● Подготовката на библиотеката включва стъпка за избор на размер
● Биоинформатичен анализ, съсредоточен около прогнозата на miRNA и техните цели
●Изчерпателен анализ на биоинформатиката:Активиране на идентифицирането както на известни, така и на нови miRNAs, идентифициране на миРНК цели и съответна функционална анотация и обогатяване с множество бази данни (KEGG, GO)
●Строг контрол на качеството: Ние прилагаме основни контролни точки на всички етапи, от приготвяне и подготовка на библиотеката до секвениране и биоинформатика. Този щателен мониторинг гарантира предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
●Поддръжка след продажбата: Нашият ангажимент се простира извън завършването на проекта с 3-месечен период на обслужване след продажба. През това време ние предлагаме проследяване на проекта, помощ за отстраняване на неизправности и сесии за въпроси и отговори за справяне с всички заявки, свързани с резултатите.
●Обширна експертиза: С опит в успешното затваряне на множество проекти на SRNA, обхващащи над 300 вида в различни изследователски области, нашият екип носи богат опит на всеки проект.
Библиотека | Платформа | Препоръчителни данни | Данни QC |
Избран размер | Illumina SE50 | 10m-20m чете | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
Конц. (Ng/μl) | Сума (μg) | Чистота | Почтеност |
≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограничено или никакво замърсяване на протеин или ДНК, показани на гел. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Ограничено или никакво изходно повишаване на котата |
● Растения:
Корен, стъбло или венчелистче: 450 mg
Лист или семе: 300 mg
Плод: 1,2 g
● Животни:
Сърце или черва: 450 mg
Висцера или мозък: 240 mg
Мускул: 600 mg
Кости, коса или кожа: 1.5g
● Австороди:
Насекоми: 9G
Ракообразна: 450 mg
● Пълна кръв: 2 тръби
● Клетки: 106 клетки
● Серум и плазма:6 ml
Контейнер: 2 ml тръба за центрофуга (калаено фолио не се препоръчва)
Етикетиране на проби: група+реплика например A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Пратка:
1. Сух лед: Пробите трябва да бъдат опаковани в торбички и да се заровят в сух лед.
2. Rnastable епруветки: РНК пробите могат да се изсушават в тръбата за стабилизиране на РНК (напр. Rnastable®) и се доставят в стайна температура.
Биоинформатика
● Контрол на качеството на суровите данни
● СРНК класификация
● Изравняване на референтен геном
● Идентифициране на известна и нова miRNA
● Анализ на експресията на диференциалната miRNA
● Функционална анотация на миРНК целите
Идентифициране на miRNA: структура и дълбочина
Диференциална експресия на miRNA - хи -търсене на клъстериране
Функционална анотация на целта на различно изразените miRNAs
Разгледайте напредъка на изследванията, улеснени от услугите за секвениране на SRNA на BMKGene чрез курирана колекция от публикации.
Chen, H. et al. (2023) „Вирусните инфекции инхибират биосинтезата на сапонин и фотосинтезата в Panax notoginseng“, физиология на растенията и биохимия, 203, p. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) „Растителният FYVE -съдържащ домейн Free Free1 се свързва с компоненти на микропроцесори за потискане на биогенезата на miRNA“, съобщава EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/прегръдка.202255037/suppl_file/umb202255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) „MicroRNA AME-Bantam-3P контролира развитието на зениците на ларва, като насочва домейните на множествения епидермален растежен фактор до домейни 8 (MEGF8) в пчела, апис мелифера“, International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), p . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. et al. (2018) „Интегрираният анализ на miRNA и гените, свързани с качеството на месото, разкрива, че GGA-miR-140-5p влияе на интрамускулното отлагане на мазнини при пилета“, клетъчна физиология и биохимия, 46 (6), стр. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.