мРНК-сек (NGS) з эталонным геномам
RNA-Seq-гэта стандартны інструмент для навук пра жыццё і раслін, які пераадольвае разрыў паміж геномамі і пратэомамі. Яго сіла заключаецца ў выяўленні новых стэнаграмаў і колькаснай ацэнцы іх выражэння ў адным аналізе. Ён шырока выкарыстоўваецца для параўнальных транскрыптаматычных даследаванняў, праліваючы святло на гены, звязаныя з рознымі прыкметамі або фенатыпамі, напрыклад, параўноўваючы мутантаў з дзікімі тыпамі альбо раскрываючы экспрэсію генаў у пэўных умовах. Дадатак BMKCloud MRNA (спасылка) аб'ядноўвае колькасную ацэнку экспрэсіі, дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі (DEG), а структура паслядоўнасці аналізуе трубаправод мРНК-Seq (NGS) і аб'ядноўвае трываласць аналагічнага праграмнага забеспячэння, забяспечваючы зручнасць і зручнасць карыстальніка. Карыстальнікі могуць загружаць свае дадзеныя RNA-Seq ў воблака, дзе прыкладанне прапануе вычарпальнае, адзінае рашэнне для біяінфарматычнага аналізу. Акрамя таго, ён прыярыруе прыярытэты ў вопыце кліентаў, прапаноўваючы персаналізаваныя аперацыі з улікам канкрэтных патрэбаў карыстальнікаў. Карыстальнікі могуць усталяваць параметры і самастойна адпраўляць місію трубаправода, праверыць інтэрактыўны справаздачу, праглядаць дадзеныя/дыяграмы і поўную майнинг дадзеных, такія як: Выбар мэты генаў, функцыянальная кластара, дыяграмаванне і г.д.
Платформа:Illumina, MGI
Стратэгія:РНК-сек
Планіроўка: Парлыкі, чыстыя дадзеныя.
Тып бібліятэкі:Fr-Unstranded, Fr-Firststrand або Fr-Secondstrand
Прачытайце даўжыню:150 bp
Тып файла:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz або *.fq.gz. Сістэма будзеАўтаматычна злучыць файлы .fastq у адпаведнасці з імёнамі сваіх файлаў,EG *_1.fastq у пары з *._ 2.fastq.
Колькасць узораў:Абмежаванняў на нумар нямаузораў, але час аналізу будзе павялічвацца па меры колькасціУзоры расце.
Рэкамендуемая колькасць дадзеных:6 г на ўзор