Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Məhsul

Xüsusi lokus gücləndirilmiş fraqment ardıcıllığı (SLAF-SEQ)

Xüsusilə geniş miqyaslı populyasiyalarda, geniş miqyaslı populyasiyalarda olan yüksək ötürmə gentiping, genetik birləşmələrdə əsas addımdır və dərin bir genome yenidən ardıcıllığı yerinə funkvayial analiz və s. Üçün bir genetik zəmin təmin edir,Azaldılmış nümayəndəliyi Genome Sequencing (RRGS)Genetik marker kəşfində ağlabatan səmərəliliyi qoruyarkən nümunə başına ardıcıllıqla xərci minimuma endirmək üçün tez-tez bu araşdırmalarda işləyir. RRGS bunu məhdudlaşdırma fermentləri ilə həzm etmək və müəyyən bir fraqment ölçüsü aralığına yönəldərək, bununla da genomun yalnız bir hissəsini ardıcıllıqla əldə etməklə buna nail olur. Müxtəlif RRGS metodologiyaları arasında, xüsusi lokus gücləndirilmiş fraqment ardıcıllığı (SLAF) özelleştirilebilir və yüksək keyfiyyətli bir yanaşmadir. BMKgene tərəfindən müstəqil olaraq hazırlanmış bu metod, hər layihə üçün məhdudiyyət fermentini optimallaşdırır. Bu, mənfi bölgələrdə səmərəli şəkildə yayılmış, beləliklə, təkrarlanan bölgələrin qarşısını alarkən geniş yayılmış slaf etiketinin (400-500 BPS rayonunun yaranmasının nəslini, bunun üçün ən yaxşı genetik markerin kəşfini təmin edir.


Xidmət haqqında məlumat

Bioinformatika

Demo nəticələri

Xüsusi nəşrlər

İş axını

图片 31

Texniki sxem

企业微信截图 _173710444436345

Xidmət xüsusiyyətləri

● PE150 ilə Novaseq-da ardıcıllıqla.

● 1000-dən çox nümunənin hovuzuna imkan verən ikiqat barkodla kitabxana hazırlığı.

● Bu texnika, hər bir iş üçün fərqli bioinformatik boru kəmərləri ilə bir istinad genomu ilə və ya olmadan istifadə edilə bilər:

İstinad Genome: SNP və Indel kəşfi

İstinadsız Genome: Nümunə çoxluq və SNP kəşf

● içindəSilicodaƏvvəlcədən dizaynlı mərhələ Birdən çox məhdudiyyət fermenti birləşmələri Genom boyunca SLAF etiketlərinin vahid paylamasını yaratmaq üçün ekranlaşdırılmışdır.

● Əvvəlcədən eksperiment zamanı 9 SAF kitabxanası yaratmaq üçün 3 nümunədə üç ferment birləşməsi sınaqdan keçirilir və bu məlumat layihə üçün optimal məhdudiyyət fermentinin birləşməsini seçmək üçün istifadə olunur.

Xidmət üstünlükləri

Yüksək genetik marker kəşfi: Yüksək ötürücülü ikiqat barkod sisteminin birləşdirilməsi, böyük populyasiyaların eyni vaxtda ardıcıllığına imkan verir və lokus xüsusi gücləndirmə səmərəliliyi artırır, etiket nömrələrinin müxtəlif tədqiqat suallarının müxtəlif tələblərinə cavab verməsini təmin edir.

 Genomdan aşağı asılılıq: İstinad genomu ilə və ya olmadan növlərə tətbiq edilə bilər.

Çevik sxem dizaynı: Tək ferment, ikiqat ferment, çox ferment həzm və müxtəlif növ fermentlər, müxtəlif tədqiqat məqsədləri və ya növlərə uyğun olmaq üçün seçilə bilər. BuSilicodaƏvvəlcədən dizayn, optimal ferment dizaynını təmin etmək üçün aparılır.

 Enzymatik həzmdə yüksək səmərəlilik: Birinin keçirilməsiSilicodaƏvvəlcədən hazırlıq və bir təcrübə əvvəlcədən bir təcrübə, xromosome (1 slaf etiketi / 4kb) və təkrarlanan ardıcıllıqla (<5%) -i azalmışdır.

Geniş ekspertizası: Komandamız hər bir layihəyə, hər layihəyə, yüzlərlə növdə 5000-dən çox SLAF-SEQ layihələrinin, o cümlədən bitkilər, məməlilər, quşlar, böcəklər və su orqanizmləri ilə bir track rekordu.

 Öz-özünə inkişaf etmiş bioinformatik iş axını: BMKGene, son çıxışın etibarlılığını və dəqiqliyini təmin etmək üçün SLAF-SEQ üçün inteqrasiya olunmuş bioinformatik bir iş axını hazırladı.

 

Xidmət xüsusiyyətləri

 

Analiz növü

Tövsiyə olunan əhali miqyası

Ardıcıllıq strategiyası

Etiket ardıcıllığının dərinliyi

TAM nömrəsi

Genetik xəritələr

2 valideyn və> 150 nəsil

Valideynlər: 20x WGS

Offsping: 10x

Genom ölçüsü:

<400 MB: WGS tövsiyə olunur

<1GB: 100k etiketlər

1-2GB :: 200k etiketlər

> 2GB: 300K Tags

Max 500k etiketi

Genom Geniş Birliyi Tədqiqatları (Gwas)

≥200 nümunələr

10x

Genetik təkamül

≥30 nümunələr, hər alt qrupdan 10 nümunə

10x

Xidmət tələbləri

Konsentrasiyası ≥ 5 ng / μl

Ümumi məbləğ ≥ 80 ng

Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5

Agarose Geli: Yoxdur və ya məhdud bir deqradasiya və ya çirklənmə

Tövsiyə olunan nümunə çatdırılma

Konteyner: 2 ml sentrifug boru

(Nümunələrin əksəriyyəti üçün etanolda qorumağı məsləhət görürük)

Nümunə etiketlənməsi: Nümunələr dəqiq etiketli və təqdim olunan nümunə məlumat forması ilə eyni olmalıdır.

Göndərmə: Quru buz: nümunələr əvvəlcə çantalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.

Xidmət iş axını

Nümunə qc
Pilot təcrübə
Slaf təcrübəsi
Kitabxana hazırlığı
Ardıcıllıq
Məlumat təhlili
Satılır Xidmətlərdən sonra

Nümunə qc

Pilot təcrübə

Slaf-təcrübə

Kitabxana hazırlığı

Ardıcıllıq

Məlumat təhlili

Satış sonrası xidmətlər


  • Əvvəlki:
  • Sonrakı:

  • 图片 32Aşağıdakı analiz daxildir:

    • Sequcaping Məlumat QC
    • SLAF Etiketi İnkişafı

    Genome istinad üçün xəritəçəkmə

    İstinad olmadan Genom: Çoxluq

    • Slaf Tags təhlili.: Statistika, Genom boyunca paylama
    • Marker Kəşf: SNP, Indel, SNV, CV Zəng və Annotasiya

    Xromosomlarda SLAF etiketlərinin paylanması:

     图片 33

     

    CHROMOSOMES-də SNP-lərin paylanması:

     图片 34Snp annotasiyası

    图片 35

     

    İl

    Jurnal

    IF

    Başlıq

    Proqramlar

    2022

    Təbiət rabitəsi

    17.694

    Giga-xromosomların və ağac pionlarının gənamının genomik əsasları

    Paeonia Ostii

    Slaf-gwas

    2015-ci il

    Yeni fitoloq

    7.433

    Evlilik Ayaq izləri Aqronomik bölgələrində genomik bölgələrdə

    soyuanlar

    Slaf-gwas

    2022

    İnkişaf etmiş tədqiqat jurnalı

    12.822

    Gossypium Barbadense Genome geniş süni intoqrasiya G. Hirsutum

    Pambıq lifinin keyfiyyətinin və məhsulunun eyni vaxtda yaxşılaşdırılması üçün üstün loci aşkar edin

    əlamət

    Slaf-Təkamül Genetikası

    2019-cu il

    Molekulyar bitki

    10.81

    Əhali Genomik Təhlili və De Novo Assambleyası Alaq otunun mənşəyini ortaya qoyur

    Təkamül oyunu kimi düyü

    Slaf-Təkamül Genetikası

    2019-cu il

    Təbiət Genetikası

    31.616

    Ümumi sazanın genom ardıcıllığı və genetik müxtəlifliyi, Kiprinus carpio

    Slaf-bağlantı xəritəsi

    2014-cü il

    Təbiət Genetikası

    25.4555

    Əkin edilmiş fıstıq genomu, paxlalı karyotiplər, populyasiya ilə bağlı fikir verir

    Təkamül və Bitki evlənməsi.

    Slaf-bağlantı xəritəsi

    2022

    Bitki biotexnologiya jurnalı

    9.803

    ST1-nin müəyyənləşdirilməsi toxum morfologiyasının hitchhiking ilə əlaqəli bir seçimi aşkar edir

    və soya evlənməsi zamanı yağ tərkibi

    Slaf-markerin inkişafı

    2022

    Beynəlxalq Molekulyar Elmlər Jurnalı

    6.208

    Bir buğda-leysmus mollis 2n (2d) üçün identifikasiya və DNT markerinin inkişafı

    Disomik xromosom əvəz

    Slaf-markerin inkişafı

     

    İl

    Jurnal

    IF

    Başlıq

    Proqramlar

    2023

    Bitki Elmində Sərhədlər

    6.735

    QTL Xəritəçəkmə və Pyrus pyrifoliyasının meyvə yetişməsi zamanı şəkərin məzmununu transcripte analizi

    Genetik xəritə

    2022

    Bitki biotexnologiya jurnalı

    8.154

    ST1-nin müəyyənləşdirilməsi Soya Limeyi zamanı toxum morfologiyasının və neft tərkibinin hitchhiking ilə əlaqəli bir seçimi aşkar edir

     

    Snp çağırır

    2022

    Bitki Elmində Sərhədlər

    6.623

    Genom geniş bir dərnək quraqlıq mühitində tutmayan çətinliklə çətinliklə fenotiplərin xəritələşdirilməsi.

     

    Güveç

    sitat gətirmək

    Mesajınızı buraya yazın və bizə göndərin

    Mesajınızı bizə göndərin: