Прымаючы ў якасці ўваходных дадзеных секвеніраванне ізаформ Pacific Biosciences (PacBio), гэта дадатак можа ідэнтыфікаваць поўнаметражныя паслядоўнасці транскрыптаў (без зборкі). Шляхам супастаўлення поўнаметражных паслядоўнасцей з эталонным геномам можна аптымізаваць стэнаграмы з дапамогай вядомых генаў, стэнаграм, кадзіруючых абласцей і г. д. У гэтым выпадку можна дасягнуць больш дакладнай ідэнтыфікацыі структур мРНК, напрыклад, альтэрнатыўнага сплайсінгу і г. д. Сумесны аналіз з дадзенымі секвеніравання транскрыптомаў NGS забяспечвае больш поўную анатацыю і больш дакладную колькасную ацэнку экспрэсіі на ўзроўні стэнаграмы, што ў значнай ступені прыносіць карысць дыферэнцыяльнай экспрэсіі і функцыянальнаму аналізу.