İstilik xəritəsi
HeatMap vasitəsi, giriş kimi bir matris məlumat faylını qəbul edir və istifadəçilərə süzgəcdən, normallaşdırmağa və çoxluq məlumatlarına imkan verir. HeatMaps üçün əsas istifadə işi müxtəlif nümunələr arasında gen ifadəsinin səviyyəsinin çoxluq təhlilidir.
Gen annotasiyası
Gen Annotasiya Aləti, Giriş Fasta fayllarının ardıcıllıqla uyğunlaşdırılması üçün müxtəlif verilənlər bazasına aid olan gen annotasiyasını həyata keçirir.
Əsas yerli hizalanma axtarış vasitəsi (partlayış)
Blast Tool, NCBI partlayışının BMKCloud inteqrasiya versiyasıdır və BMKCloud hesabına yüklənmiş məlumatlardan istifadə edərək eyni funksiyaları yerinə yetirmək üçün istifadə edilə bilər.
CDS_utr proqnozu
CDS_utr proqnozlaşdırma vasitəsi, kodlaşdırma bölgələrini (CD) və kodlama bölgələri (UTR), məlum protein verilənlər bazalarına və orf proqnozu nəticələrinə qarşı partlayış nəticələrinə əsaslanan transkript ardıcıllığında (UTR) proqnozlaşdırılması üçün hazırlanmışdır.
Manhettenin hiyləsi
Manhetten süjet aləti yüksək nümunə təcrübələrin nümayiş etdirilməsinə imkan verir və ümumiyyətlə Genom-Geniş Assosiasiyasında (GWAS) istifadə olunur.
Circos diaqramı
Circos Diaqram Aləti genome boyunca genom xüsusiyyətlərin necə paylandığını səmərəli vizual olaraq təmin edir. Ümumi xüsusiyyətlərə kəmiyyət loci, snps, indellər, struktur və surət nömrəsi variantları daxildir.
Gen ontologiyası (gedin) zənginləşdirilməsi
Go zənginləşdirmə vasitəsi funksional zənginləşdirmə təhlili təmin edir. Bu vasitədə əsas proqram, diferensial ifadə təhlili, zənginləşdirmə təhlili və nəticələrin görüntüləməsi olan topgo-biokonducktor paketidir.
Ağır Gene Birliyi Şəbəkə Təhlili (WGCNA)
WGCNA, Gene-nin ifadə modullarını tapmaq üçün geniş istifadə olunan bir məlumat mədən metodudur. Microarray və NGS Gene ifadəsi daxil olmaqla müxtəlif ifadə məlumat bazası üçün tətbiq olunur.
Təfsirçi
Tərcüməçi vasitəsi tərcüməçi protein ardıcıllığı təhlili və təsnifatı təqdim edir.
Go Kegg zənginləşdirmə
Go Kegg zənginləşdirmə vasitəsi, bir Gene zənginləşdirmə histogramı, kegg zənginləşdirmə histogramı və kegg zənginləşdirmə yolları və müvafiq annotasiyaya əsaslanaraq Kegg zənginləşdirmə yolu yaratmaq üçün dizayndır.