Exclusive Agency for Korea

条形банер-03

Продукти

  • Геномен асоциативен анализ

    Геномен асоциативен анализ

    Целта на Изследванията за асоцииране в целия геном (GWAS) е да се идентифицират генетични варианти (генотипове), свързани със специфични черти (фенотипове). Чрез внимателно изследване на генетичните маркери в целия геном при голям брой индивиди, GWAS екстраполира асоциациите генотип-фенотип чрез статистически анализи на ниво популация. Тази методология намира широко приложение при изследване на човешки заболявания и изследване на функционални гени, свързани със сложни черти при животни или растения.

    В BMKGENE предлагаме два начина за провеждане на GWAS върху големи популации: използване на секвениране на целия геном (WGS) или избор на метод за секвениране на геном с намалено представяне, вътрешно разработения специфичен локусно усилен фрагмент (SLAF). Докато WGS отговаря на по-малки геноми, SLAF се очертава като рентабилна алтернатива за изучаване на по-големи популации с по-дълги геноми, като ефективно минимизира разходите за секвениране, като същевременно гарантира висока ефективност при откриване на генетични маркери.

  • Едноядрено РНК секвениране

    Едноядрено РНК секвениране

    Развитието на техники за улавяне на една клетка и персонализирани библиотечни конструкции, съчетано с високопроизводително секвениране, направи революция в изследванията на генната експресия на ниво клетка. Този пробив позволява по-задълбочен и по-всеобхватен анализ на сложни клетъчни популации, преодоляване на ограниченията, свързани с осредняването на генната експресия върху всички клетки и запазване на истинската хетерогенност в тези популации. Докато секвенирането на едноклетъчна РНК (scRNA-seq) има неоспорими предимства, то среща предизвикателства в определени тъкани, където създаването на суспензия от една клетка се оказва трудно и изисква свежи проби. В BMKGene се справяме с това препятствие, като предлагаме едноядрено РНК секвениране (snRNA-seq), използвайки най-съвременната технология 10X Genomics Chromium. Този подход разширява спектъра от проби, подлежащи на анализ на транскриптоми на ниво една клетка.

    Изолирането на ядрата се осъществява чрез иновативния чип 10X Genomics Chromium, включващ осемканална микрофлуидна система с двойно кръстосване. В рамките на тази система, гел перли, включващи баркодове, праймери, ензими и едно ядро, са капсулирани в маслени капки с размер на нанолитър, образувайки Gel Bead-in-Emulsion (GEM). След образуването на GEM, клетъчният лизис и освобождаването на баркод се случват във всеки GEM. Впоследствие молекулите на иРНК се подлагат на обратна транскрипция в cDNAs, включвайки 10X баркодове и уникални молекулни идентификатори (UMI). Тези cDNAs след това се подлагат на стандартна секвенираща библиотека, улесняваща стабилно и цялостно изследване на профилите на генна експресия на ниво една клетка.

    Платформа: 10× Genomics Chromium и Illumina NovaSeq платформа

  • Секвениране на целия геном на растение/животно

    Секвениране на целия геном на растение/животно

    Секвенирането на целия геном (WGS), известно още като повторно секвениране, се отнася до секвенирането на целия геном на различни индивиди от видове с известни референтни геноми. На тази основа геномните различия на индивиди или популации могат да бъдат допълнително идентифицирани. WGS позволява идентифицирането на единичен нуклеотиден полиморфизъм (SNP), инсерционна делеция (InDel), вариация на структурата (SV) и вариация на броя на копията (CNV). SV съставляват по-голяма част от вариационната база от SNP и имат по-голямо въздействие върху генома, като значително засягат живите организми. Докато повторното секвениране на кратко четене е ефективно за идентифициране на SNP и InDels, повторното секвениране на дълго четене позволява по-прецизно идентифициране на големи фрагменти и сложни вариации.

  • 10x пространствен транскриптом на Genomics Visium

    10x пространствен транскриптом на Genomics Visium

    Пространствената транскриптомика е авангардна технология, която позволява на изследователите да изследват моделите на генна експресия в тъканите, като същевременно запазват техния пространствен контекст. Една мощна платформа в тази област е 10x Genomics Visium, съчетана със секвениране на Illumina. Принципът на 10X Visium се основава на специализиран чип с определена зона за улавяне, където се поставят тъканни срезове. Тази зона за улавяне съдържа петна с баркод, всяко от които съответства на уникално пространствено местоположение в тъканта. След това уловените РНК молекули от тъканта се маркират с уникални молекулни идентификатори (UMI) по време на процеса на обратна транскрипция. Тези петна с баркод и UMI позволяват прецизно пространствено картографиране и количествено определяне на генната експресия при разделителна способност на една клетка. Комбинацията от проби с пространствен баркод и UMI гарантира точността и специфичността на генерираните данни. Използвайки тази технология Spatial Transcriptomics, изследователите могат да придобият по-задълбочено разбиране на пространствената организация на клетките и сложните молекулярни взаимодействия, протичащи в тъканите, предлагайки безценна представа за механизмите, лежащи в основата на биологичните процеси в множество области, включително онкология, неврология, биология на развитието, имунология и ботанически изследвания.

    Платформа: 10X Genomics Visium и Illumina NovaSeq

  • Пълна дължина на иРНК секвениране-нанопора

    Пълна дължина на иРНК секвениране-нанопора

    Докато базираното на NGS mRNA секвениране е универсален инструмент за количествено определяне на генната експресия, неговото разчитане на кратки четения ограничава неговата ефикасност при сложни транскриптомни анализи. От друга страна, секвенирането на нанопори използва технология за дълго четене, което позволява секвенирането на транскрипти на мРНК с пълна дължина. Този подход улеснява цялостно изследване на алтернативно снаждане, сливане на гени, полиаденилиране и количествено определяне на изоформите на иРНК.

    Секвенирането на нанопори, метод, който разчита на електрически сигнали в реално време с една молекула на нанопора, осигурява резултати в реално време. Водена от моторни протеини, двойноверижната ДНК се свързва с нанопорни протеини, вградени в биофилм, като се развива, докато преминава през нанопорния канал при разлика в напрежението. Отличителните електрически сигнали, генерирани от различни бази на ДНК веригата, се откриват и класифицират в реално време, което улеснява точното и непрекъснато секвениране на нуклеотидите. Този иновативен подход преодолява ограниченията за кратко четене и осигурява динамична платформа за сложен геномен анализ, включително сложни транскриптомни изследвания, с незабавни резултати.

    Платформа: Nanopore PromethION 48

  • Секвениране на иРНК в пълна дължина -PacBio

    Секвениране на иРНК в пълна дължина -PacBio

    Докато NGS-базираната mRNA секвенция е универсален инструмент за количествено определяне на генната експресия, нейната зависимост от кратки четения ограничава използването му в сложни транскриптомни анализи. От друга страна, секвенирането на PacBio (Iso-Seq) използва технология за дълго четене, позволяваща секвенирането на транскрипти на мРНК с пълна дължина. Този подход улеснява цялостно изследване на алтернативен сплайсинг, генни сливания и полиаденилиране. Съществуват обаче и други възможности за количествено определяне на генната експресия поради голямото количество необходими данни. Технологията за секвениране на PacBio разчита на секвениране в реално време (SMRT) на една молекула, осигурявайки ясно предимство при улавяне на транскрипти на мРНК с пълна дължина. Този иновативен подход включва използването на вълноводи с нулев режим (ZMWs) и микроизработени ямки, които позволяват наблюдение в реално време на активността на ДНК полимераза по време на секвениране. В рамките на тези ZMW, ДНК полимеразата на PacBio синтезира комплементарна верига от ДНК, генерирайки дълги четения, които обхващат цялата иРНК транскрипция. Работата на PacBio в режим Circular Consensus Sequencing (CCS) подобрява точността чрез многократно секвениране на една и съща молекула. Генерираните HiFi показания имат точност, сравнима с NGS, което допълнително допринася за цялостен и надежден анализ на сложни транскриптомни характеристики.

    Платформа: PacBio Sequel II; PacBio Revio

  • Еукариотно иРНК секвениране-NGS

    Еукариотно иРНК секвениране-NGS

    Секвенирането на иРНК, универсална технология, дава възможност за цялостно профилиране на всички транскрипти на иРНК в клетките при специфични условия. Със своите широкообхватни приложения, този авангарден инструмент разкрива сложни профили на генна експресия, генни структури и молекулярни механизми, свързани с различни биологични процеси. Широко прието във фундаменталните изследвания, клиничната диагностика и разработването на лекарства, секвенирането на иРНК предлага прозрения в тънкостите на клетъчната динамика и генетичната регулация, предизвиквайки любопитство относно неговия потенциал в различни области.

    Платформа: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • Нереферентно базирано mRNA секвениране-NGS

    Нереферентно базирано mRNA секвениране-NGS

    Секвенирането на иРНК дава възможност за цялостно профилиране на всички транскрипти на иРНК в клетките при специфични условия. Тази авангардна технология служи като мощен инструмент, разкриващ сложни профили на генна експресия, генни структури и молекулярни механизми, свързани с различни биологични процеси. Широко прието във фундаменталните изследвания, клиничната диагностика и разработването на лекарства, секвенирането на иРНК предлага вникване в тънкостите на клетъчната динамика и генетичната регулация.

    Платформа: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • Дълго некодиращо секвениране-Illumina

    Дълго некодиращо секвениране-Illumina

    Дългите некодиращи РНК (lncRNA) са по-дълги от 200 нуклеотида, които притежават минимален кодиращ потенциал и са основни елементи в рамките на некодиращата РНК. Намерени в ядрото и цитоплазмата, тези РНК играят решаваща роля в епигенетичната, транскрипционната и посттранскрипционната регулация, подчертавайки тяхното значение при оформянето на клетъчни и молекулярни процеси. Секвенирането на LncRNA е мощен инструмент в клетъчната диференциация, онтогенезата и човешките заболявания.

    Платформа: Illumina NovaSeq

  • Секвениране на малка РНК-Illumina

    Секвениране на малка РНК-Illumina

    Малките РНК (sRNA) молекули включват микроРНК (miRNA), малки интерфериращи РНК (siRNA) и piwi-взаимодействащи РНК (piRNA). Сред тях miPHKs, дълги около 18-25 нуклеотида, са особено забележителни за техните основни регулаторни роли в различни клетъчни процеси. С тъканно-специфични и стадийно-специфични модели на експресия, miPHKs показват висока степен на консервация при различни видове.

    Платформа: Illumina NovaSeq

  • CircRNA секвениране-Illumina

    CircRNA секвениране-Illumina

    Циркулярното РНК секвениране (circRNA-seq) е за профилиране и анализиране на кръгови РНК, клас от РНК молекули, които образуват затворени вериги поради неканонични сплайсинг събития, осигурявайки на тази РНК повишена стабилност. Докато е доказано, че някои circRNAs действат като микроРНК гъби, изолират микроРНК и им пречат да регулират своите целеви иРНК, други circRNA могат да взаимодействат с протеини, да модулират генната експресия или да играят роля в клетъчните процеси. Анализът на експресията на circRNA дава представа за регулаторните роли на тези молекули и тяхното значение в различни клетъчни процеси, етапи на развитие и болестни състояния, като допринася за по-задълбочено разбиране на сложността на регулацията на РНК в контекста на генната експресия.

  • Секвениране на целия транскриптом – Illumina

    Секвениране на целия транскриптом – Illumina

    Секвенирането на целия транскриптом предлага цялостен подход за профилиране на различни РНК молекули, включващи кодиращи (mRNA) и некодиращи РНК (lncRNA, circRNA и miRNA). Тази техника улавя целия транскриптом на специфични клетки в даден момент, позволявайки холистично разбиране на клетъчните процеси. Известен също като „тотално РНК секвениране“, той има за цел да разкрие сложни регулаторни мрежи на ниво транскриптоми, позволявайки задълбочен анализ като конкурентна ендогенна РНК (ceRNA) и съвместен РНК анализ. Това бележи началната стъпка към функционална характеристика, особено при разкриването на регулаторните мрежи, включващи circRNA-miRNA-mRNA-базирани ceRNA взаимодействия.

  • Имунопреципитационно секвениране на хроматин (ChIP-seq)

    Имунопреципитационно секвениране на хроматин (ChIP-seq)

    Хроматиновата имунопреципитация (CHIP) е техника, която използва антитела за селективно обогатяване на ДНК-свързващи протеини и съответните им геномни цели. Неговата интеграция с NGS позволява профилиране в целия геном на ДНК цели, свързани с модификация на хистони, транскрипционни фактори и други ДНК-свързващи протеини. Този динамичен подход позволява сравнения на местата на свързване в различни типове клетки, тъкани или условия. Приложенията на ChIP-Seq обхващат от изучаване на транскрипционна регулация и пътища на развитие до изясняване на механизмите на заболяването, което го прави незаменим инструмент за разбиране на ландшафта на геномната регулация и напредък в терапевтичните прозрения.

    Платформа: Illumina NovaSeq

Изпратете вашето съобщение до нас: