Цяло транскриптно секвениране - Illumina
Характеристики
● Двойна библиотека за последователност на пълния транскрипт: изчерпване на RRNA, последвано от подготовка на библиотеката на PE150
● Пълен биоинформатичен анализ на мРНК, lncRNA, circRNA и miRNA в отделни доклади за биоинформатика
● Съвместен анализ на цялата експресия на РНК в комбиниран доклад, включително анализ на мрежите на CERNA.
Предимства на услугата
●Задълбочен анализ на регулаторните мрежи: Мрежовият анализ на CERNA е активиран чрез съвместно секвениране на мРНК, lncRNA, circRNA и miRNA и чрез изчерпателен биоинформатичен работен поток.
●Изчерпателна анотация: Използваме множество бази данни, за да активираме функционално различно експресираните гени (DEGs) и да извършим съответния анализ на обогатяването, като предоставяме представа за клетъчните и молекулярни процеси, които са в основата на отговора на транскриптома.
●Обширна експертиза: С опит в успешното затваряне на над 2100 цели проекта за препис в различни изследователски домейни, нашият екип носи богат опит на всеки проект.
●Строг контрол на качеството: Ние прилагаме основни контролни точки на всички етапи, от приготвяне и подготовка на библиотеката до секвениране и биоинформатика. Този щателен мониторинг гарантира предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
●Поддръжка след продажбата: Нашият ангажимент се простира извън завършването на проекта с 3-месечен период на обслужване след продажба. През това време ние предлагаме проследяване на проекта, помощ за отстраняване на неизправности и сесии за въпроси и отговори за справяне с всякакви заявки, свързани с резултатите
Примерни изисквания и доставка
| Библиотека | Стратегия за секвениране | Препоръчва се данни | Контрол на качеството |
| rRNA изчерпана | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Избран размер | Illumina SE50 | 10-20 м чете |
Изисквания за извадка:
Нуклеотиди:
| Конц. (Ng/μl) | Сума (μg) | Чистота | Почтеност |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограничено или никакво замърсяване на протеин или ДНК, показани на гел. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; Ограничено или никакво изходно повишаване на котата |
Препоръчителна доставка на проба
Контейнер: 2 ml тръба за центрофуга (калаено фолио не се препоръчва)
Етикетиране на проби: група+реплика например A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Пратка:
1. Сух лед: Пробите трябва да бъдат опаковани в торбички и да се заровят в сух лед.
2. Rnastable епруветки: РНК пробите могат да се изсушават в тръбата за стабилизиране на РНК (напр. Rnastable®) и се доставят при стайна температура.
Работен поток на сервиз
Дизайн на експеримента
Доставка на проба
Екстракция на РНК
Библиотечно строителство
Секвениране
Анализ на данните
Услуги след продажба
Биоинформатика
Преглед на експресията на РНК
Различно експресирани гени
Анализ на CERNA
Различно изразени miRNA и свързани с РНК
Разгледайте напредъка на изследванията, улеснени от BMKGene 'Цели транскриптни услуги за секвениране чрез курирана колекция от публикации.
Dai, Y. et al. (2022) „Изчерпателни експресионни профили на мРНК, LncRNAs и miRNA при болест на Кашин-Бек, идентифицирани чрез RNA-секвениране“, Molecular Omics, 18 (2), стр. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et al. (2022 г.) „Анализ на транскриптоми с пълна дължина на студената устойчивост на APIS Cerana в планината Changbai през периода на презимуване.“, Gene, 830, стр. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) „Приоритизиране на многоомиската интеграция на конкурентни ендогенни регулаторни мрежи за РНК при малки клетъчни рак на белия дроб: молекулярни характеристики и кандидати за лекарства“, Граници в онкологията, 12, стр. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et al. (2022) „Интегрираният анализ на експресионните профили на lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA разкрива нова представа за потенциалните механизми в отговор на нематоди на кореново-възел в фъстъците“, BMC геномика, 23 (1), стр. 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/фигури/7.
Yan, Z. et al. (2022) „Цело-транскриптомното секвениране на РНК подчертава молекулярните механизми, свързани с поддържането на качеството на следхранката в броколи чрез червено LED облъчване“, Биология и технология след прибиране на реколтата, 188, стр. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
