Транскриптът е връзката между геномната генетична информация и протеома на биологичната функция. Регулирането на нивото на транскрипцията е най -важното и най -проучваният регулиран режим на организмите. Транскриптното секвениране може да се последовател на транскриптома по всяко време или при всяко състояние, с резолюция, точна към един нуклеотид. Той може динамично да отразява нивото на генна транскрипция, едновременно да идентифицира и количествено определя редки и нормални транскрипти и да предостави структурната информация на Проба специфични преписи.
Понастоящем технологията за секвениране на транскриптоми се използва широко в агрономията, медицината и други изследователски области, включително регулиране на развитието на животни и растения, адаптиране на околната среда, имунно взаимодействие, локализация на ген, видова генетична еволюция и откриване на тумор и генетично заболяване.