16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-এনজিএস
পরিষেবা বৈশিষ্ট্য
● সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক।
● 16S, 18S এবং ITS এর সংক্ষিপ্ত অঞ্চলের প্রশস্তকরণ, অন্যান্য পরিবর্ধন লক্ষ্যগুলির মধ্যে।
● amplicon এর নমনীয় পছন্দ।
● একাধিক পরিবর্ধন লক্ষ্যের সাথে পূর্ববর্তী প্রকল্পের অভিজ্ঞতা।
পরিষেবার সুবিধা
●বিচ্ছিন্নতামুক্ত:পরিবেশগত নমুনাগুলিতে মাইক্রোবিয়াল রচনার দ্রুত সনাক্তকরণ।
●উচ্চ রেজোলিউশন: পরিবেশগত নমুনা মধ্যে কম-প্রচুর উপাদান.
●ব্যাপকভাবে প্রযোজ্য: বিভিন্ন জীবাণু সম্প্রদায় অধ্যয়ন.
●ব্যাপক বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ: সর্বশেষ QIIME2 প্যাকেজ (মাইক্রোবিয়াল ইকোলজির পরিমাণগত অন্তর্দৃষ্টি) ডাটাবেস, টীকা, OTU/ASV এর পরিপ্রেক্ষিতে বিভিন্ন বিশ্লেষণ সহ।
●ব্যাপক দক্ষতা: বার্ষিক পরিচালিত 150 হাজার অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং প্রকল্পের সাথে, BMKGENE এক দশকেরও বেশি অভিজ্ঞতা, একটি অত্যন্ত দক্ষ বিশ্লেষণ দল, ব্যাপক বিষয়বস্তু, এবং বিক্রয়োত্তর চমৎকার সমর্থন নিয়ে আসে।
পরিষেবা নির্দিষ্টকরণ
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত |
| এমপ্লিকন | ইলুমিনা PE250 | 50/100/300K ট্যাগ (পড়ুন জোড়া) |
পরিষেবার প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (ng/µL) | মোট পরিমাণ (এনজি) | আয়তন (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● মাটি/কাদা: 1-2 গ্রাম
● অন্ত্রের উপাদান-প্রাণী: 0.5-2 গ্রাম
● অন্ত্রের বিষয়বস্তু-পোকা: 0.1-0.25 গ্রাম
● উদ্ভিদ পৃষ্ঠ (সমৃদ্ধ পলল): 0.1-0.5 গ্রাম
● গাঁজন ঝোল সমৃদ্ধ পলল: 0.1-0.5 গ্রাম
● মল (বড় প্রাণী): 0.5-2 গ্রাম
● মল (মাউস): 3-5 দানা
● পালমোনারি অ্যালভিওলার ল্যাভেজ তরল: ফিল্টার পেপার
● ভ্যাজাইনাল সোয়াব: 5-6 টি সোয়াব
● ত্বক/জননাঙ্গের সোয়াব/লালা/ওরাল নরম টিস্যু/ফ্যারিঞ্জিয়াল সোয়াব/রেকটাল সোয়াব: 2-3টি সোয়াব
● সারফেস অণুজীব: ফিল্টার পেপার
● ওয়াটারবডি/এয়ার/বায়োফিল্ম: ফিল্টার পেপার
● এন্ডোফাইটস: 1-2 গ্রাম
● দাঁতের ফলক: 0.5-1 গ্রাম
সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো
নমুনা বিতরণ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
- কাঁচা ডেটা মান নিয়ন্ত্রণ
- ওটিইউ ক্লাস্টারিং /ডি-নাইজ (এএসভি)
- OTU টীকা
- আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: শ্যানন, সিম্পসন এবং ACE সহ একাধিক সূচক।
- বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ
- আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ
- পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ: পরিবেশগত কারণ এবং আউট রচনা এবং বৈচিত্র্যের মধ্যে
- 16S কার্যকরী জিনের পূর্বাভাস
ট্যাক্সোনমিক ডিস্ট্রিবিউশনের হিস্টোগ্রাম
ট্যাক্সোনমিক প্রাচুর্য ক্লাস্টারিং তাপ মানচিত্র
আলফা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: বিরল বক্ররেখা
বিটা বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ: NMDS
আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ: LEFSE বায়োমার্কার আবিষ্কার
প্রকাশনাগুলির একটি কিউরেটেড সংগ্রহের মাধ্যমে ইলুমিনার সাথে BMKGene-এর অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সহজলভ্য অগ্রগতিগুলি অন্বেষণ করুন৷
ডং, সি. এট আল। (2022) 'Asembly, Core Microbiota, and Function of the Rhizosphere Soil and Bark Microbiota in Eucommia ulmoides', Frontiers in Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.85537.
লি, ওয়াই এবং অন্যান্য। (2023) 'ইঁদুরের গার্ডনেরেলা ভ্যাজাইনালিস-প্ররোচিত ব্যাকটেরিয়া ভ্যাজিনোসিসের চিকিত্সার জন্য কৃত্রিম ব্যাকটেরিয়া কনসোর্টিয়া ট্রান্সপ্লান্টেশন', মাইক্রোবায়োম, 11(1), পিপি। 1-14। doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. এবং Liu, H. (2022) 'ভূমি-ভিত্তিক বন্ধ বায়োরিজেনারেটিভ লাইফ সাপোর্ট এক্সপেরিমেন্ট "লুনার প্যালেস 365"', এনভায়রনমেন্টাল মাইক্রোবায়োম, 17(1), পিপি। 1-20। doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
ইয়িন, এস. এট আল। (2022) 'নাইট্রোজেন রূপান্তর সম্পর্কিত কার্যকরী জিনের ফিডস্টক-নির্ভর প্রাচুর্য কম্পোস্টিংয়ে নাইট্রোজেনের ক্ষতি নিয়ন্ত্রিত', বায়োরিসোর্স টেকনোলজি, 361, পি. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
