CircrNA секвениране-illumina
Характеристики
● Изчерпване на rRNA, последвано от подготовка на библиотеката на посоката, което позволява специфични за секвениране данни за секвениране.
● Биоинформатичният работен процес дава възможност за количествено определяне на прогнозирането и експресията
Предимства на услугата
●По -изчерпателни РНК библиотеки:Използваме изчерпване на rRNA вместо линейно изчерпване на РНК в нашия препарат в пребиваване, като гарантираме, че данните за секвениране включват не само circRNA, но и мРНК и lncRNA, което позволява съвместен анализ на тези набори от данни
●Незадължителен анализ на конкурентни ендогенни РНК (CERNA) мрежи: Предоставяне на по -дълбока представа за клетъчните регулаторни механизми
●Обширна експертиза: С опит в обработката на над 20 000 проби в BMKGene, обхващащи различни видове проби и LncRNA проекти, нашият екип носи богат опит на всеки проект.
●Строг контрол на качеството: Ние прилагаме основни контролни точки на всички етапи, от приготвяне и подготовка на библиотеката до секвениране и биоинформатика. Този щателен мониторинг гарантира предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
● Поддръжка след продажбата: Нашият ангажимент се простира извън завършването на проекта с 3-месечен период на обслужване след продажба. През това време ние предлагаме проследяване на проекта, помощ за отстраняване на неизправности и сесии за въпроси и отговори за справяне с всички заявки, свързани с резултатите.
Примерни изисквания и доставка
| Библиотека | Платформа | Препоръчителни данни | Данни QC |
| RRNA изчерпана насочена библиотека | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Изисквания за извадка:
Нуклеотиди:
| Конц. (Ng/μl) | Сума (μg) | Чистота | Почтеност |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограничено или никакво замърсяване на протеин или ДНК, показани на гел. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Ограничено или никакво изходно повишаване на котата |
● Растения:
Корен, стъбло или венчелистче: 450 mg
Лист или семе: 300 mg
Плод: 1,2 g
● Животни:
Сърце или черва: 450 mg
Висцера или мозък: 240 mg
Мускул: 600 mg
Кости, коса или кожа: 1.5g
● Австороди:
Насекоми: 9G
Ракообразна: 450 mg
● Пълна кръв:2 тръби
● Клетки: 106 клетки
● Серумен и плазма: 6 ml
Препоръчителна доставка на проба
Контейнер: 2 ml тръба за центрофуга (калаено фолио не се препоръчва)
Етикетиране на проби: група+реплика например A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Пратка:
1. Сух лед: Пробите трябва да бъдат опаковани в торбички и да се заровят в сух лед.
2. Rnastable епруветки: РНК пробите могат да се изсушават в тръбата за стабилизиране на РНК (напр. Rnastable®) и се доставят при стайна температура.
Работен поток на сервиз
Дизайн на експеримента
Доставка на проба
Екстракция на РНК
Библиотечно строителство
Секвениране
Анализ на данните
Услуги след продажба
Биоинформатика
Прогноза на циркна: хромозомно разпределение
Различно изразени Circrnas - сюжет в вулкана
Различно експресирани циркна - йерархично клъстериране
Функционално обогатяване на гените на гостоприемника на CircRNA
Разгледайте напредъка на изследванията, улеснени от услугите на BMKGene 'CircRNA секвениране чрез курирана колекция от публикации.
Wang, X. et al. (2021) „CPSF4 регулира образуването на циркНК и микроРНК, медиирано за генно заглушаване при хепатоцелуларен карцином“, онкоген 2021 40:25, 40 (25), стр. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) „x OO-реагиращият транскрипт разкрива ролята на кръговата RNA133 в резистентността на заболяванията чрез регулиране на експресията на Osarab в ориза“, Phytopathology Research, 5 (1), стр. 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/фигури/6.
Y, H. et al. (2023) „CPSF3 модулира баланса на кръговите и линейните стенограми при хепатоцелуларен карцином“. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) „Цялостна оценка на циркРНС при циротична кардиомиопатия преди и след чернодробна трансплантация“, Международна имунофармакология, 114, стр. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
