Геном
Храмасома зборкі і аналіз генома біямасы Miscanthus lutarioriparius
Паслядоўнасць нанапор | Illumina | Прывітанне-C | РНК-паслядоўнасць | Філагенія
У гэтым даследаванні тэхналогіі BioMarker забяспечылі тэхнічную падтрымку ў паслядоўнасці нанапор, зборку генома De Novo, зборкі HI-C і г.д.
Урывак
Missanthus, Рызаматозная шматгадовая расліна, мае вялікі патэнцыял для вытворчасці біяэнергетыкі для высокай біямасы і талерантнасці да стрэсу. Мы паведамляем пра зборку храмасомMiscanthus lutarioripariusГеном, спалучаючы Oxford Nanopore Sequenation і HI-C Technologies. Збор 2,07-ГБ ахоплівае 96,64% генома, з Contig N50 1,71 МБ. Паслядоўнасці цэнтрамера і тэламера збіраюцца для ўсіх 19 храмасом і храмасомы 10 адпаведна. Аллатраплоіднае паходжанне M. lutarioriparius канфіксавана пры дапамозе цэнтрамерных спадарожнікавых паўтораў. Наглядна прадэманстраваны структура генома тэтраплоіднага генома і некалькі храмасомных перабудовы адносна сорга. Тандэм дублікат генаўМ. Лутарарыпарыяфункцыянальныя ўзбагачаюцца не толькі ў плане, звязанай з рэакцыяй на стрэс, але і біясінтэзу клеткавай сценкі. Сямействы генаў, звязаныя з устойлівасцю да захворвання, біясінтэзам клеткавай сценкі і транспартам іёнаў металаў, значна пашыраюцца і развіваюцца. Пашырэнне гэтых сем'яў можа стаць важнай геномнай асновай для ўзмацнення выдатных рысаўМ. Лутарарыпарыя.
Асноўная статыстыка зборкі генома
Фігура. Агляд зборкі генома M. lutarioriparius
Навіны і асноўныя моманты Мэта падзяліцца найноўшымі паспяховымі выпадкамі з тэхналогіямі Biomarker, фіксуючы новыя навуковыя дасягненні, а таксама выбітныя метады, якія прымяняюцца падчас даследавання.
Час паведамлення: студзень-05-2022