На аснове ніякіх рэферэнцыяй мРНК-паслядоўнасці-NGS
Рысы
● Захоп полі мРНК перад падрыхтоўкай бібліятэкі
?
● Комплексны біяінфарматычны аналіз экспрэсіі генаў і структуры стэнаграмы
Перавагі абслугоўвання
●Шырокі вопыт: З дапамогай вынікаў апрацоўкі звыш 600 000 узораў на BMKGENE, якія ахопліваюць разнастайныя тыпы ўзораў, такія як клеткавыя культуры, тканіны і вадкасці для цела, наша каманда прыносіць багаты вопыт кожнаму праекту. Мы паспяхова закрылі больш за 100 000 мРНК-сек-праектаў у розных сферах даследаванняў.
●Строгі кантроль якасці: Мы рэалізуем асноўныя пункты кіравання на ўсіх этапах: ад падрыхтоўкі ўзору і бібліятэкі да паслядоўнасці і біяінфарматыкі. Гэты дбайны маніторынг забяспечвае дастаўку паслядоўна якасных вынікаў.
● Комплексная анатацыя: Мы выкарыстоўваем некалькі баз дадзеных для функцыянальнага анатацыі генаў, якія выражаюцца па -рознаму (DEGS) і праводзім адпаведны аналіз узбагачэння, забяспечваючы разуменне клеткавых і малекулярных працэсаў, якія ляжаць у аснове рэакцыі стэнаграмы.
●Падтрымка пасляпродажных продажаў: Наша абавязацельства выходзіць за рамкі завяршэння праекта з 3-месячным перыядам пасля продажу. За гэты час мы прапануем наступныя дзеянні праекта, дапамогу па ліквідацыі непаладак і сесіі па пытаннях і пытаннях для вырашэння любых запытаў, звязаных з вынікамі.
Патрабаванні да ўзору і дастаўка
| Бібліятэка | Стратэгія паслядоўнасці | Рэкамендаваныя дадзеныя | Кантроль якасці |
| Полі ўзбагачаны | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 ГБ | Q30≥85% |
Патрабаванні да ўзору:
Нуклеатыды:
| Conce. (NG/мкл) | Колькасць (мкг) | Чысціня | Цэласнасць |
| ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Абмежаванае альбо адсутнасць забруджвання бялку або ДНК на гелі. | Для раслін: RIN≥4,0; Для жывёл: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; абмежаваная альбо адсутнасць базавага ўзвышэння |
● Расліны:
Корань, сцябло або пялёстак: 450 мг
Лісток або насенне: 300 мг
Плён: 1,2 г
● жывёла:
Сэрца ці кішачнік: 300 мг
Viscera або мозг: 240 мг
Цягліца: 450 мг
Косці, валасы ці скуру: 1G
● Arthropods:
Насякомыя: 6G
Ракападобныя: 300 мг
● суцэльная кроў: 1 труба
● Клеткі: 106 клеткі
Рэкамендуемая дастаўка ўзору
Кантэйнер: 2 мл трубкі Цэнтрафугі (бляшаная фальга не рэкамендуецца)
Узор маркіроўкі: група+рэплікацыя EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Адгрузка:
1. Сухі лёд: Узоры трэба спакаваць у мяшкі і пахаваць у сухім лёдзе.
2. RNASTABLE TUBES: Узоры РНК можна высушыць у трубцы стабілізацыі РНК (напрыклад, RNASTABLE®) і адпраўлены ў пакаёвай тэмпературы.
Працоўны паток абслугоўвання
Эксперымент у галіне дызайну
Дастаўка ўзору
Экстракцыя РНК
Будаўніцтва бібліятэкі
Паслядоўнасць
Аналіз дадзеных
Паслугі пасля продажу
Біяінфарматыка
Стэнаграма зборкі і выбар аднастайнага
Анатацыя аднастайна
Карэляцыя ўзору і ацэнка біялагічных рэплікаў
Дыферэнцыяльна экспрэсіраваныя гены (DEGS)
Функцыянальная анатацыя DEGS
Функцыянальнае ўзбагачэнне DEGS
Вывучыце дасягненні, якія садзейнічалі паслугам паслядоўнасці эукарыётычнай мРНК BMKGENE з дапамогай куратарнай калекцыі публікацый.
Шэнь, Ф. і інш. (2020) "De Novo Transcriptome зборкі і экспрэсія генаў, прадузятага полу ў паласах сома Амура (Silurus asotus) ', Genomics, 112 (3), стар. 2603–2614. doi: 10.1016/j.ygeno.2020.01.026.
Чжан, С. і інш. (2016) "Аналіз стэнаграмы метабалізму цукрозы падчас ацёку цыбуліны і развіцця ў луку (Allium cepa L.)", Frontiers in Science Science, 7 (верасень), с. 212763. Doi: 10.3389/fpls.2016.01425/bibtex.
Чжу, С. і інш. (2017) "De novo збор, характарыстыка і анатацыя для стэнаграмы Sarcocheilichthys sinensis", Plos One, 12 (2). doi: 10.1371/journal.pone.0171966.
Зу, Л. і інш. (2021) "Аналіз стэнаграмы De Novo дае ўяўленне аб талерантнасці да солі Podocarpus macrophyllus пры стрэсе салёнасці", біялогія BMC Plant, 21 (1), стар. 1–17. doi: 10.1186/s12870-021-03274-1/лічбы/9.
