BMKCloud Увайсці

Гнуткія прыкладанні для аналізу

wps_doc_5

Аналіз эукарыётычнага мРНК (даступныя на аснове даведкі і De Novo)

Гэты трубаправод выкарыстоўвае дадзеныя NGS RNA-Seq ў якасці ўводу і дае вынікі некалькіх аналізаў уніз па плыні, уключаючы, але не абмяжоўваючыся імі: паслядоўнасць ацэнкі якасці дадзеных,дэ НоваАнатацыя сайта транскрыпцыі, аналіз зменнай сплайсінгу, дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі, анатацыю функцыі і аналіз узбагачэння.

Доўгі аналіз РНК-кадавання

Доўгія некадзіравальныя РНК (LNCRNA)-гэта нерадучыя стэнаграмы з даўжынёй больш за 200 нс і, як вядома, гуляюць ролі ў арганізацыі і рэгуляванні храмаціну. Тэхналогіі паслядоўнасці высокай прапускной здольнасці і біяінфарматычна даюць магчымасць нашым разуменнем паслядоўнасцей lncRNA і інфармацыяй аб пазіцыянаванні для выяўлення lnCRNA з найважнейшымі функцыямі рэгулявання. Гэты трубаправод забяспечвае аналіз lncRNA ў дадатак да аналізаў, згаданых у эукарыётычным аналізе мРНК.

 

wps_doc_6
wps_doc_7

16S/18S/яго паслядоўнасць амплікона

Аналіз мікробнага аналізу мікробнай разнастайнасці Amplicon быў распрацаваны на аснове шматгадовага вопыту ў аналізе праектаў мікробнай разнастайнасці. Трубаправод змяшчае стандартызаваны асноўны аналіз, які ахоплівае змест асноўнага аналізу ў сучасных мікробных даследаваннях і персаналізаванага аналізу. Справаздача аб аналізе багаты і вычарпальны, з магчымасцю правесці разнастайны асабісты аналіз. Акрамя таго, узоры і групы могуць быць зменены на хаду для дадатковай налады і кіравання.

Аналіз метагеномікі стрэльбы

Метагенамічны аналіз стрэльбы выкарыстоўвае дадзеныя NGS з змешаных геномных матэрыялаў, вынятых з узораў навакольнага асяроддзя. Уключаны аналізы, якія даюць падрабязную інфармацыю пра разнастайнасць відаў і багацце, структуру папуляцыі, філагенетычную сувязь, функцыянальныя гены і карэляцыйныя сеткі з фактарамі навакольнага асяроддзя.

wps_doc_8
wps_doc_9

Варыянтны аналіз NGS-WGS

Варыянтны аналіз NGS-WGS-гэта інтэграваны варыянт выяўлення трубаправода, які выконвае кантроль якасці дадзеных, выраўноўванне паслядоўнасці, анатацыю і аналіз мутацыі генаў. Трубаправод вынікае з лепшых практык GATK для выяўлення SNP і Indel і выкарыстоўвае MANTA для выкліку структурнага варыянту.

Даследаванне шырокай асацыяцыі генома (GWAS)

Pipeline GWAS - гэта аналіз уніз па плыні, які займае раней генеруемыя файлы VCF і адпаведныя дадзеныя фенатыпу для кагорты асоб у якасці ўваходу. Выкарыстоўваючы канкрэтныя статыстычныя метадалогіі, GWAS імкнецца раскрыць варыянты нуклеатыдаў у цэлым геноме, карэляваныя з фенатыпічнымі адрозненнямі. Ён гуляе вырашальную ролю ў вывучэнні функцыянальных генаў, звязаных са складанымі захворваннямі чалавека і складанымі рысамі ў раслінах і жывёл.

wps_doc_10
wps_doc_11

Аналіз масавай сегрэгацыі (BSA)

Аналіз BSA прадугледжвае аб'яднанне людзей з экстрэмальнымі фенатыпічнымі рысамі ад падзеленага насельніцтва. Параўноўваючы дыферэнцыяльныя локусы паміж аб'яднанымі ўзорамі, гэты падыход хутка вызначае цесна звязаныя малекулярныя маркеры, звязаныя з мэтавымі генамі. Шырока выкарыстоўваецца ў генетычным адлюстраванні раслін і жывёл, гэта каштоўны інструмент для развядзення, пры дапамозе маркера.

Эвалюцыйны аналіз генетыкі

Эвалюцыйны аналіз генетыкі працоўнага працэсу выкарыстоўвае шырокі вопыт BMKGene ў праектах генетычнай эвалюцыі і ўключае ў сябе філагенетычнае канструкцыю дрэва, аналіз нераўнаважнай сувязі, ацэнку генетычнай разнастайнасці, селектыўную ідэнтыфікацыю разбору, аналіз сваяцтва, аналіз асноўных кампанентаў і характарыстыку структуры папуляцыі.

wps_doc_12

Атрымайце цытату

Напішыце сваё паведамленне тут і адпраўце яго нам

Дашліце нам сваё паведамленне: