Топлинна карта
Инструментът TeatMap приема матричен файл с данни като вход и позволява на потребителите да филтрират, нормализират и групират данни. Основният случай на употреба за топлинни карти е клъстер анализ на нивото на експресия на ген между различни проби.
Анотация на ген
Инструментът за анотация на ген изпълнява анотация на ген въз основа на подравняване на последователността на входните FASTA файлове срещу различни бази данни.
Основен инструмент за търсене на локално подравняване (Blast)
Инструментът за взривяване е BMKCloud интегрирана версия на NCBI Blast и може да се използва за изпълнение на същите функции, използвайки данни, качени в акаунта на BMKCloud.
CDS_UTR прогнозиране
Инструментът за прогнозиране на CDS_UTR е проектиран да прогнозира кодиращите региони (CDS) и некодиращите региони (UTR) в дадени транскрипционни последователности въз основа на резултатите от взрив срещу известни протеинови бази данни и резултати от прогнозиране на ORF.
Манхатън сюжет
Инструментът за сюжет на Манхатън позволява показване на експерименти с високи проби и обикновено се използва в проучвания за асоцииране в генома (GWAS).
Диаграма на Circos
Инструментът за диаграма на Circos осигурява ефективна визуализация на това как геномната характеристика се разпределя в целия геном. Общите характеристики включват количествени локуси, SNP, индели, варианти на структурни и копие.
Обогатяване на генната онтология (GO)
Инструментът за обогатяване на GO осигурява функционален анализ на обогатяването. Основният софтуер в този инструмент е пакетът TopGo-биокондуктор, който включва диференциален анализ на експресията, анализ на обогатяване и визуализация на резултатите.
Анализ на ко-експресия на ген с претеглена ген (WGCNA)
WGCNA е широко използван метод за извличане на данни за откриване на модули за съвместна експресия на ген. Той е приложим за различни набор от данни за експресия, включително данни за експресия на микрочипове и NGS.
InterproScan
Инструментът InterProScan осигурява анализ и класификация на интерпретно протеини.
Обогатяване на Кег
Инструментът за обогатяване на Go Kegg е проектиран за генериране на хистограма за обогатяване на GO, хистограма за обогатяване на KEGG и пътя на обогатяване на KEGG въз основа на предоставен ген набор и съответната пояснение.