Метагеномика (NGS)

Метагеномиката на пушката с Illumina е популярен инструмент за изучаване на микробиоми чрез директно секвениране на ДНК от сложни проби, което позволява изследването както на таксономичното, така и на функционалното разнообразие. BMKCloud метагеномичен (NGS) тръбопровод започва с контрол на качеството и сглобяване на метагеноми, от който се предвиждат и се струпват в набори от данни, които са анотирани за функция и таксономия, използвайки множество бази данни. Тази информация се използва за анализиране на таксономичното разнообразие в рамките на пробата (алфа разнообразие) и междупробното разнообразие (бета разнообразие). Диференциалният анализ между групите намира OTU и биологичните функции, които се различават между двете групи, използващи както параметрични, така и непараметрични тестове, докато корелационният анализ свързва тези различия с факторите на околната среда.