WGS (Nanopore)

Повторното следване на целия геном с нанопор е популярен метод за идентифициране на геномни варианти, по-специално структурни варианти (SVs), които се наричат ​​по-точно от секвениране с дълго четене, отколкото чрез секвениране с кратко четене. Тръбопроводът BMKCLOUD TGS-WGS (Nanopore) е проектиран да анализира данни от WGS проекти с Nanopore, използвайки висококачествен, добре познат референтен геном. Анализът започва с подрязване на четене и контрол на качеството, последвано от привеждане в съответствие с референтния геном, SV извикване и функционално анотация на SV-асоциирани гени, използвайки множество бази данни.