Illumina предварително изработени библиотеки
Характеристики
●Платформи:Illumina Novaseq 6000 и Novaseq X Plus
●Режими на секвениране:PE150 и PE250
●Контрол на качеството на библиотеките преди секвениране
●Данни за секвениране QC и доставка:Доставка на QC отчет и сурови данни във формат FASTQ след Demultiplexing и филтриране Q30 Readings
Предимства на услугата
●Универсалност на услугите за секвениране:Клиентът може да избере да се последователност по лента, клетка на потока или чрез необходимите данни (частично секвениране на лентата).
●Обширен опит в платформата за секвениране на Illumina:с хиляди затворени проекти с различни видове.
●Доставка на секвениране QC доклад:С качествени показатели, точността на данните и цялостната ефективност на проекта за секвениране.
●Процес на зрели секвениране:С кратко време на завой.
●Строг контрол на качеството: Прилагаме строги изисквания на QC, за да гарантираме предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
Примерни платформи
| Платформа | Поточна клетка | Режим на секвениране | Единица | Прогнозен изход |
| Novaseq x | 10b (8 ленти) | PE150 | Единична лента Частична лента | 375GB / лента |
| 25b (8 ленти) | PE150 | Единична лента Частична лента | 1000 GB/лента | |
| Novaseq 6000 | SP поточна клетка (2 ленти) | PE250 | Поточна клетка Единична лента Частична лента | 325-400 м чете / лента |
| S4 поточна клетка (4 ленти) | PE150 | Поточна клетка Единична лента Частична лента | ~ 800 GB / лента |
Изисквания за извадка
| Сума на данните (x) | Концентрация (qPCR/nm) | Обем | |
| Частично секвениране на лентата
| X ≤ 10 gb | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 gb <x ≤ 50 gb | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 gb <x ≤ 100 gb | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 gb | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Секвенция на лентата | На лента | ≥ 1,5 nm / библиотечен пул | ≥ 25 μl / библиотечен пул |
В допълнение към концентрацията и общото количество, е необходим и подходящ пиков модел.
ЗАБЕЛЕЖКА: Секвенирането на ленти на библиотеките с ниско разнообразие изисква Phix Spike-In, за да се осигури стабилно базово повикване.
Препоръчваме да изпратите библиотеки с предварително обучени като проби. Ако се нуждаете от BMKGene за извършване на обединяване на библиотеки, моля, вижте
Библиотечните изисквания за частично секвенция на лентата.
Размер на библиотеката (пикова карта)
Основният пик трябва да бъде в рамките на 300-450 bp.
Библиотеките трябва да имат един основен пик, без замърсяване на адаптер и без димери на праймери.
Моля, свържете се с нас, ако вашите проби не отговарят на изискванията за изходни материали.
Работен процес на обслужване
Контрол на качеството на библиотеката
Секвениране
Контрол на качеството на данните
Доставка на проекта
Доклад за библиотека QC
Доклад за качеството на библиотеката е предоставен преди секвениране, оценка на количеството на библиотеката и фрагментация.
Секвениране на QC отчет
Таблица 1. Статистика за данните за секвениране.
| Идентификационен номер на пробата | BMKID | Сурови четения | Сурови данни (BP) | Чисти четения (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Фигура 1. Разпределение на качеството заедно с четения във всяка извадка
Фигура 2. Основно разпределение на съдържанието
Фигура 3. Разпределение на съдържанието на четене в данните за секвениране
