lncrna

Дългите некодиращи РНК (lncRNA) са РНК, по-дълги от 200 нуклеотида с нисък кодиращ потенциал, но с критични регулаторни функции. Тръбопроводът BMKCloud lncRNA е проектиран да анализира библиотеки с изчерпани rRNA с висококачествен, добре анотиран референтен геном, чрез анализиране на експресията на lncRNA и mRNA заедно. След подрязване на четенето и контрол на качеството, четенията се подравняват към референтния геном за сглобяване на транскрипти, а последващият анализ на структурата на гена разкрива алтернативен сплайсинг и нови гени. Транскриптите се идентифицират като mRNAs или lncRNAs, а диференциалният експресионен анализ идентифицира диференциално експресирани lncRNAs, техните мишени и диференциално експресирани гени (DEGS). Както DEG, така и диференциално експресирани lncRNA мишени са функционално анотирани, за да намерят обогатени функционални категории.