Невялікая РНК-паслядоўнасць-iLlumina
Рысы
● Падрыхтоўка бібліятэкі ўключае крок выбару памеру
● Біяінфарматычны аналіз, арыентаваны на прагназаванне міРНК і іх мэты
Перавагі абслугоўвання
●Комплексны аналіз біяінфарматыкі:Уключэнне ідэнтыфікацыі як вядомых, так і новых міРНК, ідэнтыфікацыі міРНК -мішэняў і адпаведнай функцыянальнай анатацыі і ўзбагачэння некалькімі базамі дадзеных (KEGG, GO)
●Строгі кантроль якасці: Мы рэалізуем асноўныя пункты кіравання на ўсіх этапах: ад падрыхтоўкі ўзору і бібліятэкі да паслядоўнасці і біяінфарматыкі. Гэты дбайны маніторынг забяспечвае дастаўку паслядоўна якасных вынікаў.
●Падтрымка пасляпродажных продажаў: Наша абавязацельства выходзіць за рамкі завяршэння праекта з 3-месячным перыядам пасля продажу. За гэты час мы прапануем наступныя дзеянні праекта, дапамогу па ліквідацыі непаладак і сесіі па пытаннях і пытаннях для вырашэння любых запытаў, звязаных з вынікамі.
●Шырокі вопыт: З дапамогай паспяховага закрыцця некалькіх праектаў SRNA, якія ахопліваюць больш за 300 відаў у розных сферах даследаванняў, наша каманда прыносіць багаты вопыт кожнаму праекту.
Патрабаванні да ўзору і дастаўка
| Бібліятэка | Платформа | Рэкамендаваныя дадзеныя | Дадзеныя QC |
| Выбраны памер | Illumina SE50 | Прачытае 10 м-20 м | Q30≥85% |
Патрабаванні да ўзору:
Нуклеатыды:
| Conce. (NG/мкл) | Колькасць (мкг) | Чысціня | Цэласнасць |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Абмежаванае альбо адсутнасць забруджвання бялку або ДНК на гелі. | Rin≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; абмежаваная альбо адсутнасць базавага ўзвышэння |
● Расліны:
Корань, сцябло або пялёстак: 450 мг
Лісток або насенне: 300 мг
Плён: 1,2 г
● жывёла:
Сэрца ці кішачнік: 450 мг
Viscera або мозг: 240 мг
Цягліца: 600 мг
Косці, валасы ці скуру: 1,5 г
● Arthropods:
Насякомыя: 9G
Ракападобныя: 450 мг
● суцэльная кроў: 2 трубы
● Клеткі: 106 клеткі
● Сыроватка і плазма:6 мл
Рэкамендуемая дастаўка ўзору
Кантэйнер: 2 мл трубкі Цэнтрафугі (бляшаная фальга не рэкамендуецца)
Узор маркіроўкі: група+рэплікацыя EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Адгрузка:
1. Сухі лёд: Узоры трэба спакаваць у мяшкі і пахаваць у сухім лёдзе.
2. RNASTABLE TUBES: Узоры РНК можна высушыць у трубцы стабілізацыі РНК (напрыклад, RNASTABLE®) і адпраўлены ў пакаёвай тэмпературы.
Працоўны паток абслугоўвання
Эксперымент у галіне дызайну
Дастаўка ўзору
Экстракцыя РНК
Будаўніцтва бібліятэкі
Паслядоўнасць
Аналіз дадзеных
Паслугі пасля продажу
Біяінфарматыка
● Сырой кантроль якасці дадзеных
● Класіфікацыя sRNA
● Выраўноўванне да эталоннага генома
● Ідэнтыфікацыя вядомай і новай міРНК
● Дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі міРНК
● Функцыянальная анатацыя міРНК
Ідэнтыфікацыя міРНК: структура і глыбіня
Дыферэнцыяльная экспрэсія міРНК - хааўтэрнатыўная кластара
Функцыянальная анатацыя мэты дыферэнцыяльна экспрэсіраваных міРНК
Вывучыце поспехі ў даследаваннях, якія садзейнічалі паслугам паслядоўнасці BMKGene, праз кураваную калекцыю публікацый.
Чэнь, Х. і інш. (2023) "Вірусныя інфекцыі інгібіруюць біясінтэз сапоніну і фотасінтэз у Panax Notoginseng", Фізіялогія раслін і біяхімія, 203, с. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Лі, Х. і інш. (2023) "Раслінны фігульны дамен, які змяшчае бялок Free1, з мікрапрацэсарнымі кампанентамі для падаўлення біягенезу miRNA", EMBO, паведамляе 24 (1). doi: 10.15252/embmit.202255037/suppl_file/emb20255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) "MicroRNA AME-BANTAM-3P кантралюе развіццё лічынак, арыентуючыся на шматлікія гены, падобныя на эпідэрмальны фактар росту, 8 генаў (MEGF8) у мядовай пчалі . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Чжан, М. і інш. (2018) "Інтэграваны аналіз міРНК і генаў, звязаных з якасцю мяса, паказвае, што GGA-MIR-140-5p ўплывае на нутрацягліцу тлушчу ў курэй", клеткавую фізіялогію і біяхімію, 46 (6), стар 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
