мРНК-seq (NGS) – De novo

Секвенирование мРНК дазваляе прафіляваць усе стэнаграмы мРНК у клетках у пэўных умовах і з'яўляецца шырока выкарыстоўванай тэхналогіяй у розных галінах даследаванняў. Канвеер BMKCloud De novo mRNA-seq прызначаны для аналізу бібліятэк секвенирования, узбагачаных полі-А, калі эталонны геном недаступны. Канвеер пачынаецца з кантролю якасці, а затымнановазборка стэнаграмы і выбар набору unigene. Аналіз структуры unigene прадказвае паслядоўнасць кадавання (CDS) і простыя паўторы паслядоўнасці (SSR). Пасля дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі знаходзіць гены з дыферэнцыяльнай экспрэсіяй (DEG) сярод правераных умоў з наступнай функцыянальнай анатацыяй і ўзбагачэннем DEG для атрымання біялагічнай інфармацыі.