Гатовыя бібліятэкі Illumina
Асаблівасці
●платформы:Illumina NovaSeq 6000 і NovaSeq X Plus
●Рэжымы паслядоўнасці:PE150 і PE250
●Кантроль якасці бібліятэк перад секвенированием
●КК і дастаўка дадзеных секвенирования:дастаўка справаздачы аб кантролі якасці і неапрацаваных даных у фармаце fastq пасля дэмультыплексавання і фільтрацыі чытанняў Q30
Перавагі абслугоўвання
●Універсальнасць паслуг секвенирования:кліент можа выбраць паслядоўнасць па паласе, праточнай ячэйцы або па колькасці неабходных даных (частковае секвеніраванне паласы).
●Шырокі досвед працы з платформай секвенирования Illumina:з тысячамі закрытых праектаў з рознымі відамі.
●Дастаўка справаздачы аб секвенировании КК:з паказчыкамі якасці, дакладнасцю даных і агульнай прадукцыйнасцю праекта секвенирования.
●Спелы працэс секвенирования:з кароткім часам апрацоўкі.
●Строгі кантроль якасці: мы выконваем строгія патрабаванні кантролю якасці, каб гарантаваць нязменна высокую якасць вынікаў.
Прыклады платформ
| Платформа | Праточная ячэйка | Рэжым паслядоўнасці | Адзінка | Разліковы выхад |
| NovaSeq X | 10Б (8 палос) | PE150 | Адзіны зав Частковы зав | 375 Гб / пер |
| 25Б (8 палос) | PE150 | Адзіны зав Частковы зав | 1000 Гб/зав | |
| NovaSeq 6000 | Ячэйка SP Flow (2 паласы) | PE250 | Праточная ячэйка Адзіны зав Частковы зав | 325-400 М чытае / пер |
| Праточная ячэйка S4 (4 паласы) | PE150 | Праточная ячэйка Адзіны зав Частковы зав | ~800 Гб / пер |
Узоры патрабаванняў
| Аб'ём дадзеных (X) | Канцэнтрацыя (кПЦР/нМ) | Аб'ём | |
| Частковая паслядоўнасць палос
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 25 мкл | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 25 мкл | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 25 мкл | |
| Паслядоўнасць палос | За завулак | ≥ 1,5 нМ / Бібліятэчны пул | ≥ 25 мкл / Бібліятэчны пул |
У дадатак да канцэнтрацыі і агульнай колькасці таксама патрабуецца адпаведная мадэль пікаў.
Заўвага: паслядоўнасць палос у бібліятэках з нізкім узроўнем разнастайнасці патрабуе ўключэння PhiX для забеспячэння надзейнага базавага выкліку.
Мы рэкамендуем адпраўляць папярэдне аб'яднаныя бібліятэкі ў якасці ўзораў. Калі вам патрабуецца BMKGENE для аб'яднання бібліятэк, звярніцеся да
патрабаванні бібліятэкі да частковай паслядоўнасці палос.
Памер бібліятэкі (карта пікаў)
Асноўны пік павінен знаходзіцца ў межах 300-450 п.н.
Бібліятэкі павінны мець адзіны галоўны пік, адсутнасць забруджвання адаптара і дымераў праймера.
Калі ласка, звяжыцеся з намі, калі вашы ўзоры не адпавядаюць патрабаванням да зыходнага матэрыялу.
Працэс абслугоўвання
Кантроль якасці бібліятэкі
Секвеніраванне
Кантроль якасці дадзеных
Здача праекта
Справаздача аб кантролі якасці бібліятэкі
Справаздача аб якасці бібліятэкі прадастаўляецца перад секвенаваннем, ацэнкай колькасці бібліятэкі і фрагментацыяй.
Справаздача аб секвенировании кантролю якасці
Табліца 1. Статыстыка па дадзеных секвенирования.
| Узор ID | БМКІД | Сырое чытанне | Неапрацаваныя даныя (bp) | Чыстае чытанне (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | БМК_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | БМК_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Малюнак 1. Размеркаванне якасці па чытаннях у кожным узоры
Малюнак 2. Базавае размеркаванне кантэнту
Малюнак 3. Размеркаванне прачытанага змесціва ў дадзеных паслядоўнасці
