. এবং ওয়াং, এইচ. (2023) 'আলপাইন মেরিনো ভেড়ার মধ্যে আল্পাইন মেরিনো ভেড়ার দুটি ক্রমবর্ধমান স্তরে একটি আলপাইন মেডোতে অভিযোজনের সময় রুমেন ব্যাকটেরিয়াল প্রোফাইল এবং ফাংশনগুলির তুলনামূলক বিশ্লেষণ', ফারমেন্টেশন, 9( 1), পৃ. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
লি, এস এট আল। (2023) 'কালচারমিক্স-ভিত্তিক মেটাজেনোমিক্স এবং উচ্চ-রেজোলিউশন বিশ্লেষণ ব্যবহার করে মরুভূমির মাটিতে মাইক্রোবায়াল ডার্ক ম্যাটার ক্যাপচার করা', এনপিজে বায়োফিল্মস এবং মাইক্রোবায়োমস 2023 9:1, 9(1), পৃষ্ঠা 1-14। doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'ফ্যাটি অ্যাসিড লবণের প্রভাব গাঁজন বৈশিষ্ট্য, ব্যাকটেরিয়া বৈচিত্র্য এবং আলফালফা, ধানের খড় এবং গমের ভুসি দিয়ে প্রস্তুত মিশ্র সাইলেজের বায়বীয় স্থিতিশীলতা', খাদ্য ও কৃষি বিজ্ঞানের জার্নাল, 102(4), পৃষ্ঠা। 1475– 1487। doi: 10.1002/JSFA.11482।
ইয়াং, জে. এট আল। (2023) 'অক্সিডেটিভ স্ট্রেস বায়োমার্কার এবং অন্ত্রের মাইক্রোবায়োটার মধ্যে মিথস্ক্রিয়া Sonchus brachyotus DC থেকে নির্যাসের অ্যান্টিঅক্সিডেন্ট প্রভাবে। ইন অক্সাজোলোন-প্ররোচিত অন্ত্রের অক্সিডেটিভ স্ট্রেস ইন অ্যাডাল্ট জেব্রাফিশ', অ্যান্টিঅক্সিডেন্টস 2023, ভলিউম। 12, পৃষ্ঠা 192, 12(1), পৃ. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192।
