Exclusive Agency for Korea

条形банер-03

прадукты

Зборка бактэрыяльнага геному De Novo

图片49

 

 

Мы прапануем поўную паслугу зборкі геному бактэрый, гарантуючы 0 прабелаў. Гэта магчыма шляхам інтэграцыі тэхналогій секвеніравання доўгага чытання, такіх як Nanopore і PacBio для зборкі, і паслядоўнасці кароткага чытання з Illumina для праверкі зборкі і выпраўлення памылак чытання ONT. Наш сэрвіс забяспечвае поўны біяінфарматычны працоўны працэс ад зборкі, функцыянальнай анатацыі і пашыранага біяінфарматычнага аналізу, выконваючы канкрэтныя даследчыя мэты. Гэтая паслуга дазваляе распрацоўваць дакладныя эталонныя геномы для розных генетычных і геномных даследаванняў. Акрамя таго, гэта з'яўляецца асновай для такіх прыкладанняў, як аптымізацыя штамаў, генная інжынерыя і распрацоўка мікробных тэхналогій, забяспечваючы надзейныя геномныя дадзеныя без прабелаў, важныя для прасоўвання навуковых ідэй і біятэхналагічных інавацый.


Падрабязнасці абслугоўвання

Біяінфарматыка

Дэманстрацыйныя вынікі

Выбраныя публікацыі

Асаблівасці абслугоўвання

● З двума магчымымі варыянтамі на выбар у залежнасці ад жаданай ступені паўнаты геному.

● Варыянт чарнавога геному: секвеніраванне кароткага чытання з дапамогай Illumina NovaSeq PE150.

● Поўны геном 0 прабелаў.

● Секвеніраванне доўгага чытання на Nanopore PromethION 48 або PacBio Revio для зборкі геному.

● Секвеніраванне кароткага чытання на Illumina NovaSeq для праверкі геному і выпраўлення памылак (Nanopore) або для стварэння чарнавога геному.

Перавагі абслугоўвання

Гарантаваны геном з нулявым разрывам: Гэта звязана з інтэграцыяй секвенирования Illumina з секвенированием працяглага чытання (Nanopore або PacBio).

Поўны працоўны працэс біяінфарматыкі:Гэта ўключае ў сябе зборку геному і прагназаванне некалькіх геномных элементаў, функцыянальную анатацыю гена і візуалізацыю геному, напрыклад, графік Circos.

Шырокі вопыт: З больш чым 20 000 мікробных геномаў сабраны BMKGENE прыносіць больш чым дзесяцігадовы вопыт, высокакваліфікаваную групу аналізаў, поўны кантэнт і выдатную падтрымку пасля продажу.

Пасляпродажная падтрымка:Нашы абавязацельствы распаўсюджваюцца не толькі на завяршэнне праекта з 3-месячным перыядам пасляпродажнага абслугоўвання. У гэты час мы прапануем назіранне за праектам, дапамогу ў ліквідацыі непаладак і сеансы пытанняў і адказаў для адказу на любыя пытанні, звязаныя з вынікамі.

Даступна некалькі стратэгій паслядоўнасці:Для розных даследчых мэтаў і патрабаванняў паўнаты геному.

 

Спецыфікацыі абслугоўвання

Абслугоўванне

Стратэгія паслядоўнасці

Чарнавік геному

Illumina PE150 100x

0 Gap Genome

Nanopore 100x + Illumina PE150 100x

Or

Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (дадаткова)

Узоры патрабаванняў:

 

Канцэнтрацыя (нг/мкл)

Агульная колькасць (мкг)

Аб'ём (мкл)

OD260/280

OD260/230

PacBio

≥20

≥1,2

≥20

1,7-2,2

≥1,0

Нанапор

≥40

≥2

≥20

1,7-2,2

1,0-3,0

Ілюміна

≥1

≥0,06

≥20

-

-

· Бактэрыі: ≥3,5x1010 вочак

Працэдура абслугоўвання

дастаўка ўзораў

Дастаўка ўзору

Падрыхтоўка бібліятэкі

Будаўніцтва бібліятэкі

Секвеніраванне

Секвеніраванне

Аналіз дадзеных

Аналіз дадзеных

Паслугі пасля продажу

Пасляпродажнае абслугоўванне


  • Папярэдняя:
  • далей:

  • 23.11.7-01

    Уключае ў сябе наступны аналіз:

    ● Кантроль якасці дадзеных паслядоўнасці

    ● Зборка геному

    ● Аналіз кампанентаў геному: Прагназаванне CDS і некалькіх геномных элементаў

    ● Функцыянальная анатацыя з мноствам агульных баз даных (GO, KEGG і г.д.) і пашыраных баз даных (CARD, VFDB і г.д.)

    ● Візуалізацыя геному

    Мы прапануем геном у лёгкадаступным фармаце Fasta і файл анатацый геному (gff).

    Анатацыя гена – GO

    图片50Анатацыя гена - вугляводы CAZY

    Лінія 51

     

    Візуалізацыя геному - сюжэт Circos

     

    Фота 52 

     

    Даследуйце дасягненні, якім спрыяюць паслугі па зборцы бактэрыяльнага геному BMKGene праз падабраную калекцыю публікацый.

     

    Дай, В. і інш. (2023) «Адкрыццё Bacteroides uniformis F18-22 як бяспечнай і новай прабіётычнай бактэрыі для лячэння язвавага каліту са здаровай тоўстай кішкі чалавека»,Міжнародны часопіс малекулярных навук, 24(19), с. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.

    Кан, К. і інш. (2021) «Множаўстойлівыя ізаляты Proteus mirabilis з blaOXA-1 і blaNDM-1 з дзікай прыроды ў Кітаі: павялічваецца рызыка для здароўя насельніцтва»,Інтэгратыўная заалогія, 16 (6), стар. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.

    Wang, TT і інш. (2017) «Поўная паслядоўнасць генома эндафіта Bacillus flexus KLBMP 4941 раскрывае яго механізм стымулявання росту раслін і генетычную аснову солевыстойлівасці»,Біятэхналагічны часопіс, 260, стар. 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.

    Ван, X. і інш. (2021) «Плазміды клебсіелы, устойлівыя да множных рэпліконаў, забяспечваюць шырокае распаўсюджванне антымікробных генаў»,Межы ў мікрабіялогіі, 12, с. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.

    атрымаць цытату

    Напішыце тут сваё паведамленне і адпраўце яго нам

    Адпраўце нам паведамленне: