Асоциацията за асоциация в целия геном (GWAS) има за цел да се идентифицират генетични варианти (генотип), свързани със специфични черти (фенотип). Изследванията на GWA изследват генетичните маркери, които преминават през целия геном на голям брой индивиди и прогнозира асоциации на генотип-фенотип чрез статистически анализ на ниво популация. Остарението на целия геном може потенциално да открие всички генетични варианти. Свързване с фенотипни данни, GWAS може да бъде обработено, за да се идентифицират SNP, QTL и кандидат -гени, свързани с фенотип, които силно подкрепят съвременното размножаване на животни/растения. SLAF е самостоятелно разработена опростена стратегия за секвениране на геноми, която открива разпределени маркери за целия геном, SNP. Тези SNP, като молекулярни генетични маркери, могат да бъдат обработени за асоциирани проучвания с целеви черти. Това е рентабилна стратегия за идентифициране на сложни черти, свързани с генетичните вариации.
