Цеплавая карта
Інструмент Heatmap прымае матрычны файл дадзеных у якасці ўваходных дадзеных і дазваляе карыстальнікам фільтраваць, нармалізаваць і кластэрызаваць дадзеныя. Асноўным варыянтам выкарыстання цеплавых карт з'яўляецца кластарны аналіз узроўню экспрэсіі генаў паміж рознымі ўзорамі.
Анатацыя ген
Інструмент Gene Annotation выконвае генную анатацыю на аснове супастаўлення паслядоўнасці ўваходных файлаў FASTA з рознымі базамі даных.
Асноўны інструмент лакальнага пошуку (BLAST)
Інструмент BLAST з'яўляецца інтэграванай у BMKCloud версіяй NCBI BLAST і можа выкарыстоўвацца для выканання тых жа функцый з выкарыстаннем даных, загружаных ва ўліковы запіс BMKCloud.
Прагноз CDS_UTR
Інструмент прагназавання CDS_UTR прызначаны для прагназавання кадзіруючых абласцей (CDS) і некадзіруючых абласцей (UTR) у зададзеных паслядоўнасцях транскрыптаў на аснове вынікаў BLAST у параўнанні з вядомымі базамі дадзеных бялкоў і вынікамі прагназавання ORF.
Манхэтэнскі ўчастак
Інструмент Manhattan Plot дазваляе адлюстроўваць эксперыменты з высокай выбаркай і звычайна выкарыстоўваецца ў геномных даследаваннях асацыяцый (GWAS).
Дыяграма Circos
Інструмент CIRCOS Diagram забяспечвае эфектыўную візуалізацыю таго, як геномныя прыкметы размеркаваны па геноме. Агульныя рысы ўключаюць колькасныя локусы, SNP, InDels, структурныя варыянты і колькасць копій.
Узбагачэнне геннай анталогіі (GO).
Інструмент GO Enrichment забяспечвае функцыянальны аналіз узбагачэння. Асноўным праграмным забеспячэннем у гэтым інструменце з'яўляецца пакет TopGO-Bioconductor, які ўключае дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі, аналіз ўзбагачэння GO і візуалізацыю вынікаў.
Аналіз узважанай сеткі сумеснай экспрэсіі генаў (WGCNA)
WGCNA - гэта шырока выкарыстоўваны метад здабычы дадзеных для выяўлення модуляў сумеснай экспрэсіі генаў. Гэта дастасавальна да розных набораў даных аб экспрэсіі, уключаючы даныя аб экспрэсіі генаў на мікрачыпах і NGS.
ІнтэрПраСкан
Інструмент InterProScan забяспечвае аналіз і класіфікацыю бялковых паслядоўнасцей InterPro.
Узбагачэнне GO KEGG
Інструмент узбагачэння GO KEGG прызначаны для стварэння гістаграмы ўзбагачэння GO, гістаграмы ўзбагачэння KEGG і шляху ўзбагачэння KEGG на аснове прадстаўленага набору генаў і адпаведнай анатацыі.