Exclusive Agency for Korea

条形 Банер-03

Новини

Геном

Nature_communications_logo

Хромозомен мащаб и анализ на генома на биомаса на реколтата лутариорипарий геном

Нанопорно секвениране | Illumina | Hi-C | RNA-секвениране | Филогения

В това проучване Biomarker Technologies предостави техническа поддръжка на секвениране на нанопор, сглобяване на геноми De Novo, Hi-C асистиран сглобяване и др.

Резюме

Mscanthus, Ризоматозно многогодишно растение, има голям потенциал за производство на биоенергия заради високата си биомаса и толерантност към стрес. Отчитаме хромозомен мащаб наMiscanthus lutarioripariusГеном чрез комбиниране на секвениране на Oxford Nanopore и Hi-C технологии. Сглобяването на 2.07-GB обхваща 96,64% от генома, с контиг N50 от 1,71 MB. Центромерните и теломерните последователности се сглобяват съответно за всички 19 хромозоми и хромозома 10. Алотетраплоидният произход на M. lutarioriparius е потвърден с помощта на центромерни сателитни повторения. Ясно са ясно демонстрирани тетраплоидната структура на генома и няколко хромозомни пренареждания спрямо сорго. Тандем дублиращи се гени наМ. Лутариорипарийса функционални обогатени не само по отношение на реакцията на стрес, но и за биосинтеза на клетъчната стена. Генските семейства, свързани с резистентността на болести, биосинтезата на клетъчната стена и транспортирането на метални йони, се разширяват значително и се развиват. Разширяването на тези семейства може да бъде важна геномна основа за подобряване на забележителните черти наМ. Лутариорипарий.

Основни статистически данни за сглобяването на генома

Новини-1
Новини-2

Фигура. Преглед на монтажа на генома на M. lutarioriparius

Новини и акценти Целите на споделянето на най -новите успешни случаи с Biomarker Technologies, улавяне на нови научни постижения, както и видни техники, прилагани по време на изследването.


Време за публикация: януари-05-2022

Изпратете вашето съобщение до нас: