Анализ на асоциацията за целия геном
Работен процес
Предимства на услугата
●Обширни записи на експертиза и публикации: С натрупания опит в GWAS, BMKGene е завършил стотици видове проекти в популационните изследвания на GWAS, подпомага изследователите да публикуват повече от 100 статии, а натрупаният фактор на въздействие достигна 500.
● Изчерпателен анализ на биоинформатиката: Workflow включва анализ на асоциацията на SNP-черти, доставящ набор от кандидат-гени и съответната им функционална анотация.
●Висококвалифициран екип за биоинформатика и кратък цикъл на анализ: С голям опит в разширения анализ на геномиката, екипът на BMKGene предоставя изчерпателни анализи с бързо време за изпълнение.
●Поддръжка след продажбата:Нашият ангажимент се простира извън завършването на проекта с 3-месечен период на обслужване след продажба. През това време ние предлагаме проследяване на проекта, помощ за отстраняване на неизправности и сесии за въпроси и отговори за справяне с всички заявки, свързани с резултатите.
Спецификации и изисквания на услугата
| Тип секвениране | Препоръчителна скала на населението | Стратегия за секвениране | Нуклеотидни изисквания |
| Цяло геномно секвениране | 200 проби | 10x | Концентрация: ≥ 1 ng/ µl Обща сума, 30ng Ограничено или без деградация или замърсяване |
| Амплифициран фрагмент от специфичен локус (SLAF) | Дълбочина на етикета: 10x Брой маркери: <400 MB: Препоръчва се WGS <1GB: 100k тагове 1GB > 2GB: 300K тагове Макс. 500K тагове | Концентрация ≥ 5 ng/µl Обща сума ≥ 80 ng Нанодроп OD260/280 = 1.6-2.5 Агарозен гел: Не или ограничено разграждане или замърсяване
|
Избор на материали
Различни сортове, подвидове, Landraces/Genebanks/Смесени семейства/Диви ресурси
Различни сортове, подвидове, ланджии
Семейство на полу-Сиб/Семейство/диви ресурси в пълен сиб
Работен поток на сервиз
Дизайн на експеримента
Доставка на проба
Екстракция на РНК
Библиотечно строителство
Секвениране
Анализ на данните
Услуги след продажба
Включва следния анализ:
- Анализ на асоциацията за целия геном: LM, LMM, Emmax, Fastlmm модел
- Функционална анотация на кандидат -гени
Анализ на асоциацията на асоциацията на SNP-Манхатън
Анализ на асоциацията на SNP-точката-QQ сюжет
Разгледайте напредъка, улеснен от услугите на BMKGene De Gwas чрез курирана колекция от публикации:
LV, L. et al. (2023) „Прозрение за генетичната основа на толерантността към амоняк в бръснача CLAM Sinonovacula constricta чрез изследване на асоциацията в целия геном“,Аквакултура, 569, с. 739351. Doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) „Мултиомически анализи на 398 присъединявания на просо Foxtail разкриват геномни региони, свързани с опитомяване, черти на метаболит и противовъзпалителни ефекти“,Молекулярно растение, 15 (8), с. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) „Картиране на асоцииране на генома, почти фенотипове в средата на суша“,Граници в растителната наука, 13, с. 924892. Doi: 10.3389/fpls.2022.924892/bibtex.
Zhao, X. et al. (2021) „GMST1, който кодира сулфотрансфераза, придава устойчивост на вируса на соя мозайка G2 и G3“,Растителни, клетъчни и околни условия, 44 (8), стр. 2777–2792. doi: 10.1111/pce.14066.
