Поўнаметражнае секвеніраванне транскрыптама на аснове нанапор
Секвеніраванне нанапораў адрозніваецца ад іншых платформаў секвеніравання тым, што нуклеатыды счытваюцца непасрэдна без сінтэзу ДНК і генеруюць доўгія счытванні з дзесяткамі кілабаз. Гэта дае магчымасць прамога счытвання поўнаметражных транскрыптаў і вырашэння праблем у транскрыптамічных даследаваннях.
√ Нізкі зрушэнне ў залежнасці ад паслядоўнасці
√ Поўнаметражнае счытванне кДНК для вывучэння структуры генаў
√ Для ахопу такой жа колькасці стэнаграм патрабуецца менш дадзеных
√ Ідэнтыфікацыя некалькіх ізаформ на ген
√ Колькасная ацэнка экспрэсіі на ўзроўні ізаформы
Тыповы канвеер біяінфарматыкі
Апошнія паспяховыя выпадкі з тэхналогіямі біямаркераў
1. Параўнальны аналіз поўнаметражных транскрыптамаў паказвае дынаміку развіцця сцябла Gnetum luofuense
Часопіс: Frontiers in Genetics
Апублікавана: сакавік 2021 г
Ключавыя словы: MinION | Альтэрнатыўнае зрошчванне | АПА | lncRNA | Дыферэнцыяльна выяўленыя транскрыпты
Чытаць поўны тэкст
2. Аднанакіраваны рух малых РНК ад уцёкаў да каранёў у міжвідавых гетеротрансплантатах
Часопіс: Прырода раслін
Апублікавана: студзень 2021 г
Ключавыя словы: Nanopore | Ілюміна | поўнаметражнае выяўленне мабільнай мРНК
3. Поўнаметражны аналіз транскрыптаў каранёў спаржы паказвае малекулярны механізм солевынослівасці, выкліканы арбускулярнымі мікарызнымі грыбамі
Часопіс: Экалагічная і эксперыментальная батаніка
Апублікавана: студзень 2021 г
Ключавыя словы: MinION | Дыферэнцыяльна выяўленыя стэнаграмы | Фактары транскрыпцыі | Альтэрнатыўнае зрошчванне
4. Змены фізіялагічных характарыстык і поўнаметражная транскрыптома каранёў і лісця ружы (Rosa chinensis) у адказ на стрэс ад засухі
Часопіс: Фізіялогія раслін і клетак
Апублікавана: кастрычнік 2020 г
Ключавыя словы: PromethION | Дыферэнцыяльна выяўленыя стэнаграмы | Функцыянальнае прагназаванне | Зрошчаныя ізаформы | TF і lncRNA
5. Аналіз і поўнае параўнанне PacBio і секвенирования РНК на аснове нанапор транскрыптому Arabidopsis
Часопіс: раслінны метад
Апублікавана: красавік 2020 г
Ключавыя словы: GridION | PromethION | Працяг PacBio | Illumina NovaSeq | Выраўноўванне геному | Ідэнтыфікацыя стэнаграмы | Альтэрнатыўнае зрошчванне | ССР | LncRNA | Колькаснае вызначэнне ізаформы
Навіны і асноўныя моманты накіравана на абмен апошнімі паспяховымі кейсамі з Biomarker Technologies, фіксаванне новых навуковых дасягненняў, а таксама вядомых метадаў, якія прымяняюцца падчас даследавання.
Час публікацыі: 8 студзеня 2022 г