Геном

Хромозомен мащаб и анализ на генома на биомаса на реколтата лутариорипарий геном
Нанопорно секвениране | Illumina | Hi-C | RNA-секвениране | Филогения
В това проучване Biomarker Technologies предостави техническа поддръжка на секвениране на нанопор, сглобяване на геноми De Novo, Hi-C асистиран сглобяване и др.
Резюме
Mscanthus, Ризоматозно многогодишно растение, има голям потенциал за производство на биоенергия заради високата си биомаса и толерантност към стрес. Отчитаме хромозомен мащаб наMiscanthus lutarioripariusГеном чрез комбиниране на секвениране на Oxford Nanopore и Hi-C технологии. Сглобяването на 2.07-GB обхваща 96,64% от генома, с контиг N50 от 1,71 MB. Центромерните и теломерните последователности се сглобяват съответно за всички 19 хромозоми и хромозома 10. Алотетраплоидният произход на M. lutarioriparius е потвърден с помощта на центромерни сателитни повторения. Ясно са ясно демонстрирани тетраплоидната структура на генома и няколко хромозомни пренареждания спрямо сорго. Тандем дублиращи се гени наМ. Лутариорипарийса функционални обогатени не само по отношение на реакцията на стрес, но и за биосинтеза на клетъчната стена. Генските семейства, свързани с резистентността на болести, биосинтезата на клетъчната стена и транспортирането на метални йони, се разширяват значително и се развиват. Разширяването на тези семейства може да бъде важна геномна основа за подобряване на забележителните черти наМ. Лутариорипарий.
Основни статистически данни за сглобяването на генома


Фигура. Преглед на монтажа на генома на M. lutarioriparius
Новини и акценти Целите на споделянето на най -новите успешни случаи с Biomarker Technologies, улавяне на нови научни постижения, както и видни техники, прилагани по време на изследването.
Време за публикация: януари-05-2022