Транскриптом с пълна дължина на Pacbio

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, позволява точна идентификация на изоформи на транскрипт, хвърляйки светлина върху алтернативното полиаденилиране и сплайсинг и водещо до по-точен анализ на генната експресия. BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome тръбопроводът е проектиран да анализира cDNA библиотеки, секвенирани в режим на кръгово консенсусно секвениране (CCS) и идентифицира нехимерни (FLNC) последователности с пълна дължина, които след това се групират в нередундантни транскрипти. Последващ BUSCO анализ оценява пълнотата на сглобяването на транскриптома. От сглобения транскриптом се извършват множество анализи: алтернативно снаждане, просто повторение на последователност (SSR), предсказване на lncRNA и съответните целеви гени, предсказване на нови гени, анализ на генно семейство, анализ на транскрипционен фактор и функционална анотация на транскрипти.